SEMA4G - SEMA4G

SEMA4G
Идентификаторы
Псевдонимы	SEMA4G, семафорин 4G
Внешние идентификаторы	MGI: 1347047 ГомолоГен: 22682 Генные карты: SEMA4G
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10q24.31 Начинать 100,969,518 бп[1] Конец 100,985,871 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 | 19 C3 Начинать 44,989,101 бп[2] Конец 45,003,397 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание нейропилина • связывание рецептора семафорина • хеморепеллентная активность Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • клеточная мембрана • мембрана • внеклеточный • неотъемлемый компонент плазматической мембраны Биологический процесс • развитие многоклеточного организма • дифференциация клеток • развитие нервной системы • отрицательный хемотаксис • миграция клеток нервного гребня • положительное регулирование миграции клеток • отрицательная регуляция удлинения аксонов, участвующих в ведении аксонов • семафорин-плексиновый сигнальный путь Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	57715	26456
Ансамбль	ENSG00000095539	ENSMUSG00000025207
UniProt	Q9NTN9	Q9WUH7
RefSeq (мРНК)	NM_001203244 NM_017893	NM_011976
RefSeq (белок)	NP_001190173 NP_060363	NP_036106
Расположение (UCSC)	Chr 10: 100.97 - 100.99 Мб	Chr 19: 44.99 - 45 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Семафорин-4G это белок что у людей кодируется SEMA4G ген.^[5]

Семафорины большая семья законсервированных секретный и мембранно-ассоциированные белки которые обладают доменом семафоринга (Sema) и доменом PSI (обнаружены в плексинах, семафоринах и интегрины ) в N-концевой внеклеточной части. На основании последовательности и структурного сходства семафорины делятся на восемь классов: беспозвоночные содержат классы 1 и 2, вирусы имеют класс V и позвоночные содержат классы 3-7. Семафорины служат управление аксоном лиганды через мультимерные рецепторные комплексы, некоторые (если не все) содержат плексин белки. Этот ген кодирует семафорин класса 4. Этот ген и ген митохондриальный рибосомный белок L43 перекрывается на карте 10q24.31 и транскрибируется в противоположных направлениях.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000095539 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025207 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: домен семы SEMA4G, домен иммуноглобулина (Ig), трансмембранный домен (TM) и короткий цитоплазматический домен, (семафорин) 4G».

дальнейшее чтение

• Пастеркамп Р.Дж., Колодкин А.Л. (2003). «Соединение семафоринов: прокладывая путь к нейронной связности». Curr. Мнение. Нейробиол. 13 (1): 79–89. Дои:10.1016 / S0959-4388 (03) 00003-5. PMID  12593985. S2CID  40661992.
• Диксон BJ (2003). «Молекулярные механизмы наведения аксонов». Наука. 298 (5600): 1959–64. Дои:10.1126 / science.1072165. PMID  12471249. S2CID  28328792.
• Холтмаат А.Дж., Де Винтер Ф., Де Вит Дж. И др. (2002). «Семафорины: способствуют структурной стабильности гиппокампа сети?». Прог. Мозг Res. Прогресс в исследованиях мозга. 138: 17–38. Дои:10.1016 / S0079-6123 (02) 38068-3. ISBN  978-0-444-50981-9. PMID  12432760.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Делукас П., Earthrowl ME, Grafham DV, et al. (2004). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 10 человека». Природа. 429 (6990): 375–81. Дои:10.1038 / природа02462. PMID  15164054.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Нагасе Т., Кикуно Р., Накаяма М. и др. (2001). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XVIII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 7 (4): 273–81. Дои:10.1093 / dnares / 7.4.271. PMID  10997877.