SSX4 (ген) - SSX4 (gene)

SSX4
Идентификаторы
Псевдонимы	SSX4, CT5.4, синовиальная саркома, точка останова 4 по X, член семейства SSX 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 300326 MGI: 2446771 ГомолоГен: 133052 Генные карты: SSX4
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xp11.23 Начинать 48,383,516 бп[1] Конец 48,393,347 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • связывание нуклеиновой кислоты Сотовый компонент • внутриклеточный • ядро клетки Биологический процесс • отрицательная регуляция транскрипции с использованием шаблона нуклеиновой кислоты • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6759	387132
Ансамбль	ENSG00000268009	ENSMUSG00000023165
UniProt	O60224	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_175729 NM_005636	NM_001001450 NM_001134226
RefSeq (белок)	NP_005627 NP_783856	н / д
Расположение (UCSC)	Chr X: 48,38 - 48,39 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок SSX4 это белок что у людей кодируется SSX4 ген.^[4]

В продукт этого гена принадлежит к семейству высокогомологичных синовиальная саркома, точка останова X (SSX) белки. Эти белки могут функционировать как транскрипционные репрессоры. Они также способны спонтанно вызывать гуморальный и клеточные иммунные ответы у онкологических больных и являются потенциально полезными мишенями в иммунотерапия на основе противораковых вакцин. SSX1, SSX2 и гены SSX4 участвовали в t (X; 18) хромосомная транслокация характерно для всех синовиальные саркомы. Эта транслокация приводит к слиянию гена транслокации синовиальной саркомы на хромосома 18 к одному из генов SSX на хромосома X. Хромосома Xp11 содержит сегментарное дублирование в результате были получены две идентичные копии синовиальной саркомы, точка разрыва X 4, SSX4 и SSX4B, в ориентации хвост к хвосту. Этот ген, SSX4, представляет собой более теломерный копия. Два варианты расшифровки кодирование различных изоформы были идентифицированы для этого гена.^[4]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000268009 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Энтрез Ген: синовиальная саркома SSX4, точка останова 4 по X».

дальнейшее чтение

• душ Сантуш Н.Р., де Брюйн Д.Р., ван Кессель АГ (2001). «Молекулярные механизмы, лежащие в основе развития синовиальной саркомы человека». Гены Хромосомы Рак. 30 (1): 1–14. Дои:10.1002 / 1098-2264 (2000) 9999: 9999 <:: AID-GCC1056> 3.0.CO; 2-G. PMID  11107170.
• Gure AO, Türeci O, Sahin U и др. (1997). «SSX: мультигенное семейство с несколькими членами, транскрибируемыми в нормальных яичках и раке человека». Int. J. Рак. 72 (6): 965–71. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-0215 ​​(19970917) 72: 6 <965 :: AID-IJC8> 3.0.CO; 2-N. PMID  9378559.
• Скайттинг Б., Нильссон Г., Бродин Б. и др. (1999). «Новый гибридный ген SYT-SSX4 в синовиальной саркоме». J. Natl. Институт рака. 91 (11): 974–5. Дои:10.1093 / jnci / 91.11.974. PMID  10359553.
• Chen CH, Chen GJ, Lee HS и др. (2001). «Экспрессия антигенов рака яичек в гепатоцеллюлярной карциноме человека». Рак Lett. 164 (2): 189–95. Дои:10.1016 / S0304-3835 (01) 00379-2. PMID  11179834.
• Бродин Б., Хаслам К., Ян К. и др. (2001). «Клонирование и характеристика сплайсированных вариантов гибридных транскриптов синовиальной саркомы: SYT / SSX4, SYT / SSX4v и SYT / SSX2v. Возможная регуляторная роль продукта гибридного гена в экспрессии SYT дикого типа». Ген. 268 (1–2): 173–82. Дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00412-7. PMID  11368913.
• Панагопулос I, Мертенс Ф., Исакссон М. и др. (2001). «Клиническое влияние молекулярных и цитогенетических данных при синовиальной саркоме». Гены Хромосомы Рак. 31 (4): 362–72. Дои:10.1002 / gcc.1155. PMID  11433527.
• де Брюйн Д.Р., дос Сантос Н.Р., Катер-Баатс Э. и др. (2002). «Связанный с раком белок SSX2 взаимодействует с человеческим гомологом Ras-подобного интерактора GTPase, RAB3IP, и новым ядерным белком SSX2IP». Гены Хромосомы Рак. 34 (3): 285–98. Дои:10.1002 / gcc.10073. PMID  12007189.
• Ян К., Луи В.О., Се И и др. (2002). «Сосуществование слияния SYT-SSX1 и SYT-SSX2 в синовиальных саркомах». Онкоген. 21 (26): 4181–90. Дои:10.1038 / sj.onc.1205569. PMID  12037676.
• Гюре А.О., Вей И.Дж., Старый ЖЖ, Чен Ю.Т. (2002). «Семейство генов SSX: характеристика 9 полных генов». Int. J. Рак. 101 (5): 448–53. Дои:10.1002 / ijc.10634. PMID  12216073.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Росс М.Т., Графхэм Д.В., Коффи А.Дж. и др. (2005). «Последовательность ДНК Х-хромосомы человека». Природа. 434 (7031): 325–37. Дои:10.1038 / природа03440. ЧВК  2665286. PMID  15772651.
• Айюб М., Мерло А., Хесдорфер С.С. и др. (2005). «CD4 + Т-клеточные ответы на SSX-4 у пациентов с меланомой». J. Immunol. 174 (8): 5092–9. Дои:10.4049 / jimmunol.174.8.5092. PMID  15814740.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.