SUV420H1 - SUV420H1

КМТ5Б
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3С8П
Идентификаторы
Псевдонимы	КМТ5Б, CGI85, CGI-85, SUV420H1, лизинметилтрансфераза 5B, MRD51
Внешние идентификаторы	OMIM: 610881 MGI: 2444557 ГомолоГен: 32351 Генные карты: КМТ5Б
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q13.2 Начинать 68,154,863 бп[1] Конец 68,213,828 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 | 19 А Начинать 3,767,421 бп[2] Конец 3,818,303 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность метилтрансферазы • трансферазная активность • активность гистонметилтрансферазы (специфическая для H4-K20) • активность гистон-лизин N-метилтрансферазы • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • конденсированная ядерная хромосома, центромерная область • хромосома • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • триметилирование гистона H4-K20 • развитие мышечных органов • метилирование гистонов • метилирование • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • организация хроматина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51111	225888
Ансамбль	ENSG00000110066	ENSMUSG00000045098
UniProt	Q4FZB7	Q3U8K7
RefSeq (мРНК)	NM_001300907 NM_001300908 NM_001300909 NM_016028 NM_017635 NM_001363566	NM_001167884 NM_001167885 NM_001167886 NM_001167887 NM_001167888 NM_001167889 NM_144871 NM_001379678 NM_001379679 NM_001379680
RefSeq (белок)	NP_001287836 NP_001287837 NP_001287838 NP_057112 NP_060105 NP_001350495 NP_001356353 NP_001356354 NP_001356355 NP_001356356 NP_001356357 NP_001356358 NP_001356359 NP_001356360 NP_001356361 NP_001356362	NP_001161356 NP_001161357 NP_001161358 NP_001161359 NP_001161360 NP_001161361 NP_659120 NP_001366607 NP_001366608 NP_001366609
Расположение (UCSC)	Chr 11: 68.15 - 68.21 Мб	Chr 19: 3.77 - 3.82 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гистон-лизин-N-метилтрансфераза SUV420H1 является фермент что у людей кодируется SUV420H1 ген.^[5][6][7] Фермент вместе с WHSC1 отвечает за диметилирование лизина 20 на гистоне 4 у мышей и людей.^[8][9]

Этот ген кодирует белок который содержит домен SET. Домены SET, по-видимому, представляют собой домены межбелкового взаимодействия, которые опосредуют взаимодействия с семейством белков, которые проявляют сходство с фосфатазами с двойной специфичностью (dsPTPases). Функция этого гена не определена. Для этого гена были обнаружены два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000110066 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000045098 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Лай Ч., Чжоу Ц.Й., Чан ЛЙ, Лю Ц.С., Лин В. (август 2000 г.). «Идентификация новых эволюционно консервативных генов человека у Caenorhabditis elegans с помощью сравнительной протеомики». Genome Res. 10 (5): 703–13. Дои:10.1101 / гр.10.5.703. ЧВК  310876. PMID  10810093.
6. Twells RC, Metzker ML, Brown SD, Cox R, Garey C, Hammond H, Hey PJ, Levy E, Nakagawa Y, Philips MS, Todd JA, Hess JF (июнь 2001 г.). «Последовательность и характеристика гена области-кандидата в 400 т.п.н. для IDDM4 на хромосоме 11q13». Геномика. 72 (3): 231–42. Дои:10.1006 / geno.2000.6492. PMID  11401438.
7. "Ген Entrez: SUV420H1 супрессор пестролистности 4-20 гомолог 1 (Drosophila)".
8. Schotta G, Sengupta R, Kubicek S, Malin S, Kauer M, Callén E, Celeste A, Pagani M, Opravil S, De La Rosa-Velazquez IA, Espejo A, Bedford MT, Nussenzweig A, Busslinger M, Jenuwein T (2008 г. ). «Переход всего хроматина к монометилированию H4K20 нарушает целостность генома и запрограммированные перестройки ДНК у мышей». Genes Dev. 22 (15): 2048–61. Дои:10.1101 / gad.476008. ЧВК  2492754. PMID  18676810.
9. Пей Х, Чжан Л., Ло К., Цинь И, Чеси М., Фей Ф, Бергсагель П.Л., Ван Л., Ю З, Лу З (2011). «MMSET регулирует метилирование гистона H4K20 и накопление 53BP1 в местах повреждения ДНК». Природа. 470 (7332): 124–8. Дои:10.1038 / природа09658. ЧВК  3064261. PMID  21293379.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Трындяк В.П., Ковальчук О.А., Погрибный И.П. (2006). «Потеря метилирования ДНК и триметилирование гистона H4 лизина 20 в клетках рака груди человека связано с аберрантной экспрессией ДНК-метилтрансферазы 1, гистон-метилтрансферазы Suv4-20h2 и метил-связывающих белков». Cancer Biol. Ther. 5 (1): 65–70. Дои:10.4161 / cbt.5.1.2288. PMID  16322686.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.