SFRS4 - SFRS4

SRSF4
Идентификаторы
Псевдонимы	SRSF4, SFRS4, SRP75, фактор сплайсинга, богатый серином / аргинином 4, фактор сплайсинга, богатый серином и аргинином 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 601940 MGI: 1890577 ГомолоГен: 25624 Генные карты: SRSF4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п35.3 Начните 29,147,743 бп[1] Конец 29,181,900 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 D2.3 Начните 131,873,617 бп[2] Конец 131,901,706 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Последовательно-специфическое связывание мРНК • связывание нуклеиновой кислоты • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК • связывание нуклеотидов Сотовый компонент • ядро клетки • нуклеоплазма • ядерное пятнышко Биологический процесс • Сплайсинг РНК посредством реакций переэтерификации • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • прекращение транскрипции РНК-полимеразы II • обработка мРНК • отрицательная регуляция сплайсинга мРНК через сплайсосомы • Обработка 3'-конца мРНК • экспорт мРНК из ядра • Сплайсинг РНК • Экспорт РНК из ядра • ответ на инсулин • регуляция альтернативного сплайсинга мРНК через сплайсосомы • цис-сплайсинг мРНК через сплайсосомы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	6429	57317
Ансамбль	ENSG00000116350	ENSMUSG00000028911
UniProt	Q08170	Q8VE97
RefSeq (мРНК)	NM_005626	NM_020587
RefSeq (белок)	NP_005617	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 1: 29.15 - 29.18 Мб	Chr 4: 131,87 - 131,9 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор сплайсинга, богатый аргинином / серином 4 это белок что у людей кодируется SFRS4 ген.^[5][6]

Взаимодействия

SFRS4 было показано взаимодействовать с участием Пинин.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000116350 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000028911 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Захлер AM; Neugebauer KM; Stolk JA; Рот МБ (июль 1993 г.). «Белки SR человека и выделение кДНК, кодирующей SRp75». Mol Cell Biol. 13 (7): 4023–8. Дои:10.1128 / MCB.13.7.4023. ЧВК  359951. PMID  8321209.
6. «Ген Entrez: фактор сплайсинга SFRS4, аргинин / серин-богатый 4».
7. Зимовская, Гражина; Ши Цзя; Мунгуба Густаво; Джексон Мойра R; Алпатов Роман; Симмонс Мэтью Н; Ши Юйцзян; Sugrue Stephen P (ноябрь 2003 г.). «Пинин / DRS / memA взаимодействует с SRp75, SRm300 и SRrp130 в эпителиальных клетках роговицы». Вкладывать деньги. Офтальмол. Vis. Наука. 44 (11): 4715–23. Дои:10.1167 / iovs.03-0240. ISSN  0146-0404. PMID  14578391.

дальнейшее чтение

• Захлер AM; Переулок WS; Stolk JA; Рот МБ (1992). «Белки SR: консервативное семейство факторов сплайсинга пре-мРНК». Genes Dev. 6 (5): 837–47. Дои:10.1101 / gad.6.5.837. PMID  1577277.
• Ramchatesingh J, Zahler AM, Neugebauer KM, et al. (1995). «Подмножество белков SR активирует сплайсинг альтернативного экзона сердечного тропонина Т путем прямого взаимодействия с экзонным энхансером». Мол. Cell. Биол. 15 (9): 4898–907. Дои:10.1128 / MCB.15.9.4898. ЧВК  230736. PMID  7651409.
• Маруяма К; Сугано С (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Gui JF; Переулок WS; Fu XD (1994). «Серинкиназа регулирует внутриклеточную локализацию факторов сплайсинга в клеточном цикле». Природа. 369 (6482): 678–82. Bibcode:1994Натура.369..678Г. Дои:10.1038 / 369678a0. PMID  8208298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Чжан WJ; Ву JY (1998). «Sip1, новый белок, содержащий домен RS, необходимый для сплайсинга пре-мРНК». Мол. Cell. Биол. 18 (2): 676–84. Дои:10.1128 / MCB.18.2.676. ЧВК  108778. PMID  9447963.
• Blencowe BJ; Issner R; Никерсон JA; Sharp PA (1998). «Коактиватор сплайсинга пре-мРНК». Genes Dev. 12 (7): 996–1009. Дои:10.1101 / gad.12.7.996. ЧВК  316672. PMID  9531537.
• Папуцопулу С., Николакаки Э., Чалепакис Г. и др. (1999). «SR протеин-специфическая киназа 1 высоко экспрессируется в семенниках и фосфорилирует протамин 1». Нуклеиновые кислоты Res. 27 (14): 2972–80. Дои:10.1093 / nar / 27.14.2972. ЧВК  148514. PMID  10390541.
• Monsalve M, Wu Z, Adelmant G и др. (2000). «Прямое соединение транскрипции и процессинга мРНК через термогенный коактиватор PGC-1». Мол. Ячейка. 6 (2): 307–16. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 00031-9. PMID  10983978.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Мейснер М., Лопато С., Готцманн Дж. И др. (2003). «Протоонкопротеин TLS / FUS связан с ядерным матриксом и образует комплекс с факторами сплайсинга PTB, SRm160 и белками SR». Exp. Cell Res. 283 (2): 184–95. Дои:10.1016 / S0014-4827 (02) 00046-0. PMID  12581738.
• Ли Дж., Хокинс И.К., Харви С.Д. и др. (2003). «Регулирование альтернативного сплайсинга с помощью SRrp86 и взаимодействующих с ним белков». Мол. Cell. Биол. 23 (21): 7437–47. Дои:10.1128 / MCB.23.21.7437-7447.2003. ЧВК  207616. PMID  14559993.
• Зимовска Г., Ши Дж., Мунгуба Г. и др. (2003). «Пинин / DRS / memA взаимодействует с SRp75, SRm300 и SRrp130 в эпителиальных клетках роговицы». Вкладывать деньги. Офтальмол. Vis. Наука. 44 (11): 4715–23. Дои:10.1167 / iovs.03-0240. PMID  14578391.
• де Грааф К., Хекерман П., Спелтен О. и др. (2004). «Характеристика циклина L2, нового циклина с доменом, богатым аргинином / серином: фосфорилирование с помощью DYRK1A и совместная локализация с факторами сплайсинга». J. Biol. Chem. 279 (6): 4612–24. Дои:10.1074 / jbc.M310794200. PMID  14623875.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Nat. Биотехнология. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID  15592455.
• Барриос-Родилес М., Браун К.Р., Оздамар Б. и др. (2005). «Высокопроизводительное отображение динамической сигнальной сети в клетках млекопитающих». Наука. 307 (5715): 1621–5. Bibcode:2005Научный ... 307.1621B. Дои:10.1126 / science.1105776. PMID  15761153.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
• Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека». Природа. 441 (7091): 315–21. Bibcode:2006Натура.441..315Г. Дои:10.1038 / природа04727. PMID  16710414.