SFRS5 - SFRS5

SRSF5
Идентификаторы
Псевдонимы	SRSF5, HRS, SFRS5, SRP40, фактор сплайсинга, богатый серином / аргинином 5, фактор сплайсинга, богатый серином и аргинином 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 600914 ГомолоГен: 134432 Генные карты: SRSF5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 14 (человек)[1] Группа 14q24.1 Начните 69,726,900 бп[1] Конец 69,772,005 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание нуклеиновой кислоты • связывание протеинкиназы B • Связывание РНК Сотовый компонент • нуклеоплазма • ядрышко • ядро клетки • цитозоль • ядерное пятнышко Биологический процесс • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • прекращение транскрипции РНК-полимеразы II • обработка мРНК • экспорт мРНК из ядра • регуляция клеточного цикла • регенерация печени • Выбор сайта сплайсинга мРНК • клеточный ответ на стимул инсулина • Обработка 3'-конца мРНК • развитие печени • Сплайсинг РНК • ответ на инсулин • Экспорт РНК из ядра • положительная регуляция сплайсинга РНК • регуляция альтернативного сплайсинга мРНК через сплайсосомы • цис-сплайсинг мРНК через сплайсосомы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	6430	н / д
Ансамбль	ENSG00000100650	н / д
UniProt	Q13243	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_001039465 NM_006925 NM_001320214	н / д
RefSeq (белок)	NP_001034554 NP_001307143 NP_008856	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 14: 69.73 - 69.77 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Фактор сплайсинга, богатый аргинином / серином 5 это белок что у людей кодируется SFRS5 ген.^[3][4]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000100650 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. Даймонд Р. Х., Ду К., Ли В. М., Мон К. Л., Хабер Б. А., Тевари Д. С., Тауб Р. (июль 1993 г.). «Новые гены отложенного раннего и сильно индуцированного инсулином ответа на рост. Идентификация HRS, потенциального регулятора альтернативного сплайсинга пре-мРНК». Журнал биологической химии. 268 (20): 15185–92. PMID  7686911.
4. «Энтрез Ген: фактор сплайсинга SFRS5, аргинин / серин-богатый 5».

дальнейшее чтение

• Захлер AM, Lane WS, Stolk JA, Roth MB (май 1992 г.). «Белки SR: консервативное семейство факторов сплайсинга пре-мРНК». Гены и развитие. 6 (5): 837–47. Дои:10.1101 / gad.6.5.837. PMID  1577277.
• Скреатон Г. Р., Касерес Дж. Ф., Майеда А., Белл М. В., Плебански М., Джексон Д. Г., Белл Дж. И., Крайнер А. Р. (сентябрь 1995 г.). «Идентификация и характеристика трех членов семейства факторов сплайсинга пре-мРНК человеческого SR». Журнал EMBO. 14 (17): 4336–49. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb00108.x. ЧВК  394518. PMID  7556075.
• Gui JF, Lane WS, Fu XD (июнь 1994 г.). «Серинкиназа регулирует внутриклеточную локализацию факторов сплайсинга в клеточном цикле». Природа. 369 (6482): 678–82. Дои:10.1038 / 369678a0. PMID  8208298.
• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Ю.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (апрель 1996 г.). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Аналитическая биохимия. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. К., Музни Д. М., Дин Й., Лю В., Рикафренте Д. Ю., Вентланд М. А., Леннон Г., Гиббс Р. А. (апрель 1997 г.). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Геномные исследования. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Сноу Б.Е., Хенг Х.Х., Ши Х.М., Чжоу Й., Ду К., Тауб Р., Цуй Л.К., Макиннес Р.Р. (июль 1997 г.). «Анализ экспрессии и хромосомное отнесение гена SFRS5 / SRp40 человека». Геномика. 43 (2): 165–70. Дои:10.1006 / geno.1997.4794. PMID  9244433.
• Ду К., Тауб Р. (декабрь 1997 г.). «Альтернативный сплайсинг и структура генов SFRS5 / HRS / SRp40 человека и мыши». Ген. 204 (1–2): 243–9. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00552-0. PMID  9434190.
• Бленкоу Б.Дж., Исснер Р., Никерсон Д.А., Шарп П.А. (апрель 1998 г.). «Коактиватор сплайсинга пре-мРНК». Гены и развитие. 12 (7): 996–1009. Дои:10.1101 / gad.12.7.996. ЧВК  316672. PMID  9531537.
• Папуцопулу С., Николакаки Э., Шалепакис Г., Круфт В., Шевайе П., Джаннакурос Т. (июль 1999 г.). «SR протеин-специфическая киназа 1 высоко экспрессируется в семенниках и фосфорилирует протамин 1». Исследования нуклеиновых кислот. 27 (14): 2972–80. Дои:10.1093 / nar / 27.14.2972. ЧВК  148514. PMID  10390541.
• Гил С., Гаттони Р., Карраскал М., Абиан Дж., Стевенин Дж., Бах-Элиас М. (апрель 2003 г.). «Роль hnRNP A1, белков SR и геликазы p68 в регуляции альтернативного сплайсинга c-H-ras». Молекулярная и клеточная биология. 23 (8): 2927–41. Дои:10.1128 / MCB.23.8.2927-2941.2003. ЧВК  152554. PMID  12665590.
• Лю Л., Эми В., Лю Г., Маккихан В. Л. (2003). «Новый комплекс, объединяющий митохондрии и микротрубочковый цитоскелет с ремоделированием хромосом и опухолевым супрессором RASSF1, выведенный с помощью анализа гомологии in silico, клонирования взаимодействия в дрожжах и совместной локализации в культивируемых клетках». Клеточная биология и биология развития in vitro. Животное. 38 (10): 582–94. Дои:10.1290 / 1543-706X (2002) 38 <582: NCIMAT> 2.0.CO; 2. ЧВК  3225227. PMID  12762840.
• Ли Дж., Хокинс И.С., Харви К.Д., Дженнингс Дж. Л., Линк А. Дж., Паттон Дж. Г. (ноябрь 2003 г.). «Регулирование альтернативного сплайсинга с помощью SRrp86 и взаимодействующих с ним белков». Молекулярная и клеточная биология. 23 (21): 7437–47. Дои:10.1128 / MCB.23.21.7437-7447.2003. ЧВК  207616. PMID  14559993.
• de Graaf K, Hekerman P, Spelten O, Herrmann A, Packman LC, Büssow K, Müller-Newen G, Becker W. (февраль 2004 г.). «Характеристика циклина L2, нового циклина с доменом, богатым аргинином / серином: фосфорилирование с помощью DYRK1A и совместная локализация с факторами сплайсинга». Журнал биологической химии. 279 (6): 4612–24. Дои:10.1074 / jbc.M310794200. PMID  14623875.
• Hillman RT, Green RE, Brenner SE (2005). «Недооцененная роль надзора за РНК». Геномная биология. 5 (2): R8. Дои:10.1186 / gb-2004-5-2-r8. ЧВК  395752. PMID  14759258.
• Роперс Д., Аяди Л., Гаттони Р., Жакке С., Дамье Л., Бранлан С., Стевенин Дж. (Июль 2004 г.). «Дифференциальные эффекты белков SR 9G8, SC35, ASF / SF2 и SRp40 на использование сайтов сплайсинга A1-A5 РНК ВИЧ-1». Журнал биологической химии. 279 (29): 29963–73. Дои:10.1074 / jbc.M404452200. PMID  15123677.
• Caputi M, Freund M, Kammler S, Asang C, Schaal H (июнь 2004 г.). «Двунаправленный SF2 / ASF- и SRp40-зависимый энхансер сплайсинга регулирует экспрессию генов rev, env, vpu и nef вируса иммунодефицита человека 1 типа». Журнал вирусологии. 78 (12): 6517–26. Дои:10.1128 / JVI.78.12.6517-6526.2004. ЧВК  416506. PMID  15163745.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кэнтли Л.С., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.