SRCAP - SRCAP

SRCAP
Идентификаторы
Псевдонимы	SRCAP, DOMO1, EAF1, FLHS, SWR1, Snf2-связанный активаторный белок CREBBP, Snf2-связанный активаторный белок CREBBP
Внешние идентификаторы	OMIM: 611421 MGI: 2444036 ГомолоГен: 38213 Генные карты: SRCAP
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 16 (человек)[1] Группа 16p11.2 Начните 30,698,209 бп[1] Конец 30,741,409 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 F3 Начните 127,511,983 бп[2] Конец 127,561,219 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • связывание нуклеотидов • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание АТФ • гидролазная активность • GO: 0008026 геликазная активность • активность гистонацетилтрансферазы • АТФазная активность • связывание гистонов Сотовый компонент • перинуклеарная область цитоплазмы • аппарат Гольджи • ядро клетки • нуклеоплазма • ядерное тело • макромолекулярный комплекс • Swr1 комплекс Биологический процесс • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • GO: 0022415 вирусный процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • ацетилирование гистонов • организация хроматина • позитивная регуляция транскрипции, основанной на нуклеиновых кислотах • ремоделирование хроматина • подавление гена • АТФ-зависимое ремоделирование хроматина • гистоновый обмен Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10847	100043597
Ансамбль	ENSG00000080603	ENSMUSG00000053877
UniProt	Q6ZRS2	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_006662	NM_001033881 NM_001304266 NM_175144 NM_178800
RefSeq (белок)	NP_006653	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 16: 30,7 - 30,74 Мб	Chr 7: 127,51 - 127,56 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Геликаза SRCAP является фермент что у людей кодируется SRCAP ген.^[5][6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000080603 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000053877 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Johnston H, Kneer J, Chackalaparampil I, Yaciuk P, Chrivia J (июль 1999 г.). «Идентификация нового члена семейства белков SNF2 / SWI2, SRCAP, который взаимодействует с CREB-связывающим белком». J Biol Chem. 274 (23): 16370–6. Дои:10.1074 / jbc.274.23.16370. PMID  10347196.
6. Нагасе Т., Исикава К., Накадзима Д., Охира М., Секи Н., Миядзима Н., Танака А., Котани Н., Номура Н., Охара О. (сентябрь 1997 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК Res. 4 (2): 141–50. Дои:10.1093 / днарес / 4.2.141. PMID  9205841.
7. «Ген Entrez: SRCAP Snf2-родственный активаторный белок CBP».

дальнейшее чтение

• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Гош А.К., Маджумдер М., Стил Р. и др. (2000). «Белок NS5A вируса гепатита С модулирует транскрипцию с помощью нового клеточного фактора транскрипции SRCAP». J. Biol. Chem. 275 (10): 7184–8. Дои:10.1074 / jbc.275.10.7184. PMID  10702287.
• Xu X, Chackalaparampil I, Monroy MA, et al. (2001). «Связывающий белок аденовируса ДНК взаимодействует с SNF2-связанным белком-активатором CBP (SrCap) и ингибирует SrCap-опосредованную транскрипцию». Дж. Вирол. 75 (21): 10033–40. Дои:10.1128 / JVI.75.21.10033-10040.2001. ЧВК  114578. PMID  11581372.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Монрой М.А., Шотт Н.М., Кокс Л. и др. (2004). «Связанный с SNF2 активаторный белок CBP (SRCAP) действует как коактиватор транскрипции, опосредованной стероидным рецептором, посредством синергетических взаимодействий с CARM-1 и GRIP-1». Мол. Эндокринол. 17 (12): 2519–28. Дои:10.1210 / me.2003-0208. PMID  14500758.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Цай Й, Джин Дж, Флоренс Л. и др. (2005). «Белок YL1 млекопитающих является общей субъединицей гистонацетилтрансферазы TRRAP / TIP60 и комплексов SRCAP». J. Biol. Chem. 280 (14): 13665–70. Дои:10.1074 / jbc.M500001200. PMID  15647280.
• Айссенберг Дж. К., Вонг М., Кривия Дж. К. (2005). "Человеческий SRCAP и Drosophila melanogaster DOM являются гомологами, которые функционируют в сигнальном пути notch". Мол. Клетка. Биол. 25 (15): 6559–69. Дои:10.1128 / MCB.25.15.6559-6569.2005. ЧВК  1190335. PMID  16024792.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Рул Д.Д., Джин Дж, Цай Й и др. (2006). «Очистка человеческого комплекса SRCAP, который ремоделирует хроматин путем включения варианта гистона H2A.Z в нуклеосомы». Биохимия. 45 (17): 5671–7. Дои:10.1021 / bi060043d. PMID  16634648.
• Цай Й., Джин Дж., Готтшалк А.Дж. и др. (2007). «Очистка и анализ комплексов ремоделирования хроматина человека INO80 и SRCAP». Методы. 40 (4): 312–7. Дои:10.1016 / j.ymeth.2006.06.023. ЧВК  3092633. PMID  17101442.
• Вонг М.М., Кокс Л.К., Кривия Д.С. (2007). «Белок ремоделирования хроматина, SRCAP, имеет решающее значение для отложения варианта гистона H2A.Z на промоторах». J. Biol. Chem. 282 (36): 26132–9. Дои:10.1074 / jbc.M703418200. PMID  17617668.

внешняя ссылка

• Запись OMIM о синдроме плавучей гавани и SRCAP