SFRS2 - SFRS2 - Wikipedia

SRSF2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2КН4, 2LEA, 2LEB, 2LEC
Идентификаторы
Псевдонимы	SRSF2, PR264, SC-35, SC35, SFRS2, SFRS2A, SRp30b, фактор сплайсинга 2, богатый серином / аргинином, фактор сплайсинга 2, богатый серином и аргинином
Внешние идентификаторы	OMIM: 600813 MGI: 98284 ГомолоГен: 37721 Генные карты: SRSF2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q25.1 Начинать 76,734,115 бп[1] Конец 76,737,374 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 E2 | 11 81,49 см Начинать 116,849,901 бп[2] Конец 116,853,094 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • GO: 0001948 связывание с белками • связывание нуклеиновой кислоты • Связывание РНК • связывание протеинкиназы C • связывание пре-мРНК Сотовый компонент • Тело PML • ядерное пятнышко • нуклеоплазма • внеклеточная экзосома • ядро клетки • цитозоль • сплайсосомальный комплекс • межхроматиновая гранула • цитоплазма Биологический процесс • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • прекращение транскрипции РНК-полимеразы II • обработка мРНК • экспорт мРНК из ядра • Сплайсинг РНК • Обработка 3'-конца мРНК • Экспорт РНК из ядра • отрицательная регуляция транскрипции с использованием шаблона нуклеиновой кислоты • GO: 0007067 митотический клеточный цикл • регуляция альтернативного сплайсинга мРНК через сплайсосомы • ответ на витамин Е • регуляция сплайсинга РНК • цис-сплайсинг мРНК через сплайсосомы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6427	20382
Ансамбль	ENSG00000161547	ENSMUSG00000034120
UniProt	Q01130	Q62093
RefSeq (мРНК)	NM_001195427 NM_003016	NM_011358
RefSeq (белок)	NP_001182356 NP_003007	NP_035488
Расположение (UCSC)	Chr 17: 76,73 - 76,74 Мб	Chr 11: 116,85 - 116,85 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор сплайсинга, богатый аргинином / серином 2 это белок что у людей кодируется SFRS2 ген.^[5][6][7]

Взаимодействия

SFRS2 был показан взаимодействовать с CDC5L^[8] и ASF / SF2.^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000161547 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034120 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Бермингем-младший, Арден К.С., Наумова А.К., Сапиенца С., Виарс С.С., Фу XD, Хотц Дж., Мэнли Дж. Л., Розенфельд М.Г. (сентябрь 1995 г.). «Хромосомная локализация генов мыши и человека, кодирующих факторы сплайсинга ASF / SF2 (SFRS1) и SC-35 (SFRS2)». Геномика. 29 (1): 70–9. Дои:10.1006 / geno.1995.1216. PMID  8530103.
6. Fu XD, Maniatis T (апрель 1992 г.). «Выделение комплементарной ДНК, кодирующей фактор сплайсинга SC35 млекопитающих». Наука. 256 (5056): 535–8. Дои:10.1126 / science.1373910. PMID  1373910.
7. «Ген Entrez: фактор сплайсинга SFRS2, аргинин / серин-богатый 2».
8. Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ человеческого комплекса CDC5L и идентификация его компонентов с помощью масс-спектрометрии». Журнал EMBO. 19 (23): 6569–81. Дои:10.1093 / emboj / 19.23.6569. ЧВК  305846. PMID  11101529.
9. Чжан WJ, Wu JY (октябрь 1996 г.). «Функциональные свойства p54, нового белка SR, активного в конститутивном и альтернативном сплайсинге». Молекулярная и клеточная биология. 16 (10): 5400–8. Дои:10.1128 / MCB.16.10.5400. ЧВК  231539. PMID  8816452.

дальнейшее чтение

• Sureau A, Soret J, Vellard M, Crochet J, Perbal B (декабрь 1992 г.). «Связь PR264 / c-myb: экспрессия фактора сплайсинга, модулируемого ядерным протоонкогеном». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 89 (24): 11683–7. Дои:10.1073 / пнас.89.24.11683. ЧВК  50620. PMID  1465383.
• Веллард М., Бюро А, Сорет Дж, Мартинери С., Пербал Б. (апрель 1992 г.). «Потенциальный фактор сплайсинга кодируется противоположной цепью транс-сплайсированного экзона c-myb». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 89 (7): 2511–5. Дои:10.1073 / pnas.89.7.2511. ЧВК  48691. PMID  1557353.
• Захлер AM, Lane WS, Stolk JA, Roth MB (май 1992 г.). «Белки SR: консервативное семейство факторов сплайсинга пре-мРНК». Гены и развитие. 6 (5): 837–47. Дои:10.1101 / gad.6.5.837. PMID  1577277.
• DuBridge RB, Tang P, Hsia HC, Leong PM, Miller JH, Calos MP (январь 1987 г.). «Анализ мутации в клетках человека с использованием системы челнока вируса Эпштейна-Барра». Молекулярная и клеточная биология. 7 (1): 379–87. Дои:10.1128 / mcb.7.1.379. ЧВК  365079. PMID  3031469.
• Tacke R, Manley JL (июль 1995 г.). «Факторы сплайсинга человека ASF / SF2 и SC35 обладают различными, функционально значимыми специфичностями связывания РНК». Журнал EMBO. 14 (14): 3540–51. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07360.x. ЧВК  394422. PMID  7543047.
• Лузник Л., Мартоне М.Э., Краус Г., Чжан Ю., Сюй Ю., Эллисман М. Х., Вонг-Стаал Ф. (июль 1995 г.). «Локализация вируса иммунодефицита человека Rev в трансфицированных и инфицированных вирусом клетках». Исследования СПИДа и ретровирусы человека. 11 (7): 795–804. Дои:10.1089 / помощь.1995.11.795. PMID  7546906.
• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Кохц Дж. Д., Джеймисон С. Ф., Уилл С. Л., Цзо П., Люрманн Р., Гарсия-Бланко М. А., Мэнли Дж. Л. (март 1994 г.). «Белковые взаимодействия и распознавание 5'-сайтов сплайсинга в предшественниках мРНК млекопитающих». Природа. 368 (6467): 119–24. Дои:10.1038 / 368119a0. PMID  8139654. S2CID  4283089.
• Wu JY, Maniatis T (декабрь 1993 г.). «Специфические взаимодействия между белками, участвующими в выборе сайта сплайсинга, и регулируемым альтернативным сплайсингом». Клетка. 75 (6): 1061–70. Дои:10.1016 / 0092-8674 (93) 90316-И. PMID  8261509. S2CID  22951690.
• Бюро А, Пербал Б. (февраль 1994 г.). «Несколько мРНК с вариабельными 3'-нетранслируемыми областями и разной стабильностью кодируют человеческий фактор сплайсинга PR264 / SC35». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 91 (3): 932–6. Дои:10.1073 / пнас.91.3.932. ЧВК  521427. PMID  8302870.
• Fu XD (сентябрь 1993 г.). «Специфическая приверженность различных пре-мРНК к сплайсингу одиночными белками SR». Природа. 365 (6441): 82–5. Дои:10.1038 / 365082a0. PMID  8361546. S2CID  4332012.
• Чжан WJ, Wu JY (октябрь 1996 г.). «Функциональные свойства p54, нового белка SR, активного в конститутивном и альтернативном сплайсинге». Молекулярная и клеточная биология. 16 (10): 5400–8. Дои:10.1128 / MCB.16.10.5400. ЧВК  231539. PMID  8816452.
• Tronchère H, Wang J, Fu XD (июль 1997 г.). «Белок, связанный с фактором сплайсинга U2AF35, который взаимодействует с белками U2AF65 и SR при сплайсинге пре-мРНК». Природа. 388 (6640): 397–400. Дои:10.1038/41137. PMID  9237760. S2CID  4386808.
• Sureau A, Soret J, Guyon C, Gaillard C, Dumon S, Keller M, Crisanti P, Perbal B (ноябрь 1997 г.). «Характеристика множества альтернативных РНК, возникающих в результате антисмысловой транскрипции гена фактора сплайсинга PR264 / SC35». Исследования нуклеиновых кислот. 25 (22): 4513–22. Дои:10.1093 / nar / 25.22.4513. ЧВК  147067. PMID  9358160.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Чжан WJ, Wu JY (февраль 1998 г.). «Sip1, новый белок, содержащий домен RS, необходимый для сплайсинга пре-мРНК». Молекулярная и клеточная биология. 18 (2): 676–84. Дои:10.1128 / mcb.18.2.676. ЧВК  108778. PMID  9447963.
• Имаи Ю., Мацуо Н., Огава С., Тохьяма М., Такаги Т. (январь 1998 г.). «Клонирование гена YT521 для нового белка, связанного со сплайсингом РНК, индуцированного гипоксией / реоксигенацией». Исследование мозга. Молекулярные исследования мозга. 53 (1–2): 33–40. Дои:10.1016 / S0169-328X (97) 00262-3. PMID  9473574.
• Парфенов В.Н., Дэвис Д.С., Почукалина Г.Н., Костючек Д., Мурти К.Г. (апрель 1998 г.). «Динамика распределения компонентов сплайсинга относительно транскрипционного состояния ооцитов человека из антральных фолликулов». Журнал клеточной биохимии. 69 (1): 72–80. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19980401) 69: 1 <72 :: AID-JCB8> 3.0.CO; 2-S. PMID  9513048.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q01130 (Фактор сплайсинга, богатый серином / аргинином 2) на PDBe-KB.