SF3B14 - SF3B14

SF3B6
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2F9D, 2F9J, 2FHO, 3LQV
Идентификаторы
Псевдонимы	SF3B6, HSPC175, Ht006, P14, SAP14, SAP14a, SF3B14, SF3B14a, CGI-110, фактор сплайсинга 3b субъединица 6
Внешние идентификаторы	OMIM: 607835 MGI: 1913305 ГомолоГен: 9360 Генные карты: SF3B6
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2п23.3 Начинать 24,067,586 бп[1] Конец 24,076,373 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 12 (мышь)[2] Группа 12 | 12 A1.1 Начинать 4,817,544 бп[2] Конец 4,827,659 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеиновой кислоты • Связывание РНК • GO: 0001948 связывание с белками • связывание мРНК Сотовый компонент • каталитическая стадия 2 сплайсосомы • Сплайсосомальный комплекс типа U12 • Сплайсосомальный комплекс типа U2 • прекаталитическая сплайсосома • ядро клетки • U2 snRNP • нуклеоплазма • сплайсосомальный комплекс Биологический процесс • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • обработка мРНК • образование бластоцисты • Сплайсинг РНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51639	66055
Ансамбль	ENSG00000115128	ENSMUSG00000037361
UniProt	Q9Y3B4	P59708
RefSeq (мРНК)	NM_016047	NM_025323
RefSeq (белок)	NP_057131	NP_079599
Расположение (UCSC)	Chr 2: 24.07 - 24.08 Мб	Chr 12: 4.82 - 4.83 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор сплайсинга 3B, субъединица 14 кДа, также известный как SF3B14, это человек ген.^[5]

Функция

Этот ген кодирует субъединицу белка 14 кДа комплекса фактора сплайсинга 3b. Фактор сплайсинга 3b ассоциирует как с U2, так и с U11 / U12 малыми ядерными рибонуклеопротеидными комплексами (U2 snRNP) сплайсосом. Этот белок 14 кДа непосредственно взаимодействует с субъединицей 1 комплекса фактора сплайсинга 3b. Этот белок 14 кДа также напрямую взаимодействует с аденозином, который выполняет первую стадию переэтерификации сплайсинга в сайте разветвления пре-мРНК.^[5]

Взаимодействия

SF3B14 был показан взаимодействовать с SF3B1.^[6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000115128 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037361 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: фактор сплайсинга SF3B14 3B, субъединица 14 кДа».
6. Will CL, Schneider C, MacMillan AM, Katopodis NF, Neubauer G, Wilm M, Lührmann R, Query CC (август 2001 г.). «Новый белок snRNP U2 и U11 / U12, который связывается с участком разветвления пре-мРНК». EMBO J. 20 (16): 4536–46. Дои:10.1093 / emboj / 20.16.4536. ЧВК  125580. PMID  11500380.
7. Will CL, Urlaub H, Achsel T., Gentzel M, Wilm M, Lührmann R (сентябрь 2002 г.). «Характеристика новых белков snRNP SF3b и 17S U2, включая гомолог человеческого Prp5p и белок DEAD-бокса SF3b». EMBO J. 21 (18): 4978–88. Дои:10.1093 / emboj / cdf480. ЧВК  126279. PMID  12234937.

дальнейшее чтение

• Лай Ч., Чжоу Ц.Ю., Чан ЛЙ, Лю Ц.С., Лин В. (2000). «Идентификация новых человеческих генов, эволюционно консервативных у Caenorhabditis elegans, с помощью сравнительной протеомики». Genome Res. 10 (5): 703–13. Дои:10.1101 / гр.10.5.703. ЧВК  310876. PMID  10810093.
• Hu RM, Han ZG, Song HD, Peng YD, Huang QH, Ren SX, Gu YJ, Huang CH, Li YB, Jiang CL, Fu G, Zhang QH, Gu BW, Dai M, Mao YF, Gao GF, Rong R , Е М., Чжоу Дж., Сюй Ш., Гу Дж., Ши Дж. Х, Джин В. Р., Чжан СК, Ву TM, Хуан Г. Ю., Чен З, Чен М. Д., Чен Дж. Л. (2000). «Профили экспрессии генов в оси гипоталамус-гипофиз-надпочечники человека и клонирование полноразмерной кДНК». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (17): 9543–8. Дои:10.1073 / pnas.160270997. ЧВК  16901. PMID  10931946.
• Чжан QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Ху GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (2000). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее неопределенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Genome Res. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
• Харрингтон Дж. Дж., Шерф Б., Рандлетт С., Джексон П. Д., Перри Р., Каин С., Левенталь К., Торнтон М., Рамачандран Р., Уиттингтон Дж., Лернер Л., Костанцо Д., Макэллиготт К., Бузер С., Мэйс Р., Смит Е., Велозо Н. , Klika A, Hess J, Cothren K, Lo K, Offenbacher J, Danzig J, Ducar M (2001). «Создание полногеномных библиотек экспрессии белков с использованием случайной активации экспрессии генов». Nat. Биотехнология. 19 (5): 440–5. Дои:10.1038/88107. PMID  11329013. S2CID  25064683.
• Уилл С.Л., Шнайдер С., Макмиллан А.М., Катоподис Н.Ф., Нойбауэр Г., Вильм М., Люрманн Р., Query CC (2001). «Новый белок snRNP U2 и U11 / U12, который связывается с участком разветвления пре-мРНК». EMBO J. 20 (16): 4536–46. Дои:10.1093 / emboj / 20.16.4536. ЧВК  125580. PMID  11500380.
• Will CL, Urlaub H, Achsel T, Gentzel M, Wilm M, Lührmann R (2002). «Характеристика новых белков snRNP SF3b и 17S U2, включая гомолог человеческого Prp5p и белок DEAD-бокса SF3b». EMBO J. 21 (18): 4978–88. Дои:10.1093 / emboj / cdf480. ЧВК  126279. PMID  12234937.
• Голас М.М., Сандер Б., Уилл К.Л., Люрманн Р., Старк Х. (2003). «Молекулярная архитектура мультипротеинового фактора сплайсинга SF3b». Наука. 300 (5621): 980–4. Дои:10.1126 / science.1084155. PMID  12738865. S2CID  31046270.
• Will CL, Schneider C, Hossbach M, Urlaub H, Rauhut R, Elbashir S, Tuschl T, Lührmann R (2004). «18S U11 / U12 snRNP человека содержит набор новых белков, не обнаруженных в U2-зависимой сплайсосоме». РНК. 10 (6): 929–41. Дои:10.1261 / rna.7320604. ЧВК  1370585. PMID  15146077.
• Раш Дж, Мориц А., Ли К.А., Го А., Госс В.Л., Спек Э.Д., Чжан Х., Чжа Х.М., Полакевич Р.Д., Гребень М.Дж. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Nat. Биотехнология. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID  15592455. S2CID  7200157.
• Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Леунг А.К., Онг С.Е., Лион CE, Ламонд А.И., Манн М. (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.