TAF1B - TAF1B

TAF1B
Идентификаторы
Псевдонимы	TAF1B, MGC: 9349, RAF1B, RAFI63, SL1, TAFI63, фактор, связанный с связывающим белком TATA-боксом, субъединица B РНК-полимеразы I
Внешние идентификаторы	OMIM: 604904 MGI: 109577 ГомолоГен: 31331 Генные карты: TAF1B
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2п25.1 Начинать 9,843,443 бп[1] Конец 9,934,416 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 12 (мышь)[2] Группа 12 | 12 A1.3 Начинать 24,498,359 бп[2] Конец 24,558,539 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание с белками класса ТВР • GO: 0001187 Связывание с последовательностью корового промотора РНК-полимеразы I с ДНК Сотовый компонент • нуклеоплазма • Комплекс фактора транскрипции РНК-полимеразы SL1 • ядрышко • ядро клетки • Комплекс основных факторов РНК-полимеразы I Биологический процесс • прекращение транскрипции РНК-полимеразы I • положительная регуляция экспрессии генов, эпигенетическая • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы I • транскрипция, ДНК-шаблон • транскрипция с промотора РНК-полимеразы I • Сборка комплекса преинициации транскрипции РНК-полимеразы I • транскрипция ядерного транскрипта большой рРНК с промотора РНК-полимеразы I. • элонгация транскрипции с промотора РНК-полимеразы I Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9014	21340
Ансамбль	ENSG00000115750	ENSMUSG00000059669
UniProt	Q53T94	P97358
RefSeq (мРНК)	NM_005680 NM_001318976 NM_001318977	NM_020614
RefSeq (белок)	NP_001305905 NP_001305906 NP_005671	NP_065639
Расположение (UCSC)	Chr 2: 9,84 - 9,93 Мб	Chr 12: 24,5 - 24,56 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

ТАТА-бокс-связывающий белок-ассоциированный фактор РНК-полимераза I субъединица B является фермент что у людей кодируется TAF1B ген.^[5][6]

Функция

Инициация транскрипции РНК-полимеразой I требует образования комплекса, состоящего из ТАТА-связывающего белка (ТВР) и трех ТВР-ассоциированных факторов (TAF), специфичных для РНК-полимеразы I. Этот комплекс, известный как SL1, связывается с основным промотором. генов рибосомной РНК, чтобы правильно расположить полимеразу и действовать как канал для регуляторных сигналов. Этот ген кодирует один из SL1-специфичных TAF.^[6]

Взаимодействия

TAF1B показал себя взаимодействовать с RRN3.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000115750 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000059669 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Comai L, Zomerdijk JC, Beckmann H, Zhou S, Admon A, Tjian R (январь 1995 г.). «Восстановление транскрипционного фактора SL1: исключительное связывание TBP субъединицами SL1 или TFIID». Наука. 266 (5193): 1966–72. Дои:10.1126 / science.7801123. PMID  7801123.
6. «Ген Entrez: фактор, ассоциированный с TAF1B, TATA-бокс-связывающий белок (TBP), РНК-полимераза I, B, 63 кДа».
7. Миллер Г., Панов К.И., Фридрих Дж. К., Тринкл-Малкахи Л., Ламонд А. И., Зомердейк Дж. К. (март 2001 г.). «hRRN3 играет важную роль в SL1-опосредованном привлечении РНК-полимеразы I к промоторам гена рРНК». EMBO J. 20 (6): 1373–82. Дои:10.1093 / emboj / 20.6.1373. ЧВК  145519. PMID  11250903.

дальнейшее чтение

• Ди Пьетро С., Раписарда А., Амико В., Бонайуто К., Виола А., Скалия М., Мотта С., Амато А., Энгель Н., Мессина А., Сичел Г., Гжешик К., Пуррелло М. (2000). «Геномная локализация человеческих генов TAF1A, TAF1B и TAF1C, кодирующих субъединицы TAF (I) 48, TAF (I) 63 и TAF (I) 110 общего фактора инициации транскрипции SL1 класса I.». Cytogenet. Cell Genet. 89 (1–2): 133–6. Дои:10.1159/000015592. PMID  10894955. S2CID  27014629.
• Чжай В., Комай Л. (2000). «Репрессия транскрипции РНК-полимеразы I опухолевым супрессором p53». Мол. Клетка. Биол. 20 (16): 5930–8. Дои:10.1128 / MCB.20.16.5930-5938.2000. ЧВК  86070. PMID  10913176.
• Миллер Г., Панов К.И., Фридрих Дж. К., Тринкл-Малкахи Л., Ламонд А. И., Зомердейк Дж. К. (2001). «hRRN3 играет важную роль в SL1-опосредованном привлечении РНК-полимеразы I к промоторам гена рРНК». EMBO J. 20 (6): 1373–82. Дои:10.1093 / emboj / 20.6.1373. ЧВК  145519. PMID  11250903.
• Ким Н.Г., Ри Х., Ли Л.С., Ким Х., Ли Дж.С., Ким Дж.Х., Ким Н.К., Ким Х (2002). «Идентификация MARCKS, FLJ11383 и TAF1B как предполагаемых новых генов-мишеней в колоректальных карциномах с микросателлитной нестабильностью». Онкоген. 21 (33): 5081–7. Дои:10.1038 / sj.onc.1205703. PMID  12140758.
• Юань X, Чжао Дж., Зентграф Х., Хоффманн-Рорер У., Груммт I (2002). «Множественные взаимодействия между субъединицами РНК-полимеразы I, TIF-IA и TAF (I) регулируют сборку преинициативного комплекса на промоторе рибосомного гена». EMBO Rep. 3 (11): 1082–7. Дои:10.1093 / embo-reports / kvf212. ЧВК  1307603. PMID  12393749.
• Грандори С., Гомес-Роман Н., Фелтон-Эдкинс З.А., Нгоуэне С., Галлоуэй Д.А., Эйзенман Р.Н., Белый Р.Дж. (2005). «c-Myc связывается с рибосомной ДНК человека и стимулирует транскрипцию генов рРНК с помощью РНК-полимеразы I». Nat. Cell Biol. 7 (3): 311–8. Дои:10.1038 / ncb1224. PMID  15723054. S2CID  8913931.
• Ю К.Т., Ли Л.С., Ким Н.Г., Кан Х.Дж., Ко К.Х., Чвае Й.Дж., Ким К.М., Ким Ю.К., Пак С.М., Чан С.К., Ким Х (2007). «Селективная репрессия трансляции усеченных белков мРНК, происходящих из мутации сдвига рамки считывания, в опухолях». ПЛОС Биол. 5 (5): e109. Дои:10.1371 / journal.pbio.0050109. ЧВК  1854916. PMID  17456004.