SUPT6H - SUPT6H

SUPT6H
Идентификаторы
Псевдонимы	SUPT6H, SPT6, SPT6H, emb-5, гомолог SPT6, гистоновый шаперон, гомолог SPT6, гистоновый шаперон и фактор элонгации транскрипции
Внешние идентификаторы	OMIM: 601333 MGI: 107726 ГомолоГен: 40661 Генные карты: SUPT6H
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q11.2 Начинать 28,662,198 бп[1] Конец 28,702,679 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 B5 | 11 46,74 см Начинать 78,206,746 бп[2] Конец 78,245,987 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • связывание гистонов • GO: 0001948 связывание с белками • связывание нуклеиновой кислоты • связывание нуклеосом • Связывание РНК Сотовый компонент • ядро клетки • нуклеоплазма • комплекс факторов элонгации транскрипции • транскрипционно активный хроматин Биологический процесс • ремоделирование хроматина • отрицательная регуляция метилирования гистона H3-K27 • транспорт мРНК • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция дифференцировки мышечных клеток • регуляция экспорта мРНК из ядра • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • обработка мРНК • регуляция ДНК-шаблонной транскрипции, элонгации • транскрипция, ДНК-шаблон • Сплайсинг РНК • регуляция переключения изотипа • GO: 0022415 вирусный процесс • метаболический процесс соединений, содержащих азотистые основания • положительная регуляция элонгации транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • подавление хроматина • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • элонгация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • нуклеосомная организация • транскрипция мРНК с промотора РНК-полимеразы II • регуляция обработки мРНК • содержание хроматина • транспорт • образование бластоцисты Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6830	20926
Ансамбль	ENSG00000109111	ENSMUSG00000002052
UniProt	Q7KZ85	Q62383
RefSeq (мРНК)	NM_003170 NM_001320755	NM_009297
RefSeq (белок)	NP_001307684 NP_003161	NP_033323
Расположение (UCSC)	Chr 17: 28.66 - 28.7 Мб	Chr 11: 78.21 - 78.25 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор элонгации транскрипции SPT6 это белок что у людей кодируется SUPT6H ген.^[5][6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000109111 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000002052 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Chiang PW, Wang S, Smithivas P, Song WJ, Ramamoorthy S, Hillman J, Puett S, Van Keuren ML, Crombez E, Kumar A, Glover TW, Miller DE, Tsai CH, Blackburn CC, Chen XN, Sun Z, Cheng Дж. Ф., Коренберг-младший, Курнит Д. М. (сентябрь 1996 г.). «Идентификация и анализ предполагаемого регулятора структуры хроматина человека и мыши SUPT6H и Supt6h». Геномика. 34 (3): 328–33. Дои:10.1006 / geno.1996.0294. PMID  8786132.
6. «Ген Entrez: супрессор SUPT6H гомолога Ty 6 (S. cerevisiae)».

дальнейшее чтение

• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Д.Ю. и др. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Нагасе Т., Секи Н., Исикава К. и др. (1996). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. V. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0161-KIAA0200), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК Res. 3 (1): 17–24. Дои:10.1093 / dnares / 3.1.17. PMID  8724849.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С. и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Чанг П.В., Стаббс Л., Чжан Л., Курнит Д.М. (1998). «Выделение мышиного гомолога SPT5: завершение выделения и характеристики человеческих и мышиных гомологов структурного белкового комплекса дрожжевого хроматина SPT4, SPT5 и SPT6». Геномика. 47 (3): 426–8. Дои:10.1006 / geno.1997.5137. PMID  9480761.
• Wu-Baer F, Lane WS, Gaynor RB (1998). «Роль человеческого гомолога дрожжевого фактора транскрипции SPT5 в активации Tat ВИЧ-1». J. Mol. Биол. 277 (2): 179–97. Дои:10.1006 / jmbi.1997.1601. PMID  9514752.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Эндох М., Чжу В., Хасегава Дж. И др. (2004). «Человеческий Spt6 стимулирует удлинение транскрипции с помощью РНК-полимеразы II in vitro». Мол. Клетка. Биол. 24 (8): 3324–36. Дои:10.1128 / MCB.24.8.3324-3336.2004. ЧВК  381665. PMID  15060154.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.