SEC61B - SEC61B - Wikipedia

SEC61B
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2WWB, 4CG6
Идентификаторы
Псевдонимы	SEC61B, Субъединица бета транслокона Sec61, субъединица бета транслокона SEC61
Внешние идентификаторы	OMIM: 609214 MGI: 1913462 ГомолоГен: 38229 Генные карты: SEC61B
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9q22.33 Начинать 99,222,064 бп[1] Конец 99,230,615 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 B1 Начинать 47,474,658 бп[2] Конец 47,483,242 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание эпидермального фактора роста • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК • Активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов ARF • Активность трансмембранного переносчика белка, обусловленная гидролизом P-P-связи Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • цитозоль • мембрана • Транслокон комплекс Sec61 • эндоплазматический ретикулум • мембрана эндоплазматического ретикулума • эндоплазматический ретикулум Sec комплекс Биологический процесс • ретроградный транспорт белка, ER в цитозоль • IRE1-опосредованный ответ развернутого белка • убиквитин-зависимый путь ERAD • транспорт белка • внутриклеточный транспорт белка • SRP-зависимый котрансляционный белок, нацеленный на мембрану, транслокация • посттрансляционное нацеливание белка на мембрану, транслокация • транспорт • регуляция молекулярной функции Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10952	66212
Ансамбль	ENSG00000106803	ENSMUSG00000053317
UniProt	P60468	Q9CQS8
RefSeq (мРНК)	NM_006808	NM_024171
RefSeq (белок)	NP_006799	NP_077133
Расположение (UCSC)	Chr 9: 99.22 - 99.23 Мб	Chr 4: 47.47 - 47.48 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белковый транспортный белок, субъединица бета Sec61 это белок что у людей кодируется SEC61B ген.^[5][6][7]

Комплекс Sec61 является центральным компонентом аппарата белковой транслокации эндоплазматический ретикулум (ER) мембрана. Олигомеры комплекса Sec61 образуют трансмембранный канал где белки перемещаются и интегрируются в мембрану ER. Этот комплекс состоит из трех мембранные белки - альфа, бета и гамма. Этот ген кодирует белок бета-субъединицы. Субъединицы Sec61 также наблюдаются в компартменте пост-ER, предполагая, что эти белки могут ускользать из ER и рециркулировать обратно. Имеются данные о множественных полиаденилированных сайтах для этого транскрипта.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000106803 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000053317 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Хартманн Э., Соммер Т., Прен С., Горлич Д., Йенч С., Рапопорт Т.А. (март 1994 г.). «Эволюционная консервация компонентов комплекса транслокации белков». Природа. 367 (6464): 654–7. Дои:10.1038 / 367654a0. PMID  8107851. S2CID  4323463.
6. Гринфилд JJ, High S (август 1999 г.). «Комплекс Sec61 расположен как в промежуточном отделении ER, так и в ER-Golgi». J Cell Sci. 112 (10): 1477–86. PMID  10212142.
7. «Ген Entrez: бета-субъединица SEC61B Sec61».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Wiertz EJ, Tortorella D, Bogyo M и др. (1997). «Sec61-опосредованный перенос мембранного белка из эндоплазматического ретикулума в протеасому для разрушения». Природа. 384 (6608): 432–8. Дои:10.1038 / 384432a0. PMID  8945469. S2CID  6276718.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Рыцарь BC, High S (1998). «Мембранная интеграция Sec61alpha: ключевой компонент комплекса транслокации эндоплазматического ретикулума». Biochem. J. 331 (Пт 1): 161–7. Дои:10.1042 / bj3310161. ЧВК  1219334. PMID  9512475.
• Чен Й, Ле Каерек Ф, Чак С.Л. (1998). «Калнексин и другие факторы, которые изменяют транслокацию, влияют на быстрое связывание убиквитина с апоВ в комплексе Sec61». J. Biol. Chem. 273 (19): 11887–94. Дои:10.1074 / jbc.273.19.11887. PMID  9565615.
• Калиес К.Ю., Рапопорт Т.А., Хартманн Э. (1998). «Субъединица β комплекса Sec61 облегчает котрансляционный транспорт белка и взаимодействует с сигнальной пептидазой во время транслокации». J. Cell Biol. 141 (4): 887–94. Дои:10.1083 / jcb.141.4.887. ЧВК  2132780. PMID  9585408.
• Бебок З., Маццочи С., Кинг С.А. и др. (1998). «Механизм, лежащий в основе переноса трансмембранного регулятора проводимости при муковисцидозе из эндоплазматического ретикулума в протеасому, включает Sec61beta и цитозольный дегликозилированный посредник». J. Biol. Chem. 273 (45): 29873–8. Дои:10.1074 / jbc.273.45.29873. PMID  9792704.
• Ингли Э., Уильямс Дж. Х., Уокер К. Э. и др. (1999). «Новый фактор, подобный АДФ-рибозилированию (ARL-6), взаимодействует с субъединицей белок-проводящего канала SEC61beta». FEBS Lett. 459 (1): 69–74. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 01188-6. PMID  10508919. S2CID  30948975.
• Ямагути А., Хори О., Стерн Д.М. и др. (2000). «Связанный со стрессом эндоплазматический ретикулум-протеин 1 (Serp1) / связанный с рибосомами мембранный белок 4 (Ramp4) стабилизирует мембранные белки во время стресса и способствует последующему гликозилированию». J. Cell Biol. 147 (6): 1195–204. Дои:10.1083 / jcb.147.6.1195. ЧВК  2168098. PMID  10601334.
• Мейер Х.А., Грау Х., Крафт Р. и др. (2000). «Sec61 млекопитающих связан с Sec62 и Sec63». J. Biol. Chem. 275 (19): 14550–7. Дои:10.1074 / jbc.275.19.14550. PMID  10799540.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Хамфрей С.Дж., Оливер К., Хант А.Р. и др. (2004). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 9 человека». Природа. 429 (6990): 369–74. Дои:10.1038 / природа02465. ЧВК  2734081. PMID  15164053.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Besemer J, Harant H, Wang S и др. (2005). «Селективное ингибирование котрансляционной транслокации молекулы адгезии сосудистых клеток 1». Природа. 436 (7048): 290–3. Дои:10.1038 / природа03670. PMID  16015337. S2CID  4431610.
• Ким Дж. Э., Танненбаум SR, Белый FM (2005). «Глобальный фосфопротеом клеток аденокарциномы толстой кишки человека HT-29». J. Proteome Res. 4 (4): 1339–46. Дои:10.1021 / pr050048h. PMID  16083285.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Ляо Х.Дж., Карпентер Г. (2007). «Роль транслокона Sec61 в передаче рецептора EGF в ядро ​​и экспрессии генов». Мол. Биол. Клетка. 18 (3): 1064–72. Дои:10.1091 / mbc.E06-09-0802. ЧВК  1805100. PMID  17215517.