Сарколипин - Sarcolipin

SLN
Доступные конструкции PDB Поиск Human UniProt: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1JDM
Идентификаторы
Псевдонимы	SLN, сарколипин
Внешние идентификаторы	OMIM: 602203 Генные карты: SLN
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q22.3 Начинать 107,707,378 бп[1] Конец 107,719,693 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание АТФазы • GO: 0048551 активность ингибитора фермента • GO: 0010576 ферментный регулятор активности • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • эндоплазматический ретикулум • мембрана саркоплазматического ретикулума • саркоплазматический ретикулум Биологический процесс • положительное регулирование деполимеризации белков • отрицательная регуляция разборки белкового комплекса • отрицательная регуляция связывания ионов кальция • регулирование транспорта ионов кальция • GO: 0048553 отрицательная регуляция каталитической активности • отрицательная регуляция активности трансмембранного переносчика ионов кальция • транспорт ионов кальция • отрицательное регулирование импорта ионов кальция • транспорт ионов кальция саркоплазматический ретикулум • регуляция расслабления мышц • регуляция активности кальций-транспортной АТФазы • положительное регулирование термогенеза, вызванного холодом Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6588	н / д
Ансамбль	ENSG00000170290	н / д
UniProt	O00631	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_003063	н / д
RefSeq (белок)	NP_003054	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 11: 107.71 - 107.72 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Сарколипин это микропептид белок что у людей кодируется SLN ген.^[3][4]

Функция

Саркоплазматический ретикулум Ca²⁺-АТФазы являются трансмембранными белками, которые катализируют АТФ -зависимый транспорт Ca²⁺ из цитозоля в просвет саркоплазматического ретикулума в мышечных клетках. Ген SLN кодирует небольшой трансмембранный протеолипид, который регулирует несколько Са саркоплазматического ретикулума.²⁺-АТФазы за счет уменьшения накопления Са²⁺ в саркоплазматическом ретикулуме, не влияя на скорость гидролиза АТФ.^[4]

Удаление сарколипина увеличивает предсердный Ca²⁺ переходные амплитуды и усиленные предсердный сократимость. Кроме того, предсердия из сарколипина -нулевые мыши затупили ответ на изопротеренол стимуляции, вовлекая сарколипин в качестве медиатора бета-адренергический отзывы в предсердиях.^[5]Недавно было показано, что SLN является важным медиатором термогенеза, основанного на мышцах, и потеря сарколипина предрасполагает мышей к ожирению, вызванному диетой, что предполагает его роль в энергетическом метаболизме и регуляции набора веса. ^[6]

Взаимодействия

Было показано, что SLN (ген) взаимодействовать с PLN^[7][8] и ATP2A1.^[7][8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000170290 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. Odermatt A, Taschner PE, Scherer SW, Beatty B, Khanna VK, Cornblath DR, Chaudhry V, Yee WC, Schrank B., Karpati G, Breuning MH, Knoers N, MacLennan DH (ноябрь 1997 г.). «Характеристика гена, кодирующего сарколипин человека (SLN), протеолипид, связанный с SERCA1: отсутствие структурных мутаций у пяти пациентов с болезнью Броуди». Геномика. 45 (3): 541–53. Дои:10.1006 / geno.1997.4967. HDL:2066/25426. PMID  9367679.
4. "Entrez Gene: SLN сарколипин".
5. Бабу Г.Дж., Бхупати П., Тимофеев В., Петрашевская Н.Н., Райзер П.Дж., Чиамвимонват Н., Периасамы М. (ноябрь 2007 г.). «Удаление сарколипина улучшает транспорт кальция саркоплазматического ретикулума и сократительную способность предсердий». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 104 (45): 17867–72. Дои:10.1073 / pnas.0707722104. ЧВК  2077025. PMID  17971438.
6. Bal NC, Maurya SK, Sopariwala DH, Sahoo SK, Gupta SC, Shaikh SA, Pant M и др .: Сарколипин - недавно идентифицированный регулятор термогенеза на основе мышц у млекопитающих. Нат Мед, 2012. http://www.nature.com/nm/journal/vaop/ncurrent/full/nm.2897.html
7. Асахи М., Сугита Ю., Курзидловски К., Де Леон С., Тада М., Тойошима С., МакЛеннан Д.Х. (апрель 2003 г.). «Сарколипин регулирует Са2 + -АТФазу сарко (эндо) плазматического ретикулума (SERCA) путем связывания с трансмембранными спиралями отдельно или в сочетании с фосфоламбаном». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (9): 5040–5. Дои:10.1073 / пнас.0330962100. ЧВК  154294. PMID  12692302.
8. Асахи М., Курзыдловски К., Тада М., МакЛеннан Д.Х. (июль 2002 г.). «Сарколипин ингибирует полимеризацию фосфоламбана, чтобы вызвать суперингибирование Са2 + -АТФаз сарко (эндо) плазматического ретикулума (SERCA)». Журнал биологической химии. 277 (30): 26725–8. Дои:10.1074 / jbc.C200269200. PMID  12032137.

дальнейшее чтение

• Lanfranchi G, Muraro T, Caldara F, Pacchioni B, Pallavicini A, Pandolfo D, Toppo S, Trevisan S, Scarso S, Valle G (январь 1996). «Идентификация 4370 экспрессируемых тегов последовательности из библиотеки кДНК, специфичной для 3'-конца, скелетных мышц человека путем секвенирования ДНК и гибридизации с фильтром». Геномные исследования. 6 (1): 35–42. Дои:10.1101 / гр.6.1.35. PMID  8681137.
• Одерматт А., Беккер С., Ханна В.К., Курзидловски К., Лейснер Е., Петте Д., МакЛеннан Д.Х. (май 1998 г.). «Сарколипин регулирует активность SERCA1, Ca2 + -АТФазы быстро сокращающегося саркоплазматического ретикулума скелетных мышц». Журнал биологической химии. 273 (20): 12360–9. Дои:10.1074 / jbc.273.20.12360. PMID  9575189.
• Смит WS, Broadbridge R, East JM, Lee AG (январь 2002 г.). «Сарколипин отделяет гидролиз АТФ от накопления Са2 + Са2 + -АТФазой саркоплазматического ретикулума скелетных мышц». Биохимический журнал. 361 (Pt 2): 277–86. Дои:10.1042/0264-6021:3610277. ЧВК  1222307. PMID  11772399.
• Mascioni A, Karim C, Barany G, Thomas DD, Veglia G (январь 2002 г.). «Структура и ориентация сарколипина в липидных средах». Биохимия. 41 (2): 475–82. Дои:10.1021 / bi011243m. PMID  11781085.
• Асахи М., Курзыдловски К., Тада М., МакЛеннан Д.Х. (июль 2002 г.). «Сарколипин ингибирует полимеризацию фосфоламбана, чтобы вызвать суперингибирование Са2 + -АТФаз сарко (эндо) плазматического ретикулума (SERCAs)». Журнал биологической химии. 277 (30): 26725–8. Дои:10.1074 / jbc.C200269200. PMID  12032137.
• Минамисава С., Ван И, Чен Дж, Исикава Ю., Чиен К. Р., Мацуока Р. (март 2003 г.). «Специфическая для предсердной камеры экспрессия сарколипина регулируется во время развития и гипертрофического ремоделирования». Журнал биологической химии. 278 (11): 9570–5. Дои:10.1074 / jbc.M213132200. PMID  12645548.
• Асахи М., Сугита Ю., Курзидловски К., Де Леон С., Тада М., Тойошима С., МакЛеннан Д.Х. (апрель 2003 г.). «Сарколипин регулирует Са2 + -АТФазу сарко (эндо) плазматического ретикулума (SERCA) путем связывания с трансмембранными спиралями отдельно или в сочетании с фосфоламбаном». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (9): 5040–5. Дои:10.1073 / пнас.0330962100. ЧВК  154294. PMID  12692302.
• Судзуки Ю., Ямасита Р., Широта М., Сакакибара Ю., Чиба Дж., Мидзусима-Сугано Дж., Накай К., Сугано С. (сентябрь 2004 г.). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в промоторных областях». Геномные исследования. 14 (9): 1711–8. Дои:10.1101 / гр.2435604. ЧВК  515316. PMID  15342556.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Витторини С., Сторти С., Парри М.С., Cerillo AG, Clerico A (2007). «Экспрессия генов рецепторов SERCA2a, фосфоламбана, сарколипина и рианодина у детей с врожденными пороками сердца». Молекулярная медицина. 13 (1–2): 105–11. Дои:10.2119 / 2006-00054.Vittorini. ЧВК  1869624. PMID  17515962.