TAGLN2 - TAGLN2

TAGLN2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1WYM
Идентификаторы
Псевдонимы	TAGLN2, HA1756, трансгелин 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 604634 MGI: 1312985 ГомолоГен: 20789 Генные карты: TAGLN2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q23.2 Начинать 159,918,107 бп[1] Конец 159,925,732 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 H3 | 1 79,89 см Начинать 172,500,047 бп[2] Конец 172,507,380 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание кадгерина Сотовый компонент • везикул • внеклеточная экзосома • внеклеточная область • цитозоль Биологический процесс • дифференцировка эпителиальных клеток • дегрануляция тромбоцитов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8407	21346
Ансамбль	ENSG00000158710	ENSMUSG00000026547
UniProt	P37802	Q9WVA4
RefSeq (мРНК)	NM_003564 NM_001277223 NM_001277224	NM_178598
RefSeq (белок)	NP_001264152 NP_001264153 NP_003555	NP_848713
Расположение (UCSC)	Chr 1: 159.92 - 159.93 Мб	Chr 1: 172,5 - 172,51 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Трансгелин-2 это белок что у людей кодируется TAGLN2 ген.^[5][6]

Белок, кодируемый этим геном, является гомологом белка трансгелина, который является одним из самых ранних маркеров дифференцированной гладкой мускулатуры. Функция этого белка еще не определена.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000158710 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026547 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Stanier P, Abu-Hayyeh S, Murdoch JN, Eddleston J, Copp AJ (сентябрь 1998 г.). «Паралогичные гены sm22alpha (Tagln) отображаются на хромосомах 1 и 9 мыши: еще одно свидетельство паралогичной связи». Геномика. 51 (1): 144–7. Дои:10.1006 / geno.1998.5381. PMID  9693045.
6. «Ген Entrez: трансгелин 2 TAGLN2».

дальнейшее чтение

• Нагасе Т., Миядзима Н., Танака А. и др. (1995). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. III. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0081-KIAA0120), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК Res. 2 (1): 37–43. Дои:10.1093 / dnares / 2.1.37. PMID  7788527.
• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Д.Ю. и др. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С. и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Ходжа М.Р., Валестедт К., Хёгк С. (2000). «Стратегия визуальной внутриклеточной классификации не охарактеризованных белков человека». Exp. Cell Res. 259 (1): 239–46. Дои:10.1006 / excr.2000.4948. PMID  10942595.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Геваерт К., Гетальс М., Мартенс Л. и др. (2004). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Nat. Биотехнология. 21 (5): 566–9. Дои:10.1038 / nbt810. PMID  12665801.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ван Л., Чжу Ю.Ф., Го XJ и др. (2006). «Двумерная справочная карта электрофореза яичников человека». J. Mol. Med. 83 (10): 812–21. Дои:10.1007 / s00109-005-0676-y. PMID  16021519.
• Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека». Природа. 441 (7091): 315–21. Дои:10.1038 / природа04727. PMID  16710414.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.