SF3B14 - SF3B14

SF3B6
Белок SF3B14 PDB 2f9d.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSF3B6, HSPC175, Ht006, P14, SAP14, SAP14a, SF3B14, SF3B14a, CGI-110, фактор сплайсинга 3b субъединица 6
Внешние идентификаторыOMIM: 607835 MGI: 1913305 ГомолоГен: 9360 Генные карты: SF3B6
Расположение гена (человек)
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человек)[1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное расположение SF3B6
Геномное расположение SF3B6
Группа2п23.3Начинать24,067,586 бп[1]
Конец24,076,373 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_016047

NM_025323

RefSeq (белок)

NP_057131

NP_079599

Расположение (UCSC)Chr 2: 24.07 - 24.08 МбChr 12: 4.82 - 4.83 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор сплайсинга 3B, субъединица 14 кДа, также известный как SF3B14, это человек ген.[5]

Функция

Этот ген кодирует субъединицу белка 14 кДа комплекса фактора сплайсинга 3b. Фактор сплайсинга 3b ассоциирует как с U2, так и с U11 / U12 малыми ядерными рибонуклеопротеидными комплексами (U2 snRNP) сплайсосом. Этот белок 14 кДа непосредственно взаимодействует с субъединицей 1 комплекса фактора сплайсинга 3b. Этот белок 14 кДа также напрямую взаимодействует с аденозином, который выполняет первую стадию переэтерификации сплайсинга в сайте разветвления пре-мРНК.[5]

Взаимодействия

SF3B14 был показан взаимодействовать с SF3B1.[6][7]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000115128 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037361 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «Ген Entrez: фактор сплайсинга SF3B14 3B, субъединица 14 кДа».
  6. ^ Will CL, Schneider C, MacMillan AM, Katopodis NF, Neubauer G, Wilm M, Lührmann R, Query CC (август 2001 г.). «Новый белок snRNP U2 и U11 / U12, который связывается с участком разветвления пре-мРНК». EMBO J. 20 (16): 4536–46. Дои:10.1093 / emboj / 20.16.4536. ЧВК  125580. PMID  11500380.
  7. ^ Will CL, Urlaub H, Achsel T., Gentzel M, Wilm M, Lührmann R (сентябрь 2002 г.). «Характеристика новых белков snRNP SF3b и 17S U2, включая гомолог человеческого Prp5p и белок DEAD-бокса SF3b». EMBO J. 21 (18): 4978–88. Дои:10.1093 / emboj / cdf480. ЧВК  126279. PMID  12234937.

дальнейшее чтение