SEPP1 - SEPP1

СЕЛЕНОП
Идентификаторы
Псевдонимы	СЕЛЕНОП, SELP, SeP, SEPP, SEPP1, селенопротеин P, плазма, 1, селенопротеин P
Внешние идентификаторы	OMIM: 601484 MGI: 894288 ГомолоГен: 3945 Генные карты: СЕЛЕНОП
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5п12 Начните 42,799,880 бп[1] Конец 42,887,392 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 A1 | 15 1,84 см Начните 3,268,547 бп[2] Конец 3,280,508 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • селеновое связывание Сотовый компонент • внеклеточная экзосома • просвет плотных гранул тромбоцитов • внеклеточная область • внеклеточный Биологический процесс • развитие мозга • постэмбриональное развитие • половое размножение • ответ на окислительный стресс • двигательное поведение • метаболический процесс соединения селена • дегрануляция тромбоцитов • рост • реакция на ион селена • регулирование роста Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	6414	20363
Ансамбль	ENSG00000250722	ENSMUSG00000064373
UniProt	P49908	P70274
RefSeq (мРНК)	NM_005410 NM_001085486 NM_001093726	NM_001042613 NM_001042614 NM_009155
RefSeq (белок)	NP_001078955 NP_001087195 NP_005401	NP_001036078 NP_001036079 NP_033181
Расположение (UCSC)	Chr 5: 42,8 - 42,89 Мб	Chr 15: 3.27 - 3.28 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Селенопротеин Р это белок что у людей кодируется SEPP1 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует селенопротеин содержащий несколько селеноцистеин (Sec) остатки, которые кодируются кодоном UGA, который обычно сигнализирует о завершении трансляции. 3 'UTR генов селенопротеинов имеют общую структуру стебель-петля, последовательность вставки sec (SECIS), которая необходима для распознавания UGA как кодона Sec, а не как стоп-сигнал. Этот селенопротеин - внеклеточный гликопротеин, и необычен тем, что он содержит остатки 9 сек (человека, крысы, мыши - см. Burk and Hill 2009) на полипептид. Это гепарин -связывающий белок, который, по-видимому, связан с эндотелиальными клетками и должен функционировать как антиоксидант во внеклеточном пространстве. Для этого гена было обнаружено несколько вариантов транскриптов, кодирующих одну и ту же или разные изоформы.^[6]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000250722 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000064373 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Хилл К.Е., Ллойд Р.С., Бурк РФ (февраль 1993 г.). «Консервативные нуклеотидные последовательности в открытой рамке считывания и 3 'нетранслируемой области мРНК селенопротеина P». Proc Natl Acad Sci U S A. 90 (2): 537–41. Дои:10.1073 / пнас.90.2.537. ЧВК  45698. PMID  8421687.
6. «Ген Entrez: селенопротеин P SEPP1, плазма, 1».

дальнейшее чтение

• Бурк Р.Ф., Хилл К.Е. (1994). «Селенопротеин П. Богатый селеном внеклеточный гликопротеин». J. Nutr. 124 (10): 1891–7. Дои:10.1093 / jn / 124.10.1891. PMID  7931697.
• Мостерт V (2000). «Селенопротеин Р: свойства, функции и регуляция». Arch. Biochem. Биофизы. 376 (2): 433–8. Дои:10.1006 / abbi.2000.1735. PMID  10775431.
• Хилл К.Э., Ллойд Р.С., Ян Дж. Г. и др. (1991). «КДНК селенопротеина Р крысы содержит 10 кодонов TGA в открытой рамке считывания». J. Biol. Chem. 266 (16): 10050–3. PMID  2037562.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Акессон Б., Беллью Т., Бурк РФ (1994). «Очистка селенопротеина Р из плазмы человека». Биохим. Биофиз. Acta. 1204 (2): 243–9. Дои:10.1016/0167-4838(94)90014-0. PMID  8142465.
• Хилл К.Э., Дасуки М., Филлипс Дж. А., Бурк РФ (1997). «Ген селенопротеина P человека отображается на 5q31». Геномика. 36 (3): 550–1. Дои:10.1006 / geno.1996.0505. PMID  8884283.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Мостерт В., Ломбек И., Абель Дж. (1998). «Новый метод очистки селенопротеина P из плазмы человека». Arch. Biochem. Биофизы. 357 (2): 326–30. Дои:10.1006 / abbi.1998.0809. PMID  9735174.
• Сайто Ю., Хаяси Т., Танака А. и др. (1999). «Селенопротеин P в плазме человека в виде внеклеточной фосфолипидгидропероксид глутатионпероксидазы. Выделение и ферментативная характеристика селенопротеина p человека». J. Biol. Chem. 274 (5): 2866–71. Дои:10.1074 / jbc.274.5.2866. PMID  9915822.
• Кояма Х., Омура К., Эдзима А. и др. (1999). «Разделение селенсодержащих белков в плазме человека и мыши с использованием тандемных высокоэффективных колонок для жидкостной хроматографии в сочетании с масс-спектрометрией с индуктивно связанной плазмой». Анальный. Биохим. 267 (1): 84–91. Дои:10.1006 / abio.1998.2949. PMID  9918658.
• Arteel GE, Franken S, Kappler J, Sies H (2000). «Связывание селенопротеина P с гепарином: характеристика с помощью поверхностного плазмонного резонанса». Биол. Chem. 381 (3): 265–8. Дои:10.1515 / BC.2000.034. PMID  10782998. S2CID  36448244.
• Хондал Р.Дж., Ма С., Каприоли Р.М. и др. (2001). «Гепарин-связывающие остатки гистидина и лизина крысиного селенопротеина Р». J. Biol. Chem. 276 (19): 15823–31. Дои:10.1074 / jbc.M010405200. PMID  11278668.
• Нисимура К., Мацумия К., Цудзимура А. и др. (2001). «Связь селенопротеина P с продукцией тестостерона в культивируемых клетках Лейдига». Arch. Андрол. 47 (1): 67–76. Дои:10.1080/01485010152104026. PMID  11442337.
• Аль-Тайе ОХ, Сеуферт Дж., Мерк Х. и др. (2003). «Сложная структура ДНК-повтора в промоторе селенопротеина Р содержит функционально значимый полиморфизм и является генетически нестабильной в условиях дефицита репарации ошибочного спаривания».. Евро. J. Hum. Genet. 10 (9): 499–504. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5200811. PMID  12173025.
• Сайто Ю., Такахаши К. (2003). «Характеристика селенопротеина Р как белка снабжения селена». Евро. J. Biochem. 269 (22): 5746–51. Дои:10.1046 / j.1432-1033.2002.03298.x. PMID  12423375.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.