SCAND1 - SCAND1

SCAND1
Идентификаторы
Псевдонимы	SCAND1, RAZ1, SDP1, SCAN домен, содержащий 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 610416 MGI: 1343132 ГомолоГен: 10642 Генные карты: SCAND1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20q11.23 Начните 35,953,617 бп[1] Конец 35,959,472 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 H1 Начните 156,311,846 бп[2] Конец 156,312,747 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками • Связывание ДНК Сотовый компонент • ядро клетки Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • позитивная регуляция транскрипции, основанной на нуклеиновых кислотах Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51282	19018
Ансамбль	ENSG00000171222	ENSMUSG00000046229
UniProt	P57086	Q2M4I6
RefSeq (мРНК)	NM_033630 NM_016558	NM_020255
RefSeq (белок)	NP_057642 NP_361012	NP_064651
Расположение (UCSC)	Chr 20: 35.95 - 35.96 Мб	Chr 2: 156.31 - 156.31 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

SCAN-домен, содержащий белок 1 это белок что у людей кодируется SCAND1 ген.^[5][6][7][8]

Функция

Домен SCAN представляет собой высококонсервативный, богатый лейцином мотив, состоящий примерно из 60 аминокислот, первоначально обнаруженный в подсемействе белков цинкового пальца. Этот ген принадлежит к семейству генов, которые кодируют изолированный домен SCAN, но не содержат мотив цинкового пальца. Функциональные исследования установили, что SCAN-бокс представляет собой домен взаимодействия с белками, который опосредует как гетеро-, так и гомопротеиновые ассоциации, и, возможно, участвует в регуляции транскрипционной активности. Для этого гена описаны два варианта транскрипта с разными 5'-UTR, но кодирующие один и тот же белок.^[8]

Взаимодействия

SCAND1 был показан взаимодействовать с MZF1.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000171222 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000046229 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Сандер Т.Л., Хаас А.Л., Петерсон М.Дж., Моррис Дж.Ф. (апрель 2000 г.). «Идентификация нового белка, связанного с SCAN-боксом, который взаимодействует с MZF1B. SCAN-бокс, богатый лейцином, опосредует гетеро- и гомопротеиновые ассоциации». Журнал биологической химии. 275 (17): 12857–67. Дои:10.1074 / jbc.275.17.12857. PMID  10777584.
6. Шумахер К., Ван Х., Хонер С., Динг В., Коэн Дж., Лоуренс К., Кулис С.М., Ван Л.Л., Баллингер Д., Боуэн Б.Р., Вагнер С. (июнь 2000 г.). «Домен SCAN опосредует селективную олигомеризацию». Журнал биологической химии. 275 (22): 17173–9. Дои:10.1074 / jbc.M000119200. PMID  10747874.
7. Бабб Р., Боуэн Б.Р. (март 2003 г.). «SDP1 представляет собой коактиватор рецептора гамма-2, активируемого пероксисомами и пролифератором, который связывается через свой домен SCAN». Биохимический журнал. 370 (Пт 2): 719–27. Дои:10.1042 / BJ20021378. ЧВК  1223195. PMID  12444922.
8. "Entrez Gene: SCAND1 SCAN домен, содержащий 1".

дальнейшее чтение

• Уильямс А.Дж., Блэклоу СК, Коллинз Т. (декабрь 1999 г.). "SCAN-бокс, связанный с цинковыми пальцами, представляет собой консервативный домен олигомеризации". Молекулярная и клеточная биология. 19 (12): 8526–35. Дои:10.1128 / mcb.19.12.8526. ЧВК  84969. PMID  10567577.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Геномные исследования. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Сандер Т.Л., Моррис Дж. Ф. (август 2002 г.). «Характеристика блока SCAN, кодирующего ген RAZ1: анализ транскриптов кДНК, экспрессии и клеточной локализации». Ген. 296 (1–2): 53–64. Дои:10.1016 / S0378-1119 (02) 00792-8. PMID  12383503.
• Wiemann S, Arlt D, Huber W., Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Геномные исследования. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бектель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К. Х., Хубер В., Пепперкок Р., Поустка А., Виманн С. (январь 2006 г.). «База данных LIFEdb в 2006 году». Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Carneiro FR, Silva TC, Alves AC, Haline-Vaz T, Gozzo FC, Zanchin NI (апрель 2006 г.). «Спектроскопическая характеристика опухолевого антигена NY-REN-21 и идентификация образования гетеродимеров с помощью SCAND1». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 343 (1): 260–8. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.02.140. PMID  16540086.