SOX17 - SOX17

SOX17
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2YUL, 4A3N
Идентификаторы
Псевдонимы	SOX17, VUR3, SRY-бокс 17, фактор транскрипции SRY-box 17
Внешние идентификаторы	OMIM: 610928 MGI: 107543 ГомолоГен: 7948 Генные карты: SOX17
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8q11.23 Начинать 54,457,935 бп[1] Конец 54,460,892 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 A1 | 1 1,65 см Начинать 4,490,931 бп[2] Конец 4,497,354 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • последовательное связывание ДНК • Связывание ДНК • связывание бета-катенина • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • связывание фактора транскрипции • GO: 0001948 связывание с белками • активность гетеродимеризации белков • активность фактора транскрипции, связывание с дистальной энхансерной последовательностью РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II Сотовый компонент • комплекс регуляторов транскрипции • нуклеоплазма • ядро клетки Биологический процесс • развитие почечной системы • развитие энтодермы • регуляция эмбрионального развития • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • положительное регулирование катаболического процесса белков • спецификация судьбы стволовых клеток • положительная регуляция развития скелетной мышечной ткани • эмбриональный морфогенез передней кишки • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II, участвующего в спецификации судьбы дефинитивных энтодермальных клеток • развитие эмбриональных органов • энтодермальный морфогенез пищеварительного тракта • отрицательная регуляция спецификации судьбы мезодермальных клеток • морфогенез клеток внутренней клеточной массы • отрицательная регуляция сигнального пути Wnt • стабилизация белка • образование эндокарда • морфогенез тракта оттока • сигнальная трансдукция, участвующая в регуляции экспрессии генов • определение судьбы энтодермальных клеток • транскрипция мРНК с промотора РНК-полимеразы II • регуляция спецификации судьбы мезодермальных клеток • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • Сигнальный путь Wnt • дифференцировка эндокардиальных клеток • регуляция спецификации судьбы сердечных клеток • транскрипция, ДНК-шаблон • дифференцировка стволовых клеток • эмбриональное развитие сердечной трубки • васкулогенез • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • зацикливание сердца • определение судьбы сердечных клеток • развитие общего желчного протока • отрицательная регуляция сигнального пути Wnt, участвующего в развитии сердца • рострокаудальное формирование паттерна нервной трубки • положительная регуляция экспрессии генов • морфогенез кардиогенной пластинки • формирование сердца • эмбриональный морфогенез сердечной трубки • отрицательная регуляция роста клеток • дестабилизация белков • ангиогенез • сперматогенез • положительное регулирование дифференцировки клеток • регуляция деления стволовых клеток • гаструляция • развитие желчного пузыря • канонический путь передачи сигналов Wnt • регулирование дифференцировки клеток • миграция клеток, участвующих в гаструляции • формирование энтодермы • регулирование пролиферации стволовых клеток • отрицательная регуляция канонического сигнального пути Wnt • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • клеточный ответ на фактор ингибирования лейкемии • дифференциация клеток Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	64321	20671
Ансамбль	ENSG00000164736	ENSMUSG00000025902
UniProt	Q9H6I2	Q61473
RefSeq (мРНК)	NM_022454	NM_001289464 NM_001289465 NM_001289466 NM_001289467 NM_011441
RefSeq (белок)	NP_071899	NP_001276393 NP_001276394 NP_001276395 NP_001276396 NP_035571
Расположение (UCSC)	Chr 8: 54.46 - 54.46 Мб	Chr 1: 4.49 - 4.5 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

SRY-ящик 17 это белок что у человека кодируется SOX17 ген.^[5]

Функция

Этот ген кодирует члена семейства транскрипционных факторов SOX (SRY-related HMG-box), участвующих в регуляции эмбрионального развития и в определении судьбы клетки. Кодируемый белок может действовать как регулятор транскрипции после образования белкового комплекса с другими белками.

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000164736 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000025902 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. "Entrez Gene: SRY-box 17". Получено 2017-09-07.

дальнейшее чтение

• Чжан В., Глёкнер С.К., Го М., Мачида Е.О., Ван Д.Х., Ишваран Х., Ван Несте Л., Герман Дж. Г., Schuebel KE, Watkins DN, Ахуджа Н, Байлин С.Б. (2008). «Эпигенетическая инактивация канонического антагониста Wnt SRY-бокса, содержащего ген 17, при колоректальном раке». Рак Res. 68 (8): 2764–72. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-07-6349. ЧВК  2823123. PMID  18413743.
• Паттерсон Э.С., Аддис Р.С., Шамблотт М.Дж., Гирхарт Д.Д. (2008). «SOX17 непосредственно активирует транскрипцию Zfp202 во время дифференцировки энтодермы in vitro». Physiol. Геномика. 34 (3): 277–84. Дои:10.1152 / физиолгеномика.90236.2008. PMID  18523156.
• Феррелл Р.Э., Кимак М.А., Лоуренс Е.К., Finegold DN (2008). «Анализ генов-кандидатов при первичной лимфедеме». Лимфат Рес Биол. 6 (2): 69–76. Дои:10.1089 / lrb.2007.1022. PMID  18564921.
• Séguin CA, Draper JS, Nagy A, Rossant J (2008). «Создание предшественников энтодермы с помощью экспрессии фактора транскрипции SOX в человеческих эмбриональных стволовых клетках». Стволовая клетка. 3 (2): 182–95. Дои:10.1016 / j.stem.2008.06.018. PMID  18682240.
• Семб Х (2008). «Расширяемые предшественники энтодермы: новые инструменты для изучения энтодермы и ее производных». Стволовая клетка. 3 (4): 355–6. Дои:10.1016 / j.stem.2008.09.010. PMID  18940723.
• Фу Д.Й., Ван З.М., Ли-Чен, Ван Б.Л., Шэнь З.З., Хуанг В., Шао З.М. (2010). «Sox17, канонический антагонист Wnt, эпигенетически инактивирован метилированием промотора при раке груди человека». Рак молочной железы Res. Относиться. 119 (3): 601–12. Дои:10.1007 / s10549-009-0339-8. PMID  19301122. S2CID  8614063.
• Нонака Д. (2009). «Дифференциальная экспрессия SOX2 и SOX17 в опухолях семенных клеток яичка». Являюсь. J. Clin. Патол. 131 (5): 731–6. Дои:10.1309 / AJCP7MNCNBCRN8NO. PMID  19369635.
• Du YC, Oshima H, Oguma K, Kitamura T, Itadani H, Fujimura T., Piao YS, Yoshimoto T., Minamoto T., Kotani H, Taketo MM, Oshima M (2009). «Индукция и подавление Sox17 и его возможные роли в процессе онкогенеза желудочно-кишечного тракта». Гастроэнтерология. 137 (4): 1346–57. Дои:10.1053 / j.gastro.2009.06.041. PMID  19549530.
• Стефанович С., Аббуд Н., Десилетс С., Нури Д., Коуэн С., Пусеат М. (2009). «Взаимодействие Oct4 с Sox2 и Sox17: молекулярный переход от плюрипотентности стволовых клеток к определению сердечной судьбы». J. Cell Biol. 186 (5): 665–73. Дои:10.1083 / jcb.200901040. ЧВК  2742180. PMID  19736317.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.