Т-комплекс 1 - T-complex 1

TCP1
Идентификаторы
Псевдонимы	TCP1, CCT-альфа, CCT1, CCTa, D6S230E, TCP-1-альфа, Т-комплекс 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 186980 MGI: 98535 ГомолоГен: 5656 Генные карты: TCP1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 6 (человек)
Конец	159,789,703 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 17 (мышь)
Конец	12,925,067 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание нуклеотидов; • GO: 0001948 связывание с белками; • Связывание АТФ; • связывание убиквитин-протеин-лигазы; • связывание белков, участвующих в сворачивании белков; • развернутое связывание с белками; • Связывание РНК;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • Тело клетки; • цитозоль; • центросома; • аппарат Гольджи; • перицентриолярный материал; • миелин; • центр организации микротрубочек; • ядерный гетерохроматин; • рецепторный комплекс zona pellucida; • гетерохроматин; • Акросома; • шаперонин-содержащий Т-комплекс; • микротрубочки; • внеклеточная экзосома; • цитоскелет;
Биологический процесс	• комплексная сборка тубулина; • положительное регулирование локализации белка в тельце Кахаля; • положительная регуляция установления локализации белка в теломере; • Локализация скаРНК в тельце Кахаля; • регуляция процесса апоптоза макрофагов; • стабилизация белка; • положительная регуляция поддержания теломер через теломеразу; • транспорт токсинов; • сворачивание белка; • положительная регуляция активности теломеразы; • транслокация пептидов или белков в цитоплазму клетки-хозяина; • положительная регуляция локализации теломеразной РНК в тельце Кахаля; • связывание сперматозоидов с блестящей оболочкой; • сворачивание белка de novo; • шаперон-опосредованный сворачивание белка; • сигнальный путь, опосредованный интерлейкином-12;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6950
	21454
	ENSG00000120438
	ENSMUSG00000068039
	P17987
	P11983
	NM_030752; NM_001008897
	NM_001290712; NM_013686
	NP_001008897; NP_110379
	NP_001277641; NP_038714
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Т-комплексный белок 1 субъединица альфа это белок что у людей кодируется TCP1 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Этот ген кодирует молекулярный шаперон, входящий в состав TRiC сложный. Этот комплекс состоит из двух идентичных уложенных друг на друга колец, каждое из которых содержит восемь разных белков. Развернутые полипептиды входят в центральную полость комплекса и складываются АТФ-зависимым образом. Комплекс сворачивает различные белки, включая актин и тубулин. Были охарактеризованы альтернативные варианты транскрипционного сплайсинга этого гена, кодирующие разные изоформы.^[7]

Взаимодействия

Т-комплекс 1, как было показано, взаимодействовать с участием PPP4C^[8]^[9] и HDAC3.^[10] CCT также напрямую взаимодействует с рецептором-1 окисленного LDL лектинового типа (LOX-1), в то время как его лиганд, окисленный липопротеином низкой плотности (OxLDL), диссоциирует CCT от LOX-1.^[11]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000120438 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000068039 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Fonatsch C, Gradl G, Ragoussis J, Ziegler A (октябрь 1987 г.). «Присвоение локуса TCP1 длинному плечу хромосомы 6 человека путем гибридизации in situ». Cytogenet Cell Genet. 45 (2): 109–12. Дои:10.1159/000132439. PMID 3476253.
^ Уиллисон К., Келли А., Дадли К., Гудфеллоу П., Сперр Н., Гровс В., Горман П., Шир Д., Троусдейл Дж. (Ноябрь 1987 г.). «Человеческий гомолог гена t-комплекса мыши, TCP1, расположен на хромосоме 6, но не рядом с областью HLA». EMBO J. 6 (7): 1967–74. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1987.tb02459.x. ЧВК 553584. PMID 3653076.
^ ^а ^б "Entrez Gene: TCP1 t-комплекс 1".
^ Chen GI, Tisayakorn S, Jorgensen C, D'Ambrosio LM, Goudreault M, Gingras AC (октябрь 2008 г.). «PP4R4 / KIAA1622 образует новый стабильный цитозольный комплекс с фосфопротеинфосфатазой 4». J. Biol. Chem. 283 (43): 29273–84. Дои:10.1074 / jbc.M803443200. ЧВК 2662017. PMID 18715871.
^ Gingras AC, Caballero M, Zarske M, Sanchez A, Hazbun TR, Fields S, Sonenberg N, Hafen E, Raught B, Aebersold R (ноябрь 2005 г.). «Новый эволюционно консервативный комплекс протеинфосфатазы, участвующий в чувствительности к цисплатину». Мол. Cell. Протеомика. 4 (11): 1725–40. Дои:10.1074 / mcp.M500231-MCP200. PMID 16085932.
^ Гюнтер М.Г., Ю.Дж., Као Г.Д., Йен Т.Дж., Лазар М.А. (декабрь 2002 г.). «Сборка комплекса репрессии SMRT-гистондеацетилазы 3 требует кольцевого комплекса TCP-1». Genes Dev. 16 (24): 3130–5. Дои:10.1101 / gad.1037502. ЧВК 187500. PMID 12502735.
^ Bakthavatsalam D, Soung RH, Tweardy DJ, Chiu W, Dixon RA, Woodside DG (июнь 2014 г.). «Шаперонин-содержащий комплекс TCP-1 напрямую связывается с цитоплазматическим доменом рецептора LOX-1». FEBS Lett. 588 (13): 2133–40. Дои:10.1016 / j.febslet.2014.04.049. ЧВК 4100626. PMID 24846140.

дальнейшее чтение

Хорвич А.Л., Уиллисон К.Р. (1993). «Сворачивание белка в клетке: функции двух семейств молекулярных шаперонов, hsp 60 и TF55-TCP1». Филос. Пер. R. Soc. Лондон. B Biol. Наука. 339 (1289): 313–25, обсуждение 325–6. Дои:10.1098 / рстб.1993.0030. PMID 8098536.
Берстон С.Г., Кларк А.Р. (1997). «Молекулярные шапероны: физические и механистические свойства». Очерки Биохимии. 29: 125–36. PMID 9189717.
Бланше Х., Райт Л.Г., Верно Дж., Де Гуйон Б., Лотье В., Сильвер Л.М., Дауссе Дж., Канн М.М., Шпильман Р.С. (1992). «Генетическое картирование трех человеческих гомологов генов t-комплекса мышей локализует TCP10 на 6q27, на 15 сМ дистальнее TCP1 и PLG». Геномика. 12 (4): 826–8. Дои:10.1016 / 0888-7543 (92) 90317-Л. PMID 1572657.
Доусон SJ, Белый LA (1992). «Лечение эндокардита Haemophilus aphrophilus ципрофлоксацином». J. Инфекция. 24 (3): 317–20. Дои:10.1016 / S0163-4453 (05) 80037-4. PMID 1602151.
Яффе МБ, Фарр Г.В., Миклош Д., Хорвич А.Л., Штернлихт М.Л., Штернлихт Х. (1992). «Комплекс TCP1 является молекулярным шапероном в биогенезе тубулина». Природа. 358 (6383): 245–8. Bibcode:1992Натура.358..245л. Дои:10.1038 / 358245a0. PMID 1630491. S2CID 4287521.
Льюис В.А., Хайнс Г.М., Чжэн Д., Сайбил Х., Уиллисон К. (1992). «Т-комплексный полипептид-1 представляет собой субъединицу гетеромерной частицы в эукариотическом цитозоле». Природа. 358 (6383): 249–52. Bibcode:1992Натура.358..249л. Дои:10.1038 / 358249a0. PMID 1630492. S2CID 4306360.
Урсик Д., Калбертсон М.Р. (1991). «Дрожжевой гомолог мышиного Tcp-1 влияет на процессы, опосредованные микротрубочками». Мол. Cell. Биол. 11 (5): 2629–40. Дои:10.1128 / mcb.11.5.2629. ЧВК 360032. PMID 1901944.
Кирхгоф К., Уиллисон К. (1990). «Нуклеотидная и аминокислотная последовательность TCP1, полученного из семенников человека». Нуклеиновые кислоты Res. 18 (14): 4247. Дои:10.1093 / nar / 18.14.4247. ЧВК 331189. PMID 2377466.
Робол А., Холмс Ф. Е., Хейс Н. В., Бейнс А. Дж., Карден М. Дж. (1995). «Цитоплазматические шаперониновые комплексы проникают в нейриты, развивающиеся in vitro, и различаются по субъединичному составу внутри отдельных клеток». J. Cell Sci. 108 (4): 1477–88. PMID 7615668.
Эшворт А. (1994). «Два гена ацетил-CoA ацетилтрансферазы, расположенные в t-комплексной области хромосомы 17 мыши, частично перекрывают гены Tcp-1 и Tcp-1x». Геномика. 18 (2): 195–8. Дои:10.1006 / geno.1993.1454. PMID 7904580.
Миклос Д., Каплан С., Мертенс Д., Хайнс Дж., Питлюк З., Каши Ю., Харрисон-Лавуа К., Стивенсон С., Браун С., Баррелл Б. (1994). «Первичная структура и функция второго важного члена гетероолигомерного комплекса TCP1 шаперонина дрожжей, TCP1 бета». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 91 (7): 2743–7. Bibcode:1994ПНАС ... 91.2743М. Дои:10.1073 / пнас.91.7.2743. ЧВК 43446. PMID 7908441.
Чен X, Салливан Д.С., Хаффакер Т.С. (1994). «Два дрожжевых гена, сходных с TCP-1, необходимы для функционирования микротрубочек и актина in vivo». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 91 (19): 9111–5. Bibcode:1994PNAS ... 91.9111C. Дои:10.1073 / пнас.91.19.9111. ЧВК 44757. PMID 7916460.
Кубота Х, Хайнс Дж, Карне А, Эшворт А, Уиллисон К. (1994). «Идентификация шести генов, связанных с Tcp-1, кодирующих дивергентные субъединицы TCP-1-содержащего шаперонина». Curr. Биол. 4 (2): 89–99. Дои:10.1016 / S0960-9822 (94) 00024-2. PMID 7953530. S2CID 31300131.
Фридман Дж, Хартл Ф.У. (1996). «Принципы фолдинга белков с помощью шаперона: различия между механизмами in vitro и in vivo». Наука. 272 (5267): 1497–502. Bibcode:1996 Наука ... 272.1497F. Дои:10.1126 / science.272.5267.1497. PMID 8633246. S2CID 22363826.
Moudjou M, Bordes N, Paintrand M, Bornens M (1996). «Гамма-тубулин в клетках млекопитающих: центросомная и цитозольная формы». J. Cell Sci. 109 (4): 875–87. PMID 8718679.
Моррисон К., Папапетру С., Аттвуд Дж., Хол Ф., Линч С.А., Сампат А., Хамель Б., Берн Дж., Соуден Дж., Стотт Д., Мариман Э., Эдвардс Ю. Х. (1997). «Генетическое картирование человеческого гомолога (T) мыши T (Brachyury) и поиск аллельной ассоциации между человеческим T и spina bifida». Гм. Мол. Genet. 5 (5): 669–74. Дои:10,1093 / hmg / 5.5.669. PMID 8733136.
Масуно М., Фукао Т., Сонг XQ, Ямагути С., Ории Т., Кондо Н., Имаидзуми К., Куроки Ю. (1997). «Отнесение человеческого цитозольного гена ацетоацетил-кофермента А тиолазы (ACAT2) к хромосоме 6q25.3-q26». Геномика. 36 (1): 217–8. Дои:10.1006 / geno.1996.0452. PMID 8812443.

Эта статья о ген на хромосома человека 6 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000120438 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000068039 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid3476253-5] Fonatsch C, Gradl G, Ragoussis J, Ziegler A (октябрь 1987 г.). «Присвоение локуса TCP1 длинному плечу хромосомы 6 человека путем гибридизации in situ». Cytogenet Cell Genet. 45 (2): 109–12. Дои:10.1159/000132439. PMID 3476253.

[pmid3653076-6] Уиллисон К., Келли А., Дадли К., Гудфеллоу П., Сперр Н., Гровс В., Горман П., Шир Д., Троусдейл Дж. (Ноябрь 1987 г.). «Человеческий гомолог гена t-комплекса мыши, TCP1, расположен на хромосоме 6, но не рядом с областью HLA». EMBO J. 6 (7): 1967–74. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1987.tb02459.x. ЧВК 553584. PMID 3653076.

[entrez-7] а ^б "Entrez Gene: TCP1 t-комплекс 1".

[pmid18715871-8] Chen GI, Tisayakorn S, Jorgensen C, D'Ambrosio LM, Goudreault M, Gingras AC (октябрь 2008 г.). «PP4R4 / KIAA1622 образует новый стабильный цитозольный комплекс с фосфопротеинфосфатазой 4». J. Biol. Chem. 283 (43): 29273–84. Дои:10.1074 / jbc.M803443200. ЧВК 2662017. PMID 18715871.

[pmid16085932-9] Gingras AC, Caballero M, Zarske M, Sanchez A, Hazbun TR, Fields S, Sonenberg N, Hafen E, Raught B, Aebersold R (ноябрь 2005 г.). «Новый эволюционно консервативный комплекс протеинфосфатазы, участвующий в чувствительности к цисплатину». Мол. Cell. Протеомика. 4 (11): 1725–40. Дои:10.1074 / mcp.M500231-MCP200. PMID 16085932.

[pmid12502735-10] Гюнтер М.Г., Ю.Дж., Као Г.Д., Йен Т.Дж., Лазар М.А. (декабрь 2002 г.). «Сборка комплекса репрессии SMRT-гистондеацетилазы 3 требует кольцевого комплекса TCP-1». Genes Dev. 16 (24): 3130–5. Дои:10.1101 / gad.1037502. ЧВК 187500. PMID 12502735.

[pmid24846140-11] Bakthavatsalam D, Soung RH, Tweardy DJ, Chiu W, Dixon RA, Woodside DG (июнь 2014 г.). «Шаперонин-содержащий комплекс TCP-1 напрямую связывается с цитоплазматическим доменом рецептора LOX-1». FEBS Lett. 588 (13): 2133–40. Дои:10.1016 / j.febslet.2014.04.049. ЧВК 4100626. PMID 24846140.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]