STAP1 - STAP1

STAP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1X1F, 3MAZ
Идентификаторы
Псевдонимы	STAP1, BRDG1, STAP-1, член 1 семейства адаптеров для передачи сигналов
Внешние идентификаторы	OMIM: 604298 MGI: 1926193 ГомолоГен: 8103 Генные карты: STAP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4q13.2 Начинать 67,558,727 бп[1] Конец 67,607,337 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 E1 Начинать 86,071,746 бп[2] Конец 86,106,125 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание рецептора колониестимулирующего фактора макрофагов • активность адаптера трансмембранного рецептора протеина тирозинкиназы • связывание остатков фосфотирозина • связывание рецепторной тирозинкиназы • GO: 0001948 связывание с белками • связывание фосфолипидов • связывание протеинкиназы • сигнальный адаптер активности Сотовый компонент • цитоплазма • митохондрия • ядро клетки • нуклеоплазма • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • положительная регуляция сигнального пути рецептора В-клеток • положительная регуляция фагоцитоза, поглощения • сигнальный путь трансмембранного рецептора протеина тирозинкиназы • отрицательное регулирование сборки оборок • положительная регуляция цитотоксичности, опосредованной микроглиальными клетками • положительная регуляция немембранной активности протеинтирозинкиназы • отрицательная регуляция миграции клеток микроглии • положительная регуляция экспрессии генов • положительная регуляция активации клеток микроглии • отрицательная регуляция фосфорилирования • клеточный ответ на липополисахарид • отрицательная регуляция сигнального пути колониестимулирующего фактора макрофагов • положительная регуляция реорганизации актинового цитоскелета • отрицательная регуляция хемотаксиса макрофагов • реакция на бактерии Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	26228	56792
Ансамбль	ENSG00000035720	ENSMUSG00000029254
UniProt	Q9ULZ2	Q9JM90
RefSeq (мРНК)	NM_012108 NM_001317769	NM_019992 NM_001310639
RefSeq (белок)	NP_001304698 NP_036240	NP_001297568 NP_064376
Расположение (UCSC)	Chr 4: 67,56 - 67,61 Мб	Chr 5: 86.07 - 86.11 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Адаптерный белок 1, передающий сигнал это белок что у людей кодируется STAP1 ген.^[5][6][7]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, функционирует как стыковочный белок, действующий ниже тирозинкиназы Tec в передаче сигналов рецептора антигена В-клеток. Белок непосредственно фосфорилируется Tec in vitro, где он участвует в положительный отзыв петля, увеличивающая активность Tec. Ортолог мыши, адаптерный белок 1 стволовых клеток, на 83% идентичен своему человеческому аналогу.^[7]

Взаимодействия

STAP1 был показан взаимодействовать с C19orf2.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000035720 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029254 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Охя К., Кадзигая С., Китанака А., Ёсида К., Миядзато А., Ямасита Ю., Яманака Т., Икеда У, Шимада К., Одзава К., Мано Х. (ноябрь 1999 г.). «Молекулярное клонирование стыковочного белка BRDG1, который действует ниже тирозинкиназы Tec». Proc Natl Acad Sci U S A. 96 (21): 11976–81. Дои:10.1073 / пнас.96.21.11976. ЧВК  18397. PMID  10518561.
6. Масухара М., Нагао К., Нисикава М., Сасаки М., Йошимура А., Осава М. (март 2000 г.). «Молекулярное клонирование мышиного STAP-1, адапторного белка, специфичного для стволовых клеток, содержащего домены PH и SH2». Biochem Biophys Res Commun. 268 (3): 697–703. Дои:10.1006 / bbrc.2000.2223. PMID  10679268.
7. "Ген Entrez: BRDG1 BCR, нижестоящая передача сигналов 1".
8. Gstaiger M, Luke B, Hess D, Oakeley EJ, Wirbelauer C, Blondel M, Vigneron M, Peter M, Krek W. (ноябрь 2003 г.). «Контроль программ транскрипции, чувствительных к питательным веществам, с помощью нетрадиционного префолдинового URI». Наука. 302 (5648): 1208–12. Дои:10.1126 / science.1088401. PMID  14615539. S2CID  26836888.

дальнейшее чтение

• Куросаки Т. (1999). «Генетический анализ передачи сигналов рецептора антигена В-клеток». Анну. Преп. Иммунол. 17 (1): 555–92. Дои:10.1146 / annurev.immunol.17.1.555. PMID  10358768.
• Харрингтон Дж. Дж., Шерф Б., Рандлетт С., Джексон П. Д., Перри Р., Каин С., Левенталь К., Торнтон М., Рамачандран Р., Уиттингтон Дж., Лернер Л., Костанцо Д., Макэллиготт К., Бузер С., Мэйс Р., Смит Е., Велозо Н. , Klika A, Hess J, Cothren K, Lo K, Offenbacher J, Danzig J, Ducar M (2001). «Создание полногеномных библиотек экспрессии белков с использованием случайной активации экспрессии генов». Nat. Биотехнология. 19 (5): 440–5. Дои:10.1038/88107. PMID  11329013. S2CID  25064683.
• Йокохари К., Ямасита Й, Окада С., Охя К., Ода С., Хатано М., Мано Х., Хирасава Х., Токухиса Т. (2002). «Изоформ-зависимое взаимодействие BRDG1 с киназой Tec». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 289 (2): 414–20. Дои:10.1006 / bbrc.2001.6008. PMID  11716489.
• Миногути М., Миногути С., Аки Д., Джу А., Ямамото Т., Юмиока Т., Мацуда Т., Йошимура А. (2003). «STAP-2 / BKS, адаптер / стыковочный белок, модулирует активацию STAT3 в острой фазе ответа через свой мотив YXXQ». J. Biol. Chem. 278 (13): 11182–9. Дои:10.1074 / jbc.M211230200. PMID  12540842.
• Ма Дж., Демпси А.А., Стаматиу Д., Маршалл К.В., Лью С.К. (2007). «Определение паттернов экспрессии лейкоцитарных генов, связанных с уровнями липидов в плазме у людей». Атеросклероз. 191 (1): 63–72. Дои:10.1016 / j.atherosclerosis.2006.05.032. PMID  16806233.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Биотехнология. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.