Последовательная ходьба - Sequential walking

Последовательная ходьба это метод, который можно использовать для решения различных 2D ЯМР спектры. В 2D-эксперименте кросс-пики должны соотноситься с правильными ядрами. Используя последовательную ходьбу, правильные ядра можно сопоставить их пикам. Назначенные кросс-пики могут дать ценную информацию, например, о пространственных взаимодействиях между ядрами.

В NOESY из ДНК например, каждый нуклеотид имеет свой связанный с ним химический сдвиг. В общем, A расположены ниже по течению, T - выше по течению, а C и G - промежуточны. У каждого нуклеотида есть протоны на сахаре дезоксирибозы, которые можно определить с помощью последовательной ходьбы. Для этого необходимо обнаружить первый нуклеотид в последовательности. Знание последовательности ДНК помогает, но в целом первое нуклеотид можно определить с помощью следующих правил.

1. 2 'и 2-дюймовые протоны нуклеотида будут отображаться в его столбце, а также в столбце следующего нуклеотида в последовательности. Например, в последовательности CATG в столбце для C свой собственный 2' и 2-дюймовые протоны будут видны, но никакие другие нуклеотиды. Для A будут видны его собственные протоны 2 'и 2 ", а также протоны из C.

2. Метильные группы на нуклеотиде видны в столбце для нуклеотида, содержащего метильную группу, а также для предшествующего ему нуклеотида. Например, в CATG A и T будут содержать пик метила, соответствующий метильной группе на T, но G не будет.

После того, как первый нуклеотид был найден, вы определяете, какой нуклеотид находится рядом с ним, потому что он должен содержать протоны 2 'и 2 дюйма от предыдущего нуклеотида. Это делается путем «прогулки» по спектру. Этот процесс затем повторяется последовательно до тех пор, пока все нуклеотиды присвоены.