TBC1D4 - TBC1D4

TBC1D4
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3QYB
Идентификаторы
Псевдонимы	TBC1D4, Член семейства доменов AS160, NIDDM5, TBC1 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 612465 MGI: 2429660 ГомолоГен: 45451 Генные карты: TBC1D4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 13 (человек)[1] Группа 13q22.2 Начните 75,283,503 бп[1] Конец 75,482,169 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 14 (мышь)[2] Группа 14 | 14 E2.3 Начните 101,442,360 бп[2] Конец 101,609,191 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase • Связывание Rab GTPase Сотовый компонент • эндомембранная система • внутриклеточный • цитоплазма • цитозоль • везикул Биологический процесс • везикулярный транспорт • отрицательная регуляция слияния везикул • клеточный ответ на стимул инсулина • регуляция слияния везикул • GO: 0032861, GO: 0032862, GO: 0032856 активация активности GTPase • внутриклеточный транспорт белка Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	9882	210789
Ансамбль	ENSG00000136111	ENSMUSG00000033083
UniProt	O60343	Q8BYJ6
RefSeq (мРНК)	NM_001286658 NM_001286659 NM_014832	NM_001081278 NM_173380
RefSeq (белок)	NP_001273587 NP_001273588 NP_055647	NP_001074747
Расположение (UCSC)	Chr 13: 75.28 - 75.48 Мб	Chr 14: 101,44 - 101,61 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

AS160 (Akt-субстрат 160 кДа), который первоначально был известен как Член семьи домена TBC1 4 (TBC1D4),^[5] это Раб ГТФаза-активирующая белок что у людей кодируется TBC1D4 ген.^[6][7][8][9]

Белковый продукт 160 кДа был впервые обнаружен при скрининге новых субстратов серин-треонинкиназы. Akt2, который фосфорилирует AS160 по Thr-642 и Ser-588^[5][10] после стимуляции инсулином.^[11] Инсулин стимуляция жировых и мышечных клеток приводит к перемещению переносчика глюкозы GLUT4 к плазматической мембране, и этот процесс транслокации зависит от фосфорилирования AS160.^[12] Роль AS160 в транслокации GLUT4 опосредуется его доменом, активирующим GTPase, и взаимодействием с Rab-белками в образовании пузырьков, увеличивая транслокацию GLUT4, когда его активность GTPase ингибируется фосфорилированием Akt. В частности, это ингибирование активирует RAB2A, RAB8A, RAB10 и RAB14.^[13]

AS160 также содержит кальмодулин-связывающий домен, и этот домен опосредует независимый от фосфорилирования захват глюкозы мышечными клетками.^[14]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000136111 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033083 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Сакамото К., Холман Г.Д. (2008). «Растущая роль AS160 / TBC1D4 и TBC1D1 в регулировании трафика GLUT4». Am. J. Physiol. Эндокринол. Метаб. 295 (1): E29–37. Дои:10.1152 / ajpendo.90331.2008. ЧВК  2493596. PMID  18477703.
6. Курихара Л.Дж., Семенова Е., Миллер В., Инграм Р.С., Гуан XJ, Тилгман С.М. (февраль 2002 г.). «Гены-кандидаты, необходимые для эмбрионального развития: сравнительный анализ дистальной хромосомы 14 мыши и хромосомы 13q22 человека». Геномика. 79 (2): 154–61. CiteSeerX  10.1.1.16.1099. Дои:10.1006 / geno.2002.6692. PMID  11829485.
7. Кейн С., Сано Х., Лю С.К., Асара Дж. М., Лейн В.С., Гарнер С.К., Линхард Г.Е. (июнь 2002 г.). «Метод идентификации субстратов серинкиназы. Akt фосфорилирует новый белок адипоцитов с доменом Rab GTPase-активирующего белка (GAP)».. Журнал биологической химии. 277 (25): 22115–8. Дои:10.1074 / jbc.C200198200. PMID  11994271.
8. Мацумото Ю., Имаи Ю., Лу Ёсида Н., Сугита Ю., Танака Т., Цудзимото Г., Сайто Н., Осида Т. (август 2004 г.). «Повышение уровня транскрипта белка KIAA0603, активирующего GTPase в Т-клетках пациентов с атопическим дерматитом». Письма FEBS. 572 (1–3): 135–40. Дои:10.1016 / j.febslet.2004.07.023. PMID  15304337.
9. «Ген Entrez: семейство доменов TBC1D4 TBC1, член 4».
10. Сано Х., Кейн С., Сано Э., Миинея С.П., Асара Дж.М., Лейн В.С., Гарнер С.В., Линхард Г.Е. (апрель 2003 г.). «Стимулируемое инсулином фосфорилирование белка, активирующего ГТФазу Rab, регулирует транслокацию GLUT4». Журнал биологической химии. 278 (17): 14599–602. Дои:10.1074 / jbc.C300063200. PMID  12637568.
11. Кейн С., Сано Х., Лю С.К., Асара Дж. М., Лейн В.С., Гарнер С.К., Линхард Г.Е. (июнь 2002 г.). «Метод идентификации субстратов серинкиназы. Akt фосфорилирует новый белок адипоцитов с доменом Rab GTPase-активирующего белка (GAP)».. Журнал биологической химии. 277 (25): 22115–8. Дои:10.1074 / jbc.C200198200. PMID  11994271.
12. Сано Х., Кейн С., Сано Э., Миинея С.П., Асара Дж.М., Лейн В.С., Гарнер С.В., Линхард Г.Е. (апрель 2003 г.). «Стимулируемое инсулином фосфорилирование белка, активирующего ГТФазу Rab, регулирует транслокацию GLUT4». Журнал биологической химии. 278 (17): 14599–602. Дои:10.1074 / jbc.C300063200. PMID  12637568.
13. Mîinea CP, Sano H, Kane S, Sano E, Fukuda M, Peränen J, Lane WS, Lienhard GE (октябрь 2005 г.). «AS160, субстрат Akt, регулирующий транслокацию GLUT4, имеет функциональный домен Rab GTPase-активирующего белка». Биохимический журнал. 391 (Pt 1): 87–93. Дои:10.1042 / BJ20050887. ЧВК  1237142. PMID  15971998.
14. Kramer HF, Taylor EB, Witczak CA, Fujii N, Hirshman MF, Goodyear LJ (декабрь 2007 г.). «Кальмодулин-связывающий домен AS160 регулирует поглощение глюкозы в скелетных мышцах, но не стимулируемое инсулином». Сахарный диабет. 56 (12): 2854–62. Дои:10.2337 / db07-0681. PMID  17717281.

дальнейшее чтение

• Чен С., Вассерман Д.Х., МакКинтош С., Сакамото К. (2011). «Мыши с мутацией нокина AS160 / TBC1D4-Thr649Ala имеют непереносимость глюкозы с пониженной чувствительностью к инсулину и измененным трафиком GLUT4». Клеточный метаболизм. 13 (1): 68–79. Дои:10.1016 / j.cmet.2010.12.005. ЧВК  3081066. PMID  21195350.
• Нагасе Т., Исикава К., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О. (февраль 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. IX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК исследования. 5 (1): 31–9. Дои:10.1093 / днарес / 5.1.31. PMID  9628581.
• Накаяма М., Кикуно Р., Охара О. (ноябрь 2002 г.). «Белковые взаимодействия между большими белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК». Геномные исследования. 12 (11): 1773–84. Дои:10.1101 / гр. 406902. ЧВК  187542. PMID  12421765.
• Ли С.Ю., Обата Ю., Йошида М., Стокерт Е., Уильямсон Б., Джунгблут А.А., Чен Ю.Т., Старый Ж.Дж., Сканлан М.Дж. (март 2003 г.). «Иммуномический анализ саркомы человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (5): 2651–6. Дои:10.1073 / pnas.0437972100. ЧВК  151395. PMID  12601173.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кантли Л.С., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Джин Дж., Смит Ф. Д., Старк С., Уэллс К. Д., Фосетт Дж. П., Кулкарни С., Метальников П., О'Доннелл П., Тейлор П., Тейлор Л., Зугман А., Вудгетт-младший, Лангеберг Л. К., Скотт Дж. Д., Поусон Т. (август 2004 г.) . «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Текущая биология. 14 (16): 1436–50. Дои:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID  15324660.
• Карлссон HK, Zierath JR, Kane S, Krook A, Lienhard GE, Wallberg-Henriksson H (июнь 2005 г.). «Стимулируемое инсулином фосфорилирование субстрата Akt AS160 нарушается в скелетных мышцах пациентов с диабетом 2 типа». Сахарный диабет. 54 (6): 1692–7. Дои:10.2337 / диабет.54.6.1692. PMID  15919790.
• Ким Дж. Э., Танненбаум SR, Белый FM (2005). «Глобальный фосфопротеом клеток аденокарциномы толстой кишки человека HT-29». Журнал протеомных исследований. 4 (4): 1339–46. Дои:10.1021 / pr050048h. PMID  16083285.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (октябрь 2006 г.). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Природа Биотехнологии. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243.
• Treebak JT, Birk JB, Rose AJ, Kiens B, Richter EA, Wojtaszewski JF (март 2007 г.). «Фосфорилирование AS160 связано с активацией тримерного комплекса альфа2бета2gamma1-, но не альфа2бета2gamma3-AMPK в скелетных мышцах во время физических упражнений у людей». Американский журнал физиологии. Эндокринология и метаболизм. 292 (3): E715–22. Дои:10.1152 / ajpendo.00380.2006. PMID  17077344.
• Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.
• Хоулетт К.Ф., Сакамото К., Гарнхэм А., Камерон-Смит Д., Харгривз М. (июнь 2007 г.). «Упражнения с отягощениями и инсулин регулируют AS160 и взаимодействие с 14-3-3 в скелетных мышцах человека». Сахарный диабет. 56 (6): 1608–14. Дои:10.2337 / db06-1398. PMID  17369524.
• Frøsig C, Rose AJ, Treebak JT, Kiens B, Richter EA, Wojtaszewski JF (август 2007 г.). «Влияние тренировок на выносливость на передачу сигналов инсулина в скелетных мышцах человека: взаимодействия на уровне фосфатидилинозитол-3-киназы, Akt и AS160». Сахарный диабет. 56 (8): 2093–102. Дои:10.2337 / db06-1698. PMID  17513702.