SPATA2 - SPATA2

SPATA2
Идентификаторы
Псевдонимы	SPATA2, PD1, PPP1R145, тамо, связанный со сперматогенезом 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 607662 MGI: 2146885 ГомолоГен: 4407 Генные карты: SPATA2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20q13.13 Начинать 49,903,391 бп[1] Конец 49,915,529 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 H3 Начинать 167,481,133 бп[2] Конец 167,492,887 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • молекулярная функция Сотовый компонент • цитоплазма • ядро клетки • фибриллярный центр Биологический процесс • развитие многоклеточного организма • дифференциация клеток • сперматогенез • регуляция сигнального пути, опосредованного фактором некроза опухоли • регуляция воспалительного ответа • регуляция некроптозного процесса • деубиквитинирование, связанное с белком K63 • линейное деубиквитинирование белков • запрограммированная гибель клеток Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9825	263876
Ансамбль	ENSG00000158480	ENSMUSG00000047030
UniProt	Q9UM82	Q8K004
RefSeq (мРНК)	NM_001135773 NM_006038	NM_170756 NM_001356523
RefSeq (белок)	NP_001129245 NP_006029	NP_001343452 NP_739562
Расположение (UCSC)	Chr 20: 49.9 - 49.92 Мб	Chr 2: 167.48 - 167.49 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок, связанный со сперматогенезом 2 это белок что у людей кодируется SPATA2 ген.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000158480 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000047030 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: связанный со сперматогенезом SPATA2 2».

дальнейшее чтение

• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Нагасе Т., Исикава К., Суяма М. и др. (1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XI. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (5): 277–86. Дои:10.1093 / днарес / 5.5.277. PMID  9872452.
• Грациотто Р., Фореста С., Сканнапеко П. и др. (1999). «Клонирование кДНК и характеристика PD1: нового человеческого тестикулярного белка с различными проявлениями при различных тестикулопатиях». Exp. Cell Res. 248 (2): 620–6. Дои:10.1006 / excr.1999.4449. PMID  10222154.
• Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека». Природа. 414 (6866): 865–71. Дои:10.1038 / 414865a. PMID  11780052.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Лилиана Слонго М, Зотти Л, Онисто М (2003). «Клонирование и характеристика промоторной области гена человека spata2 (связанный со сперматогенезом белок 2)». Биохим. Биофиз. Acta. 1625 (2): 192–6. Дои:10.1016 / s0167-4781 (02) 00594-8. PMID  12531478.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.