SCFD1 - SCFD1

SCFD1
Идентификаторы
Псевдонимы	SCFD1, C14orf163, RA410, SLY1, SLY1P, STXBP1L2, домен семейства sec1, содержащий 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 618207 MGI: 1924233 ГомолоГен: 5650 Генные карты: SCFD1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 14 (человек)[1] Группа 14q12 Начинать 30,622,311 бп[1] Конец 30,735,850 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 12 (мышь)[2] Группа 12 | 12 B3 Начинать 51,377,510 бп[2] Конец 51,450,101 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание с N-концом белка • GO: 0001948 связывание с белками • связывание синтаксина • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • аппарат Гольджи • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • сеть цис-Гольджи • клеточная мембрана • Транспортный комплекс Гольджи • Везикула, связанная с Гольджи • Мембрана цистерны Гольджи • эндоплазматический ретикулум Биологический процесс • отрицательная регуляция сборки аутофагосом • регуляция ER к транспорту, опосредованному пузырьками Гольджи • ответ на гипоксию • регулирование транспорта белка • ретроградный транспорт, опосредованный пузырьками, Гольджи в ER • транспорт токсинов • пост-Гольджи-опосредованный везикулами транспорт • стыковка пузырьков, участвующих в экзоцитозе • Покрытие везикул COPII • клеточный морфогенез • транспорт белка • реакция на токсичное вещество • везикулярный транспорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23256	76983
Ансамбль	ENSG00000092108	ENSMUSG00000020952
UniProt	Q8WVM8	Q8BRF7
RefSeq (мРНК)	NM_001257376 NM_001283031 NM_001283032 NM_001283033 NM_016106 NM_182835	NM_029825 NM_001306178
RefSeq (белок)	NP_001244305 NP_001269960 NP_001269961 NP_001269962 NP_057190 NP_878255	NP_001293107 NP_084101
Расположение (UCSC)	Chr 14: 30,62 - 30,74 Мб	Chr 12: 51.38 - 51.45 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок 1, содержащий домен семейства Sec1 это белок что у людей кодируется SCFD1 ген.^[5]

Взаимодействия

SCFD1 был показан взаимодействовать с USO1.^[6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000092108 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020952 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: домен семейства sec1 SCFD1, содержащий 1».
6. Короче Дж., Борода М.Б., Земанн Дж., Дирак-Швейструп А.Б., Уоррен Дж. (Апрель 2002 г.). «Последовательное связывание Golgins и катализ сборки SNAREpin с помощью связывающего пузырьки белка p115». J. Cell Biol. 157 (1): 45–62. Дои:10.1083 / jcb.200112127. ЧВК  2173270. PMID  11927603.
7. Аллан BB, Мойер Б.Д., Балч В.Е. (июль 2000 г.). «Рекрутирование Rab1 p115 в комплекс cis-SNARE: программирование отпочковывающихся везикул COPII для слияния». Наука. 289 (5478): 444–8. Дои:10.1126 / science.289.5478.444. PMID  10903204.

дальнейшее чтение

• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М. А., Кантли Л. К., Гиги С. П. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Хиросе Х, Арасаки К., Дохмаэ Н., Такио К., Хацудзава К., Нагахама М., Тани К., Ямамото А., Тохьяма М., Тагая М. (2004). «Влияние ZW10 на мембранный перенос между эндоплазматическим ретикулумом и Гольджи». EMBO J. 23 (6): 1267–78. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600135. ЧВК  381410. PMID  15029241.
• Уильямс А.Л., Эм С., Джейкобсон NC, Сюй Д., Хэй Дж. К. (2004). «Связывание rsly1 с синтаксином 5 необходимо для транспорта эндоплазматического ретикулума к Гольджи, но не способствует доступности мотива SNARE». Мол. Биол. Клетка. 15 (1): 162–75. Дои:10.1091 / mbc.E03-07-0535. ЧВК  307537. PMID  14565970.
• Геваерт К., Гетальс М., Мартенс Л., Ван Дамм Дж., Стаес А., Томас Г. Р., Вандекеркхове Дж. (2003). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Nat. Биотехнология. 21 (5): 566–9. Дои:10.1038 / nbt810. PMID  12665801.
• Дулубова И., Ямагути Т., Арак Д., Ли Х., Хурьева И., Мин С.В., Ризо Дж., Судхоф ТК (2003). «Конвергенция и расхождение в механизме связывания SNARE с помощью Sec1 / Munc18-подобных белков». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (1): 32–7. Дои:10.1073 / pnas.232701299. ЧВК  140874. PMID  12506202.
• Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Хиросава М., Миядзима Н., Танака А., Котани Н., Номура Н., Охара О. (1998). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (6): 355–64. CiteSeerX  10.1.1.322.2143. Дои:10.1093 / днарес / 5.6.355. PMID  10048485.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Мацуо Н., Огава С., Такаги Т., Ванака А., Мори Т., Мацуяма Т., Пинский DJ, Стерн Д.М., Тохьяма М. (1997). «Клонирование предполагаемого белка, связанного с транспортом везикул, RA410, из культивированных астроцитов крыс и его экспрессия в ишемическом мозге крысы». J. Biol. Chem. 272 (26): 16438–44. Дои:10.1074 / jbc.272.26.16438. PMID  9195952.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.