ST6GAL1 - ST6GAL1

ST6GAL1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4JS1, 4JS2
Идентификаторы
Псевдонимы	ST6GAL1, SIAT1, ST6GalI, ST6N, ST6 бета-галактозид альфа-2,6-сиалилтрансфераза 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 109675 MGI: 108470 ГомолоГен: 2281 Генные карты: ST6GAL1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3q27.3 Начинать 186,930,502 бп[1] Конец 187,078,553 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 16 (мышь)[2] Группа 16 B1 | 16 14,03 см Начинать 23,224,740 бп[2] Конец 23,360,350 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • трансферазная активность, перенос гликозильных групп • GO: 0001948 связывание с белками • активность сиалилтрансферазы • бета-галактозид альфа-2,6-сиалилтрансферазная активность • активность гомодимеризации белков Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • аппарат Гольджи • мембрана • Мембрана цистерны Гольджи • внеклеточная область • Мембрана Гольджи Биологический процесс • сиалирование • гликозилирование белков • гуморальный иммунный ответ • О-гликановая обработка • метаболический процесс олигосахаридов • N-ацетилнейраминатный метаболический процесс • N-связанное гликозилирование белка через аспарагин Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6480	20440
Ансамбль	ENSG00000073849	ENSMUSG00000022885
UniProt	P15907	Q64685
RefSeq (мРНК)	NM_003032 NM_173216 NM_173217 NM_001353916	NM_001252505 NM_001252506 NM_145933
RefSeq (белок)	NP_003023 NP_775323 NP_775324 NP_001340845	NP_001239434 NP_001239435 NP_666045
Расположение (UCSC)	Chr 3: 186.93 - 187.08 Мб	Chr 16: 23.22 - 23.36 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Бета-галактозид альфа-2,6-сиалилтрансфераза 1 является фермент что у людей кодируется ST6GAL1 ген.^[5]

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой мембранный белок типа II, который катализирует перенос сиаловой кислоты от CMP-сиаловой кислоты к субстратам, содержащим галактозу. Кодируемый белок, который обычно находится в Гольджи но который может быть протеолитически обработан до растворимой формы, участвует в генерации углеводных детерминант клеточной поверхности и дифференцировочных антигенов HB-6, CDw75 и CD76. Этот белок является членом семейства гликозилтрансфераз 29. Для этого гена были обнаружены три варианта транскрипта, кодирующие две разные изоформы.^[6]

Транскрипты ST6GAL1 обнаруживаются в верхних эндотелиальных клетках мышей мезентериального лимфатического узла и пейеровских бляшек, и он может быть вовлечен в самонаведение В-клеток к пейеровым бляшкам.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000073849 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022885 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Grundmann U, Nerlich C, Rein T, Zettlmeissl G (апрель 1990 г.). «Полная последовательность кДНК, кодирующая человеческую бета-галактозид альфа-2,6-сиалилтрансферазу». Нуклеиновые кислоты Res. 18 (3): 667. Дои:10.1093 / nar / 18.3.667. ЧВК  333489. PMID  2408023.
6. «Энтрез Ген: ST6GAL1 ST6 бета-галактозамид альфа-2,6-сиалилтранфераза 1».
7. Ли; и другие. (Октябрь 2014 г.). «Программы транскрипции капилляров лимфоидной ткани и высокого эндотелия раскрывают механизмы контроля за хомингом лимфоцитов». Иммунология природы. 15 (10): 982–995. Дои:10.1038 / ni.2983. ЧВК  4222088. PMID  25173345.

дальнейшее чтение

• Bast BJ, Zhou LJ, Freeman GJ и др. (1992). «Дифференцирующие антигены HB-6, CDw75 и CD76 представляют собой уникальные углеводные детерминанты клеточной поверхности, генерируемые бета-галактозид-альфа-2,6-сиалилтрансферазой». J. Cell Biol. 116 (2): 423–35. Дои:10.1083 / jcb.116.2.423. ЧВК  2289289. PMID  1730763.
• Стаменкович I, Asheim HC, Deggerdal A, et al. (1990). «Антиген В-клеток CD75 представляет собой сиалитрансферазу клеточной поверхности». J. Exp. Med. 172 (2): 641–3. Дои:10.1084 / jem.172.2.641. ЧВК  2188328. PMID  2373995.
• Лэнс П., Лау К.М., Лау Дж. Т. (1989). «Выделение и характеристика частичной кДНК сиалилтрансферазы человека». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 164 (1): 225–32. Дои:10.1016 / 0006-291X (89) 91706-3. PMID  2803295.
• Rabouille C, Hui N, Hunte F, et al. (1995). «Картирование распределения ферментов Гольджи, участвующих в построении сложных олигосахаридов». J. Cell Sci. 108. (Pt 4): 1617–27. PMID  7615680.
• Бруно Н., Ломбардо Д. (1995). «Шаперонная функция белка, родственного Grp 94, для сворачивания и транспорта липазы, зависимой от солей желчных кислот поджелудочной железы». J. Biol. Chem. 270 (22): 13524–33. Дои:10.1074 / jbc.270.22.13524. PMID  7768954.
• Ван Х, Вертино А., Эдди Р.Л. и др. (1993). «Хромосомное картирование и организация гена бета-галактозид альфа 2,6-сиалилтрансферазы человека. Дифференциальное и специфическое для клеточного типа использование вышестоящих экзонных последовательностей в B-лимфобластоидных клетках». J. Biol. Chem. 268 (6): 4355–61. PMID  7786324.
• Ханасаки К., Варки А., Стаменкович И., Бевилаква МП (1994). «Цитокин-индуцированная бета-галактозид-альфа-2,6-сиалилтрансфераза в эндотелиальных клетках человека опосредует альфа-2,6-сиалирование молекул адгезии и лигандов CD22». J. Biol. Chem. 269 (14): 10637–43. PMID  8144653.
• Aasheim HC, Aas-Eng DA, Deggerdal A, et al. (1993). «Клеточно-специфическая экспрессия транскриптов человеческой бета-галактозид альфа 2,6-сиалилтрансферазы, различающихся в 5'-нетранслируемой области». Евро. J. Biochem. 213 (1): 467–75. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1993.tb17783.x. PMID  8477718.
• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Д.Ю. и др. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Сгрой Д., Нокс А., Стаменкович И. (1996). «Один сайт N-связанного гликозилирования участвует в регуляции распознавания лиганда лектинами CD22 и CD33 I-типа». J. Biol. Chem. 271 (31): 18803–9. Дои:10.1074 / jbc.271.31.18803. PMID  8702538.
• Ло Н. В., Лау Дж. Т. (1996). «Транскрипция гена бета-галактозид альфа 2,6-сиалилтрансферазы в В-лимфоцитах направляется отдельным и отличным промотором». Гликобиология. 6 (3): 271–9. Дои:10.1093 / гликоб / 6.3.271. PMID  8724135.
• Ло Н. В., Лау Дж. Т. (1996). «Новая гетерогенность существует в 5'-нетранслируемой области мРНК бета-галактозид альфа 2,6-сиалитрансферазы в линии B-лимфобластоидных клеток человека, Louckes». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 228 (2): 380–5. Дои:10.1006 / bbrc.1996.1670. PMID  8920923.
• Цуджи С., Датта А.К., Полсон Дж. К. (1997). «Систематическая номенклатура сиалилтрансфераз». Гликобиология. 6 (7): v – vii. Дои:10.1093 / гликоб / 6.7.647. PMID  8953271.
• Ма Дж., Цянь Р., Рауса FM, Колли К.Дж. (1997). «Две встречающиеся в природе формы альфа2,6-сиалилтрансферазы с одной заменой аминокислоты в каталитическом домене различаются по своей каталитической активности и протеолитическому процессингу». J. Biol. Chem. 272 (1): 672–9. Дои:10.1074 / jbc.272.1.672. PMID  8995311.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С. и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Ло Н. В., Лау Дж. Т. (1999). «Транскрипция гена бета-галактозид альфа2,6-сиалилтрансферазы (SIAT1) в B-лимфоцитах: экспрессия, специфичная для клеточного типа, коррелирует с присутствием дивергентной 5'-нетранслируемой последовательности». Гликобиология. 9 (9): 907–14. Дои:10,1093 / гликоб / 9.9.907. PMID  10460832.
• Ларой В., Амелут П., Контрерас Р. (2001). «Характеристика мутантов сиалилтрансферазы с использованием поверхностного плазмонного резонанса». Гликобиология. 11 (3): 175–82. Дои:10.1093 / гликоб / 11.3.175. PMID  11320056.
• Цянь Р., Чен С., Колли К.Дж. (2001). «Расположение и механизм образования димера альфа 2,6-сиалилтрансферазы. Роль остатков цистеина в димеризации фермента, локализации, активности и процессинга». J. Biol. Chem. 276 (31): 28641–9. Дои:10.1074 / jbc.M103664200. PMID  11356854.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Сабо Р., Скропета Д. и др. (2017). «Развитие ингибиторов сиалилтрансферазы: терапевтические проблемы и возможности». Med. Res. Rev. 37 (2): 210–270. Дои:10.1002 / med.21407. PMID  27678392. S2CID  26280291.