TAF1C - TAF1C

TAF1C
Идентификаторы
Псевдонимы	TAF1C, MGC: 39976, SL1, TAFI110, TAFI95, фактор, связанный с ТАТА-бокс-связывающим белком, субъединица С РНК-полимеразы I.
Внешние идентификаторы	OMIM: 604905 MGI: 109576 ГомолоГен: 21163 Генные карты: TAF1C
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 16 (человек)[1] Группа 16q24.1 Начните 84,177,847 бп[1] Конец 84,187,070 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 | 8 E1 Начните 119,597,871 бп[2] Конец 119,605,222 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0001187 Связывание с последовательностью корового промотора РНК-полимеразы I, специфичное для ДНК Сотовый компонент • Комплекс факторов транскрипции РНК-полимеразы I • фибриллярный центр • нуклеоплазма • ядрышко • ядро клетки Биологический процесс • прекращение транскрипции РНК-полимеразы I • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы I • положительная регуляция экспрессии генов, эпигенетическая • транскрипция, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы I • Сборка комплекса преинициации транскрипции РНК-полимеразы I • транскрипция с промотора РНК-полимеразы I • элонгация транскрипции с промотора РНК-полимеразы I Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9013	21341
Ансамбль	ENSG00000103168	ENSMUSG00000031832
UniProt	Q15572	Q6PDZ2
RefSeq (мРНК)	NM_001243156 NM_001243157 NM_001243158 NM_001243159 NM_001243160 NM_005679 NM_139353	NM_021441 NM_001378901
RefSeq (белок)	NP_001230085 NP_001230086 NP_001230087 NP_001230088 NP_001230089 NP_005670 NP_647610	NP_067416 NP_001365830
Расположение (UCSC)	Chr 16: 84.18 - 84.19 Мб	Chr 8: 119,6 - 119,61 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

ТАТА-бокс-связывающий белок-ассоциированный фактор РНК-полимераза I субъединица C является фермент что у людей кодируется TAF1C ген.^[5][6]

Функция

Инициирование транскрипции РНК-полимеразой I требует образования комплекса, состоящего из TATA-связывающего белка (TBP) и трех TBP-связанных факторов (TAF), специфичных для РНК-полимеразы I. Этот комплекс, известный как SL1, связывается с основным промотором. генов рибосомной РНК, чтобы правильно расположить полимеразу и действовать как канал для регуляторных сигналов. Этот ген кодирует наибольший SL1-специфический TAF. Идентифицированы два транскрипта, кодирующие разные изоформы.^[6]

Взаимодействия

TAF1C был показан взаимодействовать с UBTF.^[7][8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000103168 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031832 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Comai L, Zomerdijk JC, Beckmann H, Zhou S, Admon A, Tjian R (1994). «Восстановление транскрипционного фактора SL1: исключительное связывание TBP субъединицами SL1 или TFIID». Наука. 266 (5193): 1966–72. Дои:10.1126 / science.7801123. PMID  7801123.
6. «Ген Entrez: TAF1C TATA-бокс-связывающий белок (ТВР) фактор, РНК-полимераза I, C, 110 кДа».
7. Войт Р., Груммт I (ноябрь 2001 г.). «Фосфорилирование UBF по серину 388 необходимо для взаимодействия с РНК-полимеразой I и активации транскрипции рДНК». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (24): 13631–6. Дои:10.1073 / pnas.231071698. ЧВК  61092. PMID  11698641.
8. Чжай В., Комай Л. (август 2000 г.). «Репрессия транскрипции РНК-полимеразы I опухолевым супрессором p53». Мол. Клетка. Биол. 20 (16): 5930–8. Дои:10.1128 / MCB.20.16.5930-5938.2000. ЧВК  86070. PMID  10913176.

дальнейшее чтение

• Ди Пьетро С., Раписарда А., Амико В., Бонайуто К., Виола А., Скалия М., Мотта С., Амато А., Энгель Н., Мессина А., Сихель Г., Гржешик К., Пуррелло М. (2000). «Геномная локализация человеческих генов TAF1A, TAF1B и TAF1C, кодирующих субъединицы TAF (I) 48, TAF (I) 63 и TAF (I) 110 общего фактора инициации транскрипции SL1 класса I.». Cytogenet. Cell Genet. 89 (1–2): 133–6. Дои:10.1159/000015592. PMID  10894955. S2CID  27014629.
• Миллер Г., Панов К.И., Фридрих Дж. К., Тринкл-Малкахи Л., Ламонд А. И., Зомердейк Дж. К. (2001). «hRRN3 играет важную роль в SL1-опосредованном привлечении РНК-полимеразы I к промоторам гена рРНК». EMBO J. 20 (6): 1373–82. Дои:10.1093 / emboj / 20.6.1373. ЧВК  145519. PMID  11250903.
• Юань X, Чжао Дж., Зентграф Х., Хоффманн-Рорер У., Grummt I (2002). «Множественные взаимодействия между субъединицами РНК-полимеразы I, TIF-IA и TAF (I) регулируют сборку преинициативного комплекса на промоторе рибосомного гена». EMBO Rep. 3 (11): 1082–7. Дои:10.1093 / embo-reports / kvf212. ЧВК  1307603. PMID  12393749.
• Ямамото К., Ямамото М., Ханада К., Ноги Й., Мацуяма Т., Мурамацу М. (2004). «Множественные белок-белковые взаимодействия фактора PAF49, связанного с РНК-полимеразой I, и роль PAF49 в транскрипции рРНК». Мол. Клетка. Биол. 24 (14): 6338–49. Дои:10.1128 / MCB.24.14.6338-6349.2004. ЧВК  434256. PMID  15226435.
• Грандори С., Гомес-Роман Н., Фелтон-Эдкинс З.А., Нгоуэне С., Галлоуэй Д.А., Эйзенман Р.Н., Белый Р.Дж. (2005). «c-Myc связывается с рибосомной ДНК человека и стимулирует транскрипцию генов рРНК с помощью РНК-полимеразы I». Nat. Cell Biol. 7 (3): 311–8. Дои:10.1038 / ncb1224. PMID  15723054. S2CID  8913931.
• Фридрих JK, Панов KI, Cabart P, Russell J, Zomerdijk JC (2005). «Комплекс TBP-TAF SL1 направляет образование комплекса предварительной инициации РНК-полимеразы I и стабилизирует вышестоящий фактор связывания на промоторе рДНК». J. Biol. Chem. 280 (33): 29551–8. Дои:10.1074 / jbc.M501595200. ЧВК  3858828. PMID  15970593.
• Чжан С., Комай Л., Джонсон Д.Л. (2005). «PTEN подавляет транскрипцию РНК-полимеразы I, разрушая комплекс SL1». Мол. Клетка. Биол. 25 (16): 6899–911. Дои:10.1128 / MCB.25.16.6899-6911.2005. ЧВК  1190253. PMID  16055704.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Ю., Ирие Р., Кушида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.