SH3RF1 - SH3RF1

SH3RF1
Идентификаторы
Псевдонимы	SH3RF1, POSH, RNF142, SH3MD2, домен SH3, содержащий безымянный палец 1
Внешние идентификаторы	MGI: 1913066 ГомолоГен: 10988 Генные карты: SH3RF1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4q32.3-q33 Начинать 169,094,259 бп[1] Конец 169,270,956 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 | 8 B3.1 Начинать 61,223,872 бп[2] Конец 61,396,071 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • трансферазная активность • Активность каркаса MAP-киназы • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы Сотовый компонент • цитоплазма • перинуклеарная область цитоплазмы • цитозоль • аппарат Гольджи • проекция клетки • ламеллиподиум Биологический процесс • отрицательная регуляция внешнего апоптотического сигнального пути • отрицательная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • отрицательная регуляция апоптотического процесса • регулирование каскада JNK • убиквитинирование белков • апоптотический процесс • миграция нейронов • активация активности киназы JUN • регулирование дифференцировки CD4-положительных, альфа-бета Т-клеток • аутоубиквитинирование белков • регулирование пролиферации CD8-положительных, альфа-бета Т-клеток • положительное регулирование каскада JNK Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	57630	59009
Ансамбль	ENSG00000154447	ENSMUSG00000031642
UniProt	Q7Z6J0	Q69ZI1
RefSeq (мРНК)	NM_020870	NM_021506 NM_198678
RefSeq (белок)	NP_065921	NP_067481
Расположение (UCSC)	Chr 4: 169.09 - 169.27 Мб	Chr 8: 61,22 - 61,4 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Предполагаемая убиквитин-протеинлигаза E3 SH3RF1 является фермент что у людей кодируется SH3RF1 ген.^[5][6]

Функция

Этот ген кодирует белок, содержащий N-конец RING-finger, четыре домена SH3 и область, участвующую в связывании Rho GTPase Rac. Было показано, что с помощью RING-finger кодируемый белок действует как убиквитин-протеиновая лигаза, участвующая в сортировке белков в транс-сети Гольджи. Кодируемый белок также может действовать как каркас для сигнального пути N-концевой киназы c-Jun, облегчая формирование функционального сигнального модуля.^[6]

Взаимодействия

SH3RF1 был показан взаимодействовать с AKT2^[7] и MAP3K11.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000154447 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031642 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Tapon N, Nagata K, Lamarche N, Hall A (апрель 1998 г.). «Новый rac-мишень POSH представляет собой SH3-содержащий каркасный белок, участвующий в сигнальных путях JNK и NF-kappaB». EMBO J. 17 (5): 1395–404. Дои:10.1093 / emboj / 17.5.1395. ЧВК  1170487. PMID  9482736.
6. «Ген Entrez: SH3RF1 SH3-домен, содержащий безымянный палец 1».
7. Фигероа С., Таррас С., Тейлор Дж., Войтек А.Б. (ноябрь 2003 г.). «Akt2 отрицательно регулирует сборку сигнального комплекса POSH-MLK-JNK». J. Biol. Chem. 278 (48): 47922–7. Дои:10.1074 / jbc.M307357200. PMID  14504284.

дальнейшее чтение

• Lyons TR, Thorburn J, Ryan PW, Thorburn A, Anderson SM, Kassenbrock CK (2007). "Регулирование проапоптотического каркасного белка POSH посредством Akt". J. Biol. Chem. 282 (30): 21987–97. Дои:10.1074 / jbc.M704321200. PMID  17535800.
• Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Ю., Ирие Р., Кушида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Алрой I, Тувиа С., Гринер Т., Гордон Д., Барр Х.М., Таглихт Д., Мандил-Левин Р., Бен-Авраам Д., Конфорти Д., Нир А., Левиус О., Биковиски В., Дори М., Коэн С., Яар Л., Эрез О, Профета-Мейран О, Коскас М., Каспи-Бачар Э., Алчанати И., Села-Браун А., Московиц Х., Тессмер Ю., Шуберт Ю., Рейсс Ю. (2005). «Человеческая убиквитин-протеинлигаза POSH, связанная с сетью транс-Гольджи, необходима для производства ВИЧ 1 типа». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 102 (5): 1478–83. Дои:10.1073 / pnas.0408717102. ЧВК  545085. PMID  15659549.
• Фигероа С., Таррас С., Тейлор Дж., Войтек А.Б. (2003). «Akt2 отрицательно регулирует сборку сигнального комплекса POSH-MLK-JNK». J. Biol. Chem. 278 (48): 47922–7. Дои:10.1074 / jbc.M307357200. PMID  14504284.
• Накаяма М., Кикуно Р., Охара О. (2002). «Белковые взаимодействия между большими белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК». Genome Res. 12 (11): 1773–84. Дои:10.1101 / гр. 406902. ЧВК  187542. PMID  12421765.
• Нагасе Т., Кикуно Р., Исикава К., Хиросава М., Охара О. (2000). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XVII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 7 (2): 143–50. Дои:10.1093 / dnares / 7.2.143. PMID  10819331.