TAF7l - TAF7l
ТАТА-бокс-связывающий белок, связанный с фактором 7-подобным также известный как CT40 - это белок что у людей кодируется TAF7l ген.[5] Это близкий гомолог TAF7 ген, хотя его функции могут быть разными. В настоящее время об этом гене известно мало. Первоначально было продемонстрировано, что это ген, специфичный для семенников, на основе экспериментов ОТ-ПЦР с экстрактами тканей,[5] однако теперь он был обнаружен в белой и коричневой жировой ткани,[6] а также при некоторых видах рака.[7]
Функция
Функция в формировании жировой ткани
Исследования, проведенные на животных с нокаутом, показали, что Taf7l вносит важный вклад в определение судьбы мезенхимальных стволовых клеток. Важно отметить, что Zhou et al.[6] обнаружил, что в Taf7L−/− (Нокаут Taf7L) у животных уменьшились жировые подушечки, которые проникают в ткань скелетных мышц. Используя RNA-seq и Gene Ontology Enrichment (GO), эта же группа обнаружила увеличение количества терминов GO (и, следовательно, категорий генов), которые были вовлечены в развитие скелета и мышц. В сочетании с in vitro Есть доказательства, что Taf7l способен инициировать производство бурого жира (так называемого здорового жира). Кроме того, они обнаружили, что вместе с PPARgamma, Taf7l, вероятно, может регулировать связывание комплекса TFIID / РНК-полимераза II (RNAP II). В частности, присутствие Taf7l может изменять образование петель хроматина и, таким образом, ассоциацию дистальных энхансерных последовательностей с промоторами BAT-специфических генов, таких как Cidea и Scd1.
Функция при раке
Недавно, мутация сдвига рамки было обнаружено у 3 пациентов с колоректальный рак.[7] В частности, было обнаружено, что в области мононуклеотидного повтора поли-A в экзоне 6 Taf71 отсутствует один нуклеотид (делеционная мутация), что приводит к мутации сдвига рамки считывания. Кроме того, было обнаружено снижение в 58% случаев. Острый миелогенный лейкемай (AML).
Функция в сперматогенезе: взаимность с TAF7
Большая часть первоначальной работы была проведена Pointud et al.[5] Они обнаружили, что Taf7l выполняет двойную функцию во время сперматогенеза. В сперматоцитах на ранней стадии, например, в первичных сперматоцитах (все еще диплоидных на данный момент), TAF7l находится в цитоплазме, а комплекс ТАТА-связывающего белка (ТВР) расположен в ядре. Затем TAF71 медленно переходит в ядро во время средней стадии пахитеновой клетки, где также наблюдается резкое увеличение экспрессии белка ТВР в ядре. Кроме того, существует обратная связь с отношением TAF7 выражение: В отличие от TAF7l, TAF7 на ранних стадиях экспрессируется в ядре и таким образом отделяется от TAF7l. Затем, на более поздних стадиях, когда TAF7l переходит в ядро, что происходит примерно в то время, когда происходит соматический (диплоидный) переход в зародышевую клетку (гаплоидный), TAF7 резко снижается. Это может указывать на то, что TAF7l играет важную роль в регуляции TFIID во время развития сперматозоидов. Pointud et al. (2003) предполагают, что TAF7l может «закладывать» определенные гены для экспрессии или репрессии в гаплоидных сперматоцитах.
Функция во время транскрипции
Окончательная роль TAF7l во время транскрипции все еще остается неясной. Скрининг дрожжей-2-гибридов выявил, что TAF71 сильно взаимодействует с TAF1 точно в той же области (аминокислоты 1170-1226 TAF1), с которой TAF7 связывается и инактивирует функцию ацетилтрансферазы (AT) TAF1.[5] Таким образом, вероятно, что TAF71 играет роль, аналогичную TAF7, в ингибировании TAF1 и, следовательно, активности комплекса TFIID. TAF7l локализуется в другом компартменте относительно TBP во время раннего сперматогенеза, подразумевая, что TBP-независимая функция, которая требует дальнейшего изучения. Кроме того, Захват конформации хромосомы, идентифицировал роль TAF7 в непосредственном опосредовании связывания энхансерных элементов с промоторными последовательностями, с которыми связывается TFIID.[6] Это также предполагает, что TAF7l заменяет функцию TAF7, поскольку TAF7 также, как было продемонстрировано, связывается и регулирует экспрессию гена (например, витамина D3 или тироидного гормона) промотор-специфическим образом. [5]
- Г. С. Гупта (2 июля 2006 г.). Протеомика сперматогенеза. Springer Science & Business Media. п. 327. ISBN 9780387276557.
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000102387 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000009596 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ а б c d е Pointud JC, Mengus G, Brancorsini S, Monaco L, Parvinen M, Sassone-Corsi P, Davidson I (май 2003 г.). «Внутриклеточная локализация TAF7L, паралогии субъединицы TAF7 фактора транскрипции TFIID, онтогенетически регулируется во время дифференцировки мужских половых клеток». Журнал клеточной науки. 1 (116): 1847–58. Дои:10.1242 / jcs.00391. PMID 12665565.
- ^ а б c https://elifesciences.org/content/3/e02811
- ^ а б Oh HR, An CH, Yoo NJ, Lee SH (июль 2015 г.). «Мутации сдвига рамки гена TAF7L, основного компонента транскрипции РНК-полимеразой II, при колоректальном раке». Патология онкологического исследования. 21 (3): 849–50. Дои:10.1007 / s12253-014-9832-4. PMID 25098277.