SPEN - SPEN - Wikipedia

Для использования в других целях см. Спен (значения).

SPEN
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1OW1, 2RT5, 4P6Q
Идентификаторы
Псевдонимы	SPEN, HIAA0929, MINT, RBM15C, SHARP, репрессор транскрипции семейства spen
Внешние идентификаторы	OMIM: 613484 MGI: 1891706 ГомолоГен: 124461 Генные карты: SPEN
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п36.21-п36.13 Начните 15,836,095 бп[1] Конец 15,940,456 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 D3 Начните 141,467,890 бп[2] Конец 141,538,597 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание фактора транскрипции РНК-полимеразы II • связывание нуклеиновой кислоты • Связывание РНК • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность Сотовый компонент • транскрипционный репрессорный комплекс • внеклеточная экзосома • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • Notch сигнальный путь • положительная регуляция нейрогенеза • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • GO: 0022415 вирусный процесс • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	23013	56381
Ансамбль	ENSG00000065526	ENSMUSG00000040761
UniProt	Q96T58	Q62504
RefSeq (мРНК)	NM_015001	NM_019763 NM_001347235
RefSeq (белок)	NP_055816	NP_001334164 NP_062737
Расположение (UCSC)	Chr 1: 15.84 - 15.94 Мб	Chr 4: 141,47 - 141,54 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Msx2-взаимодействующий белок это белок что у людей кодируется SPEN ген.^[5][6][7]

Этот ген кодирует индуцируемый гормонами репрессор транскрипции. Подавление транскрипции этим генным продуктом может происходить за счет взаимодействия с другими репрессорами, за счет привлечения белков, участвующих в деацетилировании гистонов, или через секвестрацию активаторов транскрипции. Продукт этого гена содержит карбокси-концевой домен, который позволяет связываться с другими белками-корепрессорами. Этот домен также разрешает взаимодействие с членами комплекса NuRD, белкового комплекса, ремоделирующего нуклеосомы, который содержит деацетилазную активность. Кроме того, этот репрессор содержит несколько мотивов распознавания РНК, которые сообщают связывание с коактиватором РНК стероидного рецептора; это связывание может модулировать активность как лигандированных, так и нелигандированных стероидных рецепторов.^[7]

Взаимодействия

SPEN был показан взаимодействовать с участием HDAC1,^[6] SRA1^[6] и Корепрессор ядерного рецептора 2.^[6]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000065526 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040761 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Newberry EP, Latifi T, Towler DA (сентябрь 1999 г.). «RRM-домен MINT, нового связывающего Msx2 белка, распознает и регулирует промотор остеокальцина крысы». Биохимия. 38 (33): 10678–90. Дои:10.1021 / bi990967j. PMID  10451362.
6. Ши Ю., Доунс М., Се В., Као Х.Й., Ордентлич П., Цай С.К., Хон М., Эванс Р.М. (май 2001 г.). «Sharp, индуцибельный кофактор, который объединяет репрессию и активацию ядерных рецепторов». Genes Dev. 15 (9): 1140–51. Дои:10.1101 / gad.871201. ЧВК  312688. PMID  11331609.
7. «Ген Entrez: гомолог SPEN spen, регулятор транскрипции (Drosophila)».

дальнейшее чтение

• Терновская Л.Н., Прохорова Л.Г., Мороз В.М. (1977). «[Антагонистические взаимоотношения между стафилококками и Sarcina, выделенными из верхних дыхательных путей практически здоровых людей]». Антибиотики. 21 (12): 1072–5. PMID  1020939.
• Нагасе Т., Исикава К., Суяма М. и др. (1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XIII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 6 (1): 63–70. Дои:10.1093 / днарес / 6.1.63. PMID  10231032.
• Ши Ю., Хон М., Эванс Р. М. (2002). «Дельта рецептора, активируемого пролифератором пероксисом, интегратор репрессии транскрипции и передачи сигналов ядерного рецептора». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (5): 2613–8. Дои:10.1073 / pnas.052707099. ЧВК  122396. PMID  11867749.
• Освальд Ф., Костезка Ю., Астраханцев К. и др. (2002). «SHARP является новым компонентом сигнального пути Notch / RBP-Jkappa». EMBO J. 21 (20): 5417–26. Дои:10.1093 / emboj / cdf549. ЧВК  129081. PMID  12374742.
• Ариёши М., Швабе Дж. В. (2003). «Консервативный структурный мотив раскрывает важную функцию репрессии транскрипции белков Spen и их роль в онтогенетической передаче сигналов». Genes Dev. 17 (15): 1909–20. Дои:10.1101 / gad.266203. ЧВК  196244. PMID  12897056.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Dotzlaw H, Papaioannou M, Moehren U, et al. (2004). «Взаимодействие коактиватора и корепрессора, вызванного агонистом-антагонистом, на рецепторе андрогена человека». Мол. Cell. Эндокринол. 213 (1): 79–85. Дои:10.1016 / j.mce.2003.10.036. PMID  15062576.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Вадламуди Р.К., Манавати Б., Сингх Р.Р. и др. (2005). «Существенная роль Pak1 фосфорилирования SHARP в передаче сигналов Notch». Онкоген. 24 (28): 4591–6. Дои:10.1038 / sj.onc.1208672. PMID  15824732.
• Ли Дж., Ван Дж., Ян Х и др. (2007). «Гомолог Spen Msx2-взаимодействующий ядерный белок-мишень взаимодействует с E2-убиквитин-конъюгированным ферментом UbcH8». Мол. Cell. Биохим. 288 (1–2): 151–7. Дои:10.1007 / s11010-006-9131-9. PMID  16583136.
• Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека». Природа. 441 (7091): 315–21. Дои:10.1038 / природа04727. PMID  16710414.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу С. и др. (2006). «Сеть межбелкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Ячейка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А. и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Биотехнология. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983.
• Feng Y, Bommer GT, Zhai Y, et al. (2007). «Гомолог SHARP с расщепленными концами у дрозофилы функционирует как позитивный регулятор передачи сигналов Wnt / бета-катенин / Т-клеточного фактора при неопластической трансформации». Рак Res. 67 (2): 482–91. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-06-2314. PMID  17234755.