SSX2IP - SSX2IP

SSX2IP
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1T2M, 1XZ9, 2AIN, 2EXG
Идентификаторы
Псевдонимы	SSX2IP, ADIP, синовиальная саркома, взаимодействующий белок X breakpoint 2, взаимодействующий белок члена 2 семейства SSX, hMsd1
Внешние идентификаторы	OMIM: 608690 MGI: 2139150 ГомолоГен: 8522 Генные карты: SSX2IP
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п22.3 Начните 84,643,707 бп[1] Конец 84,690,803 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 H2 Начните 146,404,642 бп[2] Конец 146,440,144 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • специфическое связывание белкового домена Сотовый компонент • цитоплазма • центр организации микротрубочек • стык • соединение клеток • проекция клетки • цитоскелет • передний край ячейки • ядро клетки • цилиарное базальное тело • центриолярный спутник • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • регулирование подвижности клеток • внутрицилиарный транспорт, участвующий в сборке ресничек • регуляция передачи сигнала белка Rac • клеточная адгезия • организация проекции клеток • морфогенез ресничек • центросомный цикл Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	117178	99167
Ансамбль	ENSG00000117155	ENSMUSG00000036825
UniProt	Q9Y2D8	Q8VC66
RefSeq (мРНК)	NM_001166293 NM_001166294 NM_001166295 NM_001166417 NM_014021	NM_001253768 NM_001253769 NM_001253770 NM_138744 NM_001355661
RefSeq (белок)	NP_001159765 NP_001159766 NP_001159767 NP_001159889 NP_054740	NP_001240697 NP_001240698 NP_001240699 NP_620083 NP_001342590
Расположение (UCSC)	Chr 1: 84.64 - 84.69 Мб	Chr 3: 146,4 - 146,44 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Афадин- и альфа-актинин-связывающий белок это белок что у людей кодируется SSX2IP ген.^[5] Было показано, что он функционирует вместе с WDR8 при созревании центросом, обеспечивая правильную длину и ориентацию веретена.^{[6][7][8][9][10]}. Комплекс SSX2IP-WDR8 дополнительно способствует стыковке цилиарных пузырьков во время цилиогенеза.^[11][12].

Взаимодействия

SSX2IP первоначально был описан как белок, взаимодействовать с MLLT4^[13] и Актинин, альфа 1.^[13] В контексте созревания центросом и цилиогенеза было показано, что он взаимодействует с WDR8.^[8][9][11].

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000117155 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036825 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: синовиальная саркома SSX2IP, белок, взаимодействующий с точкой разрыва 2».
6. Bärenz F, Inoue D, Yokoyama H, Tegha-Dunghu J, Freiss S, Draeger S и др. (Июль 2013). «Центриолярный сателлитный белок SSX2IP способствует созреванию центросом». Журнал клеточной биологии. 202 (1): 81–95. Дои:10.1083 / jcb.201302122. ЧВК  3704989. PMID  23816619.
7. Юкава М., Икебе С., Тода Т (май 2015 г.). «Комплекс Msd1-Wdr8-Pkl1 прикрепляет минус концы микротрубочек к телам полюсов веретена делящихся дрожжей». Журнал клеточной биологии. 209 (4): 549–62. Дои:10.1083 / jcb.201412111. ЧВК  4442821. PMID  25987607.
8. Иноуэ Д., Стеммер М., Тамбергер Т., Рупперт Т., Беренц Ф., Виттбродт Дж., Грусс О.Дж. (январь 2017 г.). «Экспрессия нового фактора сборки материнской центросомы Wdr8 необходима для митозов эмбрионов позвоночных». Nature Communications. 8: 14090. Дои:10.1038 / ncomms14090. ЧВК  5253655. PMID  28098238.
9. Хори А., Моранд А., Икебе С., Фрит Д., Снайдерс А. П., Тода Т. (04.12.2015). «Консервативный комплекс Wdr8-hMsd1 / SSX2IP локализуется в центросоме и обеспечивает правильную длину и ориентацию веретена». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 468 (1–2): 39–45. Дои:10.1016 / j.bbrc.2015.10.169. ЧВК  4669408. PMID  26545777.
10. Хори А., Педди Си Джей, Коллинсон Л. М., Тода Т. (июнь 2015 г.). «Центриолярное сателлитное и hMsd1 / SSX2IP-зависимое закрепление микротрубочек имеет решающее значение для сборки центриолей». Молекулярная биология клетки. 26 (11): 2005–19. Дои:10.1091 / mbc.E14-11-1561. ЧВК  4472012. PMID  25833712.
11. Куртулмус Б., Ван В., Рупперт Т., Нойнер А., Церикан Б., Виол Л., Дуэньяс-Санчес Р., Грусс О. Дж., Перейра Г. (февраль 2016 г.). «WDR8 представляет собой центриолярный сателлитный и ассоциированный с центриолями белок, который способствует стыковке цилиарных пузырьков во время цилиогенеза». Журнал клеточной науки. 129 (3): 621–36. Дои:10.1242 / jcs.179713. PMID  26675238.
12. Klinger M, Wang W, Kuhns S, Bärenz F, Dräger-Meurer S, Pereira G, Gruss OJ (февраль 2014 г.). «Новый центриолярный сателлитный белок SSX2IP нацелен на Cep290 в зону перехода ресничек». Молекулярная биология клетки. 25 (4): 495–507. Дои:10.1091 / mbc.E13-09-0526. ЧВК  3923641. PMID  24356449.
13. Асада М., Ирие К., Моримото К., Ямада А., Икеда В., Такеучи М., Такай И. (февраль 2003 г.). «ADIP, новый афадин- и альфа-актинин-связывающий белок, локализованный на стыках межклеточных сращений». Журнал биологической химии. 278 (6): 4103–11. Дои:10.1074 / jbc.M209832200. PMID  12446711.

дальнейшее чтение

• Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Хиросава М., Миядзима Н., Танака А., Котани Н., Номура Н., Охара О. (февраль 1999 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XIII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК исследования. 6 (1): 63–70. Дои:10.1093 / днарес / 6.1.63. PMID  10231032.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Геномные исследования. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (март 2001 г.). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геномные исследования. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO отчеты. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• де Брюйн Д.Р., дос Сантос Н.Р., Катер-Баатс Э., Тийссен Дж., ван ден Берк Л., Стап Дж., Балеманс М., Шепенс М., Мерккс Г., ван Кессель АГ (июль 2002 г.). «Связанный с раком белок SSX2 взаимодействует с человеческим гомологом Ras-подобного интерактора GTPase, RAB3IP, и новым ядерным белком SSX2IP». Гены, хромосомы и рак. 34 (3): 285–98. Дои:10.1002 / gcc.10073. PMID  12007189.
• Асада М., Ирие К., Моримото К., Ямада А., Икеда В., Такеучи М., Такай И. (февраль 2003 г.). «ADIP, новый афадин- и альфа-актинин-связывающий белок, локализованный на стыках межклеточных сращений». Журнал биологической химии. 278 (6): 4103–11. Дои:10.1074 / jbc.M209832200. PMID  12446711.
• Wiemann S, Arlt D, Huber W., Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Геномные исследования. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Гуинн Б.А., Блэнд Э.А., Лоди У., Лиггинс А.П., Тобал К., Петтерс С., Уэллс Дж. У., Банхам А. Х., Муфтий Г. Дж. (Октябрь 2005 г.). «Гуморальное обнаружение лейкозно-ассоциированных антигенов в представлении острого миелоидного лейкоза». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 335 (4): 1293–304. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.08.024. PMID  16112646.
• Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бектель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К. Х., Хубер В., Пепперкок Р., Поустка А., Виманн С. (январь 2006 г.) «База данных LIFEdb в 2006 году». Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Проблема с базой данных): D415-8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, Nigg EA, Körner R (апрель 2006 г.). «Фосфопротеомный анализ митотического веретена человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 103 (14): 5391–6. Дои:10.1073 / pnas.0507066103. ЧВК  1459365. PMID  16565220.