ШПРХ - SHPRH

ШПРХ
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2М85, 4QN1
Идентификаторы
Псевдонимы	ШПРХ, bA545I5.2, гистоновый линкер SNF2, геликаза PHD RING
Внешние идентификаторы	OMIM: 608048 MGI: 1917581 ГомолоГен: 6489 Генные карты: ШПРХ
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6q24.3 Начинать 145,864,245 бп[1] Конец 145,964,423 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 | 10 A1 Начинать 11,149,427 бп[2] Конец 11,217,595 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание нуклеотидов • GO: 0001948 связывание с белками • гидролазная активность • Связывание АТФ • GO: 0008026 геликазная активность • связывание ионов металлов • активность убиквитин-протеинтрансферазы • связывание убиквитин-протеин-лигазы • трансферазная активность • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы Сотовый компонент • нуклеосома • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • сборка нуклеосом • полиубиквитинирование белков • Ремонт ДНК • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • убиквитинирование белков Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	257218	268281
Ансамбль	ENSG00000146414	ENSMUSG00000090112
UniProt	Q149N8	Q7TPQ3
RefSeq (мРНК)	NM_001042683 NM_173082 NM_001370327 NM_001370328	NM_001077707 NM_001284354 NM_172937
RefSeq (белок)	NP_001036148 NP_775105 NP_001357256 NP_001357257	NP_001071175 NP_001271283 NP_766525
Расположение (UCSC)	Chr 6: 145,86 - 145,96 Мб	Chr 10: 11.15 - 11.22 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

E3 убиквитин-протеинлигаза SHPRH является фермент что у людей кодируется ШПРХ ген.^[5][6]

Функция

SHPRH - это повсеместно экспрессируемый белок, содержащий характеристики мотивов нескольких белков репарации ДНК, факторов транскрипции и геликаз. [Поставляется OMIM]^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000146414 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000090112 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Суд Р., Макаловска И., Галдзицки М., Ху П., Эддингс Э., Роббинс К. М., Мозес Т., Намкунг Дж., Чен С., Трент Дж. М. (август 2003 г.). «Клонирование и характеристика нового гена, SHPRH, кодирующего предполагаемый консервативный белок с доменами SNF2 / геликазы и PHD-finger из области 6q24». Геномика. 82 (2): 153–61. Дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00121-6. PMID  12837266.
6. «Ген Entrez: гистоновый линкер SHPRH SNF2, геликаза PHD RING».

дальнейшее чтение

• Мотеги А., Суд Р., Мойнова Х., Марковиц С.Д., Лю П.П., Мён К. (декабрь 2006 г.). «Человеческий SHPRH подавляет геномную нестабильность за счет полиубиквитинирования ядерного антигена пролиферирующих клеток». Журнал клеточной биологии. 175 (5): 703–8. Дои:10.1083 / jcb.200606145. ЧВК  2064669. PMID  17130289.
• Унк И., Хайду И., Фатйол К., Сакаль Б., Бластьяк А., Бермудес В., Гурвиц Дж., Пракаш Л., Пракаш С., Харачка Л. (ноябрь 2006 г.). «Человеческий SHPRH представляет собой убиквитинлигазу для Mms2-Ubc13-зависимого полиубиквитилирования ядерного антигена пролиферирующих клеток». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 103 (48): 18107–12. Bibcode:2006ПНАС..10318107У. Дои:10.1073 / pnas.0608595103. ЧВК  1838714. PMID  17108083.
• Джин Дж., Смит Ф. Д., Старк С., Уэллс К. Д., Фосетт Дж. П., Кулкарни С., Метальников П., О'Доннелл П., Тейлор П., Тейлор Л., Зугман А., Вудгетт-младший, Лангеберг Л. . «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации» (PDF). Текущая биология. 14 (16): 1436–50. Дои:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID  15324660. S2CID  2371325.
• Адамс, доктор медицины, Керлавадж А.Р., Флейшманн Р.Д., Фулднер Р.А., Булт С.Дж., Ли Н.Х., Киркнесс Е.Ф., Вайншток К.Г., Гокейн Д.Д., Уайт О. (сентябрь 1995 г.). «Первоначальная оценка разнообразия генов человека и паттернов экспрессии на основе 83 миллионов нуклеотидов последовательности кДНК» (PDF). Природа. 377 (6547 Прил.): 3–174. PMID  7566098.