SUMO4 - SUMO4

SUMO4
Идентификаторы
ПсевдонимыSUMO4, IDDM5, SMT3H4, SUMO-4, dJ281H8.4, малый убиквитиноподобный модификатор 4, малый убиквитиноподобный модификатор 4
Внешние идентификаторыOMIM: 608829 ГомолоГен: 88399 Генные карты: SUMO4
Расположение гена (человек)
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человек)[1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение SUMO4
Геномное расположение SUMO4
Группа6q25.1Начните149,400,262 бп[1]
Конец149,401,278 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE SUMO4 215452 x at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez

387082

н / д

Ансамбль

ENSG00000177688

н / д

UniProt

Q6EEV6

н / д

RefSeq (мРНК)

NM_001002255

н / д

RefSeq (белок)

NP_001002255

н / д

Расположение (UCSC)Chr 6: 149,4 - 149,4 Мбн / д
PubMed поиск[2]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Малый модификатор, связанный с убиквитином 4 это белок что у людей кодируется SUMO4 ген.[3][4]

Функция

Этот ген является членом семейства генов SUMO. Это семейство генов кодирует небольшие связанные с убиквитином модификаторы, которые прикрепляются к белкам и контролируют субклеточную локализацию, стабильность или активность целевых белков. Белок, описанный в этой записи, расположен в цитоплазме и специфически модифицирует IKBA, что приводит к отрицательной регуляции NF-каппа-B-зависимой транскрипции IL12B ген. Специфический полиморфизм в этом гене SUMO, который приводит к замене M55V, был связан с диабетом I типа. RefSeq содержит этот полиморфизм.[4]

Взаимодействия

SUMO4 был показан взаимодействовать с участием IκBα.[5]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000177688 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ Борен К.М., Надкарни В., Сонг Дж. Х., Габбай К. Х., Овербах Д. (июнь 2004 г.). «Полиморфизм M55V в новом гене SUMO (SUMO-4) дифференциально активирует факторы транскрипции теплового шока и связан с восприимчивостью к сахарному диабету I типа». Журнал биологической химии. 279 (26): 27233–8. Дои:10.1074 / jbc.M402273200. PMID  15123604.
  4. ^ а б "Ген Entrez: SUMO4 SMT3 супрессор mif two 3 гомолог 4 (S. cerevisiae)".
  5. ^ Го Д., Ли М., Чжан И, Ян П., Экенроде С., Хопкинс Д., Чжэн В., Пурохит С., Подольски Р. Х., Мюир А., Ван Дж., Донг З., Бруско Т., Аткинсон М., Поццилли П., Зейдлер А., Раффель Л. Дж. , Джейкоб КО, Пак Й, Серрано-Риос М., Ларрад М. Т., Чжан З., Гарчон Х. Дж., Бах Дж. Ф., Роттер Дж. И., Ше Дж. X, Ван Си (август 2004 г.). «Функциональный вариант SUMO4, нового альфа-модификатора I каппа B, связан с диабетом 1 типа». Природа Генетика. 36 (8): 837–41. Дои:10,1038 / ng1391. PMID  15247916. S2CID  41123857.

дальнейшее чтение

  • Ван CY, Подольский R, She JX (октябрь 2006 г.). «Генетические и функциональные данные, подтверждающие, что SUMO4 является геном предрасположенности к диабету 1 типа». Летопись Нью-Йоркской академии наук. 1079 (1): 257–67. Bibcode:2006НЯСА1079..257Вт. Дои:10.1196 / летопись.1375.039. PMID  17130563. S2CID  20462827.
  • Дэвис Дж. Л., Кавагути Ю., Беннет С. Т., Копман Дж. Б., Корделл Х. Дж., Притчард Л. Е., Рид П. У., Гоф С. К., Дженкинс СК, Палмер С. М. (сентябрь 1994 г.). «Полногеномный поиск генов восприимчивости человека к диабету 1 типа». Природа. 371 (6493): 130–6. Bibcode:1994Натура.371..130D. Дои:10.1038 / 371130a0. PMID  8072542. S2CID  4275341.
  • Луо Д.Ф., Баззетти Р., Роттер Д.И., Макларен Н.К., Раффель Л.Дж., Нистико Л., Джованнини С., Поццилли П., Томсон Дж., Ши Дж. X (май 1996 г.). «Подтверждение трех генов восприимчивости к инсулинозависимому сахарному диабету: IDDM4, IDDM5 и IDDM8». Молекулярная генетика человека. 5 (5): 693–8. Дои:10,1093 / hmg / 5.5.693. PMID  8733139.
  • Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK, Edwards CA, Ashurst JL, Wilming L, Jones MC, Horton R, Hunt SE, Scott CE, Gilbert JG, Clamp ME, Bethel G, Milne S, Ainscough R, Almeida JP, Ambrose KD , Эндрюс Т.Д., Эшвелл Р.И., Бэббидж А.К., Баггули С.Л., Бейли Дж., Банерджи Р., Баркер Д.Д., Барлоу К.Ф., Бейтс К., Биэр ДМ, Бисли Х., Бисли О., Берд С.П., Блейки С., Брей-Аллен С., Брук Дж. , Brown AJ, Brown JY, Burford DC, Burrill W, Burton J, Carder C, Carter NP, Chapman JC, Clark SY, Clark G, Clee CM, Clegg S, Cobley V, Collier RE, Collins JE, Colman LK, Corby NR, Coville GJ, Culley KM, Dhami P, Davies J, Dunn M, Earthrowl ME, Ellington AE, Evans KA, Faulkner L, Francis MD, Frankish A, Frankland J, French L, Garner P, Garnett J, Ghori MJ, Гилби Л.М., Гилсон С.Дж., Глитеро Р.Дж., Грэфхэм Д.В., Грант М., Гриббл С., Гриффитс К., Гриффитс М., Холл Р., Холлс К.С., Хаммонд С., Харли Д.Л., Харт Э.А., Хит П.Д., Хиткотт Р., Холмс С.Дж., Хауден П.Дж. , Хоу К.Л., Хауэлл Г.Р., Хакл Э., Хамфрей С.Дж., Хамфрис, доктор медицины, Хант А.Р., Джонсон С.М., Джой А.А., Кей М., Кин SJ, Kimberley AM, King A, Laird GK, Langford C, Lawlor S, Leongamornlert DA, Leversha M, Lloyd CR, Lloyd DM, Loveland JE, Lovell J, Martin S, Mashreghi-Mohammadi M, Maslen GL, Matthews L, Макканн О.Т., Макларен С.Дж., Маклей К., МакМюррей А., Мур М.Дж., Малликин Д.К., Ниблетт Д., Никерсон Т., Новик К.Л., Оливер К., Овертон-Ларти Е.К., Паркер А., Патель Р., Пирс А.В., Пек А.И., Филлимор Б. Phillips S, Plumb RW, Porter KM, Ramsey Y, Ranby SA, Rice CM, Ross MT, Searle SM, Sehra HK, Sheridan E, Skuce CD, Smith S, Smith M, Spraggon L, Squares SL, Steward CA, Sycamore N , Tamlyn-Hall G, Tester J, Theaker AJ, Thomas DW, Thorpe A, Tracey A, Tromans A, Tubby B, Wall M, Wallis JM, West AP, White SS, Whitehead SL, Whittaker H, Wild A, Willey DJ , Уилмер Т.Э., Вуд Дж. М., Рэй П. У., Вятт Дж. К., Янг Л., Янгер Р. М., Бентли Д. Р., Коулсон А., Дурбин Р., Хаббард Т., Сулстон Дж. Э., Данхэм И., Роджерс Дж., Бек С. (октябрь 2003 г.). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003Натура.425..805М. Дои:10.1038 / природа02055. PMID  14574404.
  • Го Д., Ли М., Чжан И, Янг П., Экенроде С., Хопкинс Д., Чжэн В., Пурохит С., Подольски Р. Х., Мюр А., Ван Дж., Донг З., Бруско Т., Аткинсон М., Поццилли П., Зейдлер А., Раффель Л. Дж. , Джейкоб КО, Пак Й, Серрано-Риос М., Ларрад М. Т., Чжан З., Гарчон Х. Дж., Бах Дж. Ф., Роттер Дж. И., Ше Дж. X, Ван Си (август 2004 г.). «Функциональный вариант SUMO4, нового альфа-модификатора I каппа B, связан с диабетом 1 типа». Природа Генетика. 36 (8): 837–41. Дои:10,1038 / ng1391. PMID  15247916. S2CID  41123857.
  • Smyth DJ, Howson JM, Lowe CE, Walker NM, Lam AC, Nutland S, Hutchings J, Tuomilehto-Wolf E, Tuomilehto J, Guja C, Ionescu-Tîrgoviste C, Undlien DE, Rønningen KS, Savage D, Dunger DB, Twells RC, Макардл В.Л., Страчан Д.П., Тодд Дж. А. (февраль 2005 г.). «Оценка достоверности связи между вариантом SUMO4 M55V и риском диабета 1 типа». Природа Генетика. 37 (2): 110–1, ответ автора 112–3. Дои:10.1038 / ng0205-110. PMID  15678134. S2CID  33336557.
  • Ку Х, Бхарадж Б., Лю XQ, Кертис Дж. А., Ньюхук Л. А., Патерсон А. Д., Хадсон Т. Дж., Полихронакос С. (февраль 2005 г.). «Оценка достоверности связи между вариантом SUMO4 M55V и риском диабета 1 типа». Природа Генетика. 37 (2): 111–2, ответ автора 112–3. Дои:10.1038 / ng0205-111. PMID  15678135.
  • Park Y, Park S, Kang J, Yang S, Kim D (февраль 2005 г.). «Оценка достоверности связи между вариантом SUMO4 M55V и риском диабета 1 типа». Природа Генетика. 37 (2): 112, ответ автора 112–3. Дои:10.1038 / ng0205-112a. PMID  15678137. S2CID  30406915.
  • Owerbach D, McKay EM, Yeh ET, Gabbay KH, Bohren KM (ноябрь 2005 г.). «Остаток пролина-90, уникальный для SUMO-4, предотвращает созревание и сумоилирование». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 337 (2): 517–20. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.09.090. PMID  16198310.
  • Гуо Д., Хан Дж., Адам Б.Л., Колберн Н.Х., Ван М.Х., Донг З., Эйзирик Д.Л., Ше Дж. Х., Ван Си (декабрь 2005 г.). «Протеомный анализ субстратов SUMO4 в клетках HEK293 в условиях стресса, вызванного сывороточным голоданием». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 337 (4): 1308–18. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.09.191. PMID  16236267.
  • Носо С., Икегами Х, Фудзисава Т., Кавабата И., Асано К., Хиромине Ю., Цурумару М., Сугихара С., Ли И., Кавасаки Е., Авата Т., Огихара Т. (декабрь 2005 г.). «Генетическая гетерогенность в связи с вариантом SUMO4 M55V с предрасположенностью к диабету 1 типа». Сахарный диабет. 54 (12): 3582–6. Дои:10.2337 / диабет.54.12.3582. PMID  16306380.
  • Цурумару М., Кавасаки Е., Ида Х, Мигита К., Мориучи А., Фукусима К., Фукусима Т, Абиру Н., Ямасаки Х, Носо С., Икегами Х, Авата Т, Сасаки Х, Егучи К. (август 2006 г.). «Доказательства роли небольшого убиквитин-подобного модификатора 4 в качестве общего локуса аутоиммунитета в популяции Японии». Журнал клинической эндокринологии и метаболизма. 91 (8): 3138–43. Дои:10.1210 / jc.2006-0206. PMID  16735488.
  • Костас Дж., Перес-Пампин Э., Феррейрос-Видаль I, Торрес М., Филлипс К., Викарио Дж. Л., Паблос Дж. Л., Карраседо А., Гомес-Рейно Дж. Дж., Гонсалес А. (июнь 2006 г.). «Однонуклеотидные полиморфизмы SUMO4 и MAP3K7IP2 и предрасположенность к ревматоидному артриту». Журнал ревматологии. 33 (6): 1048–51. PMID  16755651.
  • Седимби СК, Шастри А., Парк Y, Румба I, Сандживи CB (октябрь 2006 г.). «Связь полиморфизма SUMO4 M55V с аутоиммунным диабетом у латвийских пациентов». Летопись Нью-Йоркской академии наук. 1079 (1): 273–7. Bibcode:2006НЯСА1079..273С. Дои:10.1196 / летопись.1375.041. PMID  17130565. S2CID  22345614.
  • Лин Х.Й., Ван Х.Л., Сяо П.Дж., Лю Ю.К., Чен С.И., Линь К.Д., Синь С.К., Се М.К., Шин С.Дж. (апрель 2007 г.). «Вариант SUMO4 M55V связан с диабетической нефропатией при диабете 2 типа». Сахарный диабет. 56 (4): 1177–80. Дои:10.2337 / db06-1283. PMID  17229939.
  • Седимби СК, Канунго А., Шастри А., Парк Y, Сандживи CB (апрель 2007 г.). «Отсутствие связи SUMO4 M55V с аутоиммунным диабетом у азиатско-индийских пациентов». Международный журнал иммуногенетики. 34 (2): 137–42. Дои:10.1111 / j.1744-313X.2007.00668.x. PMID  17373940. S2CID  10433791.
  • Носо С., Фудзисава Т., Кавабата Ю., Асано К., Хиромин Ю., Фукаи А., Огихара Т., Икегами Х. (июнь 2007 г.). «Ассоциация варианта малого убиквитин-подобного модификатора 4 (SUMO4), расположенного в локусе IDDM5, с диабетом 2 типа в популяции Японии». Журнал клинической эндокринологии и метаболизма. 92 (6): 2358–62. Дои:10.1210 / jc.2007-0031. PMID  17374705.
  • Борен К.М., Габбай К.Х., Овербах Д. (август 2007 г.). «Аффинная хроматография нативных белков SUMO с использованием His-меченного рекомбинантного UBC9, связанного со смолой талона, заряженной Co2 +». Экспрессия и очистка белков. 54 (2): 289–94. Дои:10.1016 / j.pep.2007.03.013. PMID  17459725.