SLC35C2 - SLC35C2

SLC35C2
Идентификаторы
Псевдонимы	SLC35C2, BA394O2.1, C20orf5, CGI-15, OVCOV1, семейство носителей растворенного вещества 35 член C2
Внешние идентификаторы	MGI: 2385166 ГомолоГен: 6581 Генные карты: SLC35C2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20q13.12 Начинать 46,345,980 бп[1] Конец 46,364,458 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 H3 | 2 85,53 см Начинать 165,276,554 бп[2] Конец 165,287,869 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • антипортерная активность • GO: 0022891 активность трансмембранного переносчика Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • сеть цис-Гольджи • эндоплазматический ретикулум - мембрана промежуточного отсека Гольджи • мембрана • эндоплазматический ретикулум-промежуточный компартмент Гольджи • нуклеоплазма • аппарат Гольджи Биологический процесс • О-связанное фукозилирование белков • фукозилирование • отрицательная регуляция экспрессии генов • положительная регуляция сигнального пути Notch • Транспорт UDP-глюкозы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51006	228875
Ансамбль	ENSG00000080189	ENSMUSG00000017664
UniProt	Q9NQQ7	Q8VCX2
RefSeq (мРНК)	NM_001281457 NM_001281458 NM_001281459 NM_001281460 NM_015945 NM_173073 NM_173179	NM_001252573 NM_001252574 NM_001252575 NM_144893 NM_001363015 NM_001363016
RefSeq (белок)	NP_001268386 NP_001268387 NP_001268388 NP_001268389 NP_057029 NP_775096 NP_775271	NP_001239502 NP_001239503 NP_001239504 NP_659142 NP_001349944 NP_001349945
Расположение (UCSC)	Chr 20: 46.35 - 46.36 Мб	Chr 2: 165.28 - 165.29 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Семейство носителей растворенного вещества 35 член C2 это белок что у людей кодируется SLC35C2 ген.^[5][6][7]

Оксигенация уровни играют важную роль в регуляции клеточной инвазивности, которая возникает во время ранней имплантации, когда трофобласт клетки вторгаются в матка а также во время прогрессирование опухоли и метастаз. Этот ген, который регулируется напряжение кислорода, индуцируется в гипоксический клетки трофобласта и чрезмерно выраженный в рак яичников. Два белка изоформы кодируются вариантами транскрипта этого гена.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000080189 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000017664 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Лай Ч., Чжоу Ц.Й., Чан ЛЙ, Лю Ц.С., Лин В. (август 2000 г.). «Идентификация новых человеческих генов, эволюционно консервативных у Caenorhabditis elegans, с помощью сравнительной протеомики». Genome Res. 10 (5): 703–13. Дои:10.1101 / гр.10.5.703. ЧВК  310876. PMID  10810093.
6. Fossey SC, Mychaleckyj JC, Pendleton JK, Snyder JR, Bensen JT, Hirakawa S, Rich SS, Freedman BI, Bowden DW (сентябрь 2001 г.). «6,0 мегабазная транскрипционная карта с высоким разрешением области восприимчивости к диабету 2 типа на хромосоме 20 человека». Геномика. 76 (1–3): 45–57. Дои:10.1006 / geno.2001.6584. PMID  11549316.
7. «Ген Entrez: семейство 35 носителей растворенного вещества SLC35C2, член C2».

дальнейшее чтение

• Лэш Г.Е., Постовит Л.М., Мэтьюз Н.Е. и др. (2002). «Кислород как регулятор клеточных фенотипов при беременности и раке». Может. J. Physiol. Pharmacol. 80 (2): 103–9. Дои:10.1139 / y02-008. PMID  11934252.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Пирес Мартинс Р., Лич Р.Е., Кравец С.А. (2001). «Экспрессия генов всего тела с помощью интеллектуального анализа данных». Геномика. 72 (1): 34–42. Дои:10.1006 / geno.2000.6437. PMID  11247664.
• Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека». Природа. 414 (6866): 865–71. Дои:10.1038 / 414865a. PMID  11780052.
• Лич Р., Дунец-Дмуховски З., Танака Т. и др. (2002). «Отнесение OVCOV1 (псевдоним CGI-15) к полосе q13.1 → q13.2 хромосомы 20 человека путем флуоресцентной гибридизации in situ». Cytogenet. Cell Genet. 94 (3–4): 252–3. Дои:10.1159/000048828. PMID  11856893. S2CID  33594704.
• Leach RE, Duniec-Dmuchowski ZM, Pesole G, et al. (2003). «Идентификация, молекулярная характеристика и тканевая экспрессия OVCOV1». Мамм. Геном. 13 (11): 619–24. Дои:10.1007 / s00335-002-2185-4. PMID  12461647. S2CID  19423578.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.