SPEF1 - SPEF1

SPEF1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2EE7
Идентификаторы
Псевдонимы	SPEF1, C20orf28, CLAMP, SPEF1A, жгутик сперматозоида 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 610674 MGI: 3513546 ГомолоГен: 15741 Генные карты: SPEF1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20p13 Начинать 3,777,504 бп[1] Конец 3,781,448 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 F1 | 2 Начинать 131,170,261 бп[2] Конец 131,187,282 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание микротрубочек • молекулярная функция Сотовый компонент • цитоплазма • GO: 0035085 аксонема • проекция клетки • подвижная ресничка • ресничка • цитоскелет • клеточный компонент Биологический процесс • отрицательная регуляция деполимеризации микротрубочек • миграция клеток • биологический процесс • цилиозависимая подвижность клеток • регуляция организации цитоскелета Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	25876	70997
Ансамбль	ENSG00000101222	ENSMUSG00000027329
UniProt	Q9Y4P9	Q99JL1
RefSeq (мРНК)	NM_015417	NM_027641
RefSeq (белок)	NP_056232	NP_081917
Расположение (UCSC)	Chr 20: 3.78 - 3.78 Мб	Chr 2: 131.17 - 131.19 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок жгутика сперматозоидов 1 это белок что у людей кодируется SPEF1 ген.^[5][6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000101222 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027329 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Чан С.В., Фаулер К.Дж., Чу К.Х., Калицис П. (июль 2005 г.). «Spef1, новый консервативный белок семенников, обнаруженный в жгутиках сперматозоидов мышей». Ген. 353 (2): 189–99. Дои:10.1016 / j.gene.2005.04.025. PMID  15979255.
6. «Ген Энтреса: открытая рамка считывания 28 хромосомы 20 C20orf28».

дальнейшее чтение

• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Dougherty GW, Adler HJ, Rzadzinska A, et al. (2006). «CLAMP, новый ассоциированный с микротрубочками белок с гомологией кальпонина EB-типа». Cell Motil. Цитоскелет. 62 (3): 141–56. Дои:10,1002 / см. 2003. PMID  16206169.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека». Природа. 414 (6866): 865–71. Дои:10.1038 / 414865a. PMID  11780052.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.