STAMBPL1 - STAMBPL1

STAMBPL1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2ZNR, 2ZNV
Идентификаторы
Псевдонимы	STAMBPL1, ALMalpha, AMSH-FP, AMSH-LP, bA399O19.2, связывающий белок STAM, такой как 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 612352 MGI: 1923880 ГомолоГен: 23253 Генные карты: STAMBPL1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10q23.31 Начинать 88,879,734 бп[1] Конец 88,975,153 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 | 19 C1 Начинать 34,192,229 бп[2] Конец 34,240,333 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • пептидазная активность • GO: 0001948 связывание с белками • гидролазная активность • металлопептидазная активность • связывание ионов металлов • Lys63-специфическая активность деубиквитиназы • тиол-зависимая убиквитин-специфическая протеазная активность Сотовый компонент • мембрана • цитозоль • эндосома Биологический процесс • протеолиз • деубиквитинирование белков • деубиквитинирование, связанное с белком K63 Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	57559	76630
Ансамбль	ENSG00000138134	ENSMUSG00000024776
UniProt	Q96FJ0	Q76N33
RefSeq (мРНК)	NM_020799	NM_029682 NM_001360716 NM_001360717 NM_001360718 NM_001360719 NM_001360720
RefSeq (белок)	NP_065850	NP_083958 NP_001347645 NP_001347646 NP_001347647 NP_001347648 NP_001347649
Расположение (UCSC)	Chr 10: 88,88 - 88,98 Мб	Chr 19: 34.19 - 34.24 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

AMSH-подобная протеаза является фермент что у людей кодируется STAMBPL1 ген.^[5][6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000138134 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024776 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Кикучи К., Исии Н., Асао Х., Сугамура К. (июнь 2003 г.). «Идентификация AMSH-LP, содержащего металлоферментный мотив домена Jab1 / MPN». Biochem Biophys Res Commun. 306 (3): 637–43. Дои:10.1016 / S0006-291X (03) 01009-X. PMID  12810066.
6. Китадзима К., Мацумото К., Тахара М., Такахаши Х., Накамура Т., Накамура Т. (август 2003 г.). «Недавно идентифицированный белок семейства AMSH специфически экспрессируется на гаплоидных стадиях тестикулярных половых клеток». Biochem Biophys Res Commun. 309 (1): 135–42. Дои:10.1016 / S0006-291X (03) 01550-X. PMID  12943674.
7. «Ген Entrez: STAMBPL1, подобный STAM-связывающему белку 1».

дальнейшее чтение

• Нагасе Т., Кикуно Р., Исикава К.И. и др. (2000). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XVI. Полные последовательности 150 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 7 (1): 65–73. Дои:10.1093 / днарес / 7.1.65. PMID  10718198.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Ибаррола Н., Кратчмарова И., Накадзима Д. и др. (2004). «Клонирование новой сигнальной молекулы, AMSH-2, которая усиливает передачу сигналов трансформирующего фактора роста бета». BMC Cell Biol. 5: 2. Дои:10.1186/1471-2121-5-2. ЧВК  385422. PMID  14728725.
• Ли Х, Сет А (2004). «Комплекс RNF11: Smurf2 опосредует убиквитинирование белка AMSH». Онкоген. 23 (10): 1801–8. Дои:10.1038 / sj.onc.1207319. PMID  14755250.
• Делукас П., Earthrowl ME, Grafham DV, et al. (2004). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 10 человека». Природа. 429 (6990): 375–81. Дои:10.1038 / природа02462. PMID  15164054.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Накамура М., Танака Н., Китамура Н., Комада М. (2006). «Клатрин закрепляет деубиквитинирующие ферменты, AMSH и AMSH-подобный белок, на ранних эндосомах». Гены Клетки. 11 (6): 593–606. Дои:10.1111 / j.1365-2443.2006.00963.x. PMID  16716190. S2CID  30077507.
• Рейес-Ибарра А.П., Гарсия-Регаладо А., Рамирес-Рангель I и др. (2007). «Эндоцитоз рецептора, чувствительного к кальцию, связывает внеклеточную передачу сигналов кальция с секрецией пептидов, связанных с паратироидным гормоном, через Rab11a-зависимый и AMSH-чувствительный механизм». Мол. Эндокринол. 21 (6): 1394–407. Дои:10.1210 / me.2006-0523. PMID  17426287.