SPPL2A - SPPL2A

SPPL2A
Идентификаторы
Псевдонимы	SPPL2A, IMP3, PSL2, сигнальная пептидная пептидаза, подобная 2A
Внешние идентификаторы	OMIM: 608238 MGI: 1913802 ГомолоГен: 36411 Генные карты: SPPL2A
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 15 (человек)[1] Группа 15q21.2 Начинать 50,702,266 бп[1] Конец 50,765,709 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 F1 Начинать 126,890,391 бп[2] Конец 126,933,235 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность гомодимеризации белков • активность эндопептидазы аспарагинового типа • пептидазная активность • GO: 0001948 связывание с белками • гидролазная активность • активность аспарагиновой эндопептидазы, внутримембранное расщепление Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • эндосома • поздняя эндосома • мембрана • мембрана поздней эндосомы • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • неотъемлемый компонент цитоплазматической стороны мембраны эндоплазматического ретикулума • лизосомальная мембрана • Гольджи-ассоциированная везикулярная мембрана • лизосома • неотъемлемый компонент просветной стороны мембраны эндоплазматического ретикулума • внеклеточная экзосома • клеточная мембрана Биологический процесс • протеолиз мембранного белка • протеолиз • протеолиз мембранного белка, эктодомена • протеолиз внутриклеточного домена мембранного белка • регуляция иммунного ответа • регуляция сигнального пути, опосредованного фактором некроза опухоли Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	84888	66552
Ансамбль	ENSG00000138600	ENSMUSG00000027366
UniProt	Q8TCT8	Q9JJF9
RefSeq (мРНК)	NM_032802	NM_023220
RefSeq (белок)	NP_116191	NP_075709
Расположение (UCSC)	Chr 15: 50,7 - 50,77 Мб	Chr 2: 126,89 - 126,93 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Сигнальный пептид, подобный пептидазе 2А, также известный как SPPL2A, это человек ген.^[5]

Функция

Этот ген является членом сигнальная пептидная пептидаза -подобных протеаз (SPPL) и кодирует лизосомный / поздний эндосомальный мембранный белок^[6] с консервативными мотивами активного сайта «YD» и «GxGD» в соседних трансмембранных доменах (TMD). Этот белок играет роль в врожденном и адаптивном иммунитете, расщепляя TNFα в активированном дендритные клетки.^[7][8] Псевдоген этого гена также находится на хромосоме 15.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000138600 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027366 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: сигнальный пептид SPPL2A, пептидаза, подобная 2A».
6. Бенке Дж, Шнеппенхайм Дж, Кох-Нольте Ф, Хааг Ф, Сафтиг П, Шредер Б (2011). «Сигнальный пептид-пептидаза-подобный 2a (SPPL2a) нацелен на лизосомы / поздние эндосомы тирозиновым мотивом в его C-концевом хвосте». Письма FEBS. 585 (19): 2951–7. Дои:10.1016 / j.febslet.2011.08.043. PMID  21896273.
7. Фридманн Э., Хаубен Э., Майландт К. и др. (2006). «SPPL2a и SPPL2b способствуют внутримембранному протеолизу TNFalpha в активированных дендритных клетках, чтобы запустить продукцию IL-12». Nat. Cell Biol. 8 (8): 843–8. Дои:10.1038 / ncb1440. PMID  16829952.
8. Флюрер Р., Граммер Г., Израиль Л. и др. (2006). «Гамма-секретазоподобное внутримембранное расщепление TNFalpha с помощью аспартил протеазы GxGD SPPL2b» (PDF). Nat. Cell Biol. 8 (8): 894–6. Дои:10,1038 / ncb1450. PMID  16829951.

дальнейшее чтение

• Вайхофен А., Биннс К., Лемберг М.К. и др. (2002). «Идентификация сигнальной пептидной пептидазы, аспарагиновой протеазы пресенилинового типа». Наука. 296 (5576): 2215–8. Дои:10.1126 / science.1070925. PMID  12077416.
• Григоренко А.П., Моляка Ю.К., Коровайцева Г.И., Рогаев Е.И. (2002). «Новый класс политопных белков с доменами, связанными с предполагаемой протеазной активностью». Биохимия Моск. 67 (7): 826–35. Дои:10.1023 / А: 1016365227942. PMID  12139484.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Granneman S, Gallagher JE, Vogelzangs J, et al. (2003). «Белки Imp3 и Imp4 человека образуют тройной комплекс с hMpp10, который взаимодействует только с snoRNA U3 в рибонуклеопротеиновых комплексах 60–80S». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (7): 1877–87. Дои:10.1093 / нар / гкг300. ЧВК  152815. PMID  12655004.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Friedmann E, Lemberg MK, Weihofen A, et al. (2005). «Консенсусный анализ сигнальной пептидной пептидазы и гомологичных аспарагиновых протеаз человека показывает противоположную топологию каталитических доменов по сравнению с пресенилинами». J. Biol. Chem. 279 (49): 50790–8. Дои:10.1074 / jbc.M407898200. PMID  15385547.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
• Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т. и др. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевого слова in silico для отбора полноразмерных кДНК человека, кодирующих секрецию или мембранные белки из библиотек олигокапированных кДНК». ДНК Res. 12 (2): 117–26. Дои:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID  16303743.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Киркин В., Каузак Н., Гвардиола-Серрано Ф. и др. (2007). «Внутриклеточный домен Fas-лиганда высвобождается в результате расщепления ADAM10 и SPPL2a в Т-клетках». Разница в гибели клеток. 14 (9): 1678–87. Дои:10.1038 / sj.cdd.4402175. PMID  17557115.