TCIM - TCIM

TCIM
Идентификаторы
Псевдонимы	TCIM, TC-1, TC1, C8orf4, открытая рамка считывания 4 хромосомы 8, регулятор транскрипции и иммунного ответа
Внешние идентификаторы	OMIM: 607702 MGI: 1916318 ГомолоГен: 10590 Генные карты: TCIM
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8p11.21 Начинать 40,153,482 бп[1] Конец 40,155,310 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 | 8 A2 Начинать 24,437,180 бп[2] Конец 24,438,984 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • Пазовое крепление Сотовый компонент • цитоплазма • ядерное пятнышко • ядрышко • ядро клетки • нуклеоплазма • цитозоль • клеточная мембрана • внутриклеточный Биологический процесс • регуляция клеточного цикла фазового перехода G1 / S • активация эндотелиальных клеток, участвующих в иммунном ответе • клеточный ответ на тепло • регуляция ДНК-шаблонной транскрипции в ответ на стресс • регуляция кроветворения • отрицательная регуляция сигнального пути Notch • апоптотический процесс • положительная регуляция передачи сигналов протеинкиназы А • отрицательная регуляция апоптотического процесса • положительная регуляция активности протеинкиназы C • положительная регуляция передачи сигналов NIK / NF-kappaB Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	56892	69068
Ансамбль	ENSG00000176907	ENSMUSG00000056313
UniProt	Q9NR00	Q9D915
RefSeq (мРНК)	NM_020130	NM_026931
RefSeq (белок)	NP_064515	NP_081207
Расположение (UCSC)	Chr 8: 40.15 - 40.16 Мб	Chr 8: 24.44 - 24.44 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

TCIM это белок что у людей кодируется TCIM ген.^[5][6]

Функция

Этот ген кодирует небольшой мономерный, преимущественно неструктурированный белок (106 аминокислоты, 12,3 кДа, изоэлектрическая точка 9.39).^[7] Это положительный регулятор Wnt / бета-катенин сигнальный путь. Этот белок взаимодействует с репрессором транскрипции, опосредованной бета-катенином, на ядерных пятнах. Считается, что он конкурентно блокирует взаимодействия репрессора с бета-катенином, что приводит к усилению регуляции генов-мишеней бета-катенина.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000176907 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000056313 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Чуа Е.Л., Янг Л., Ву В.М., Черепаха-младший, Донг К. (ноябрь 2000 г.). «Клонирование TC-1 (C8orf4), нового гена, сверхэкспрессируемого при раке щитовидной железы». Геномика. 69 (3): 342–7. Дои:10.1006 / geno.2000.6348. PMID  11056052.
6. «Ген Entrez: C8orf4 хромосома 8 открытая рамка считывания 4».
7. Козловский Л.П. (октябрь 2016 г.). «IPC - Калькулятор изоэлектрической точки». Биология Директ. 11 (1): 55. Дои:10.1186 / s13062-016-0159-9. ЧВК  5075173. PMID  27769290.

дальнейшее чтение

• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Геномные исследования. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Sunde M, McGrath KC, Young L, Matthews JM, Chua EL, Mackay JP, Death AK (апрель 2004 г.). «TC-1 представляет собой новый канцерогенный и изначально неупорядоченный белок, связанный с раком щитовидной железы». Исследования рака. 64 (8): 2766–73. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-03-2093. PMID  15087392.
• Friedman JB, Brunschwig EB, Platzer P, Wilson K, Markowitz SD (август 2004 г.). «C8orf4 представляет собой транскрипт, индуцированный трансформирующим фактором роста B, подавленный при метастатическом раке толстой кишки». Международный журнал рака. 111 (1): 72–5. Дои:10.1002 / ijc.20235. PMID  15185345. S2CID  19983783.
• Jung Y, Bang S, Choi K, Kim E, Kim Y, Kim J, Park J, Koo H, Moon RT, Song K, Lee I (январь 2006 г.). «TC1 (C8orf4) усиливает путь Wnt / бета-катенин, ослабляя антагонистическую активность Chibby». Исследования рака. 66 (2): 723–8. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-05-3124. PMID  16424001.
• Kim B, Koo H, Yang S, Bang S, Jung Y, Kim Y, Kim J, Park J, Moon RT, Song K, Lee I (июнь 2006 г.). «TC1 (C8orf4) коррелирует с генами-мишенями Wnt / бета-катенина и агрессивным биологическим поведением при раке желудка». Клинические исследования рака. 12 (11, п. 1): 3541–8. Дои:10.1158 / 1078-0432.CCR-05-2440. PMID  16740781.
• Ян З.К., Штрейхер К.Л., Рэй М.Э., Абрамс Дж., Этье С.П. (декабрь 2006 г.). «Множественные взаимодействующие онкогены на ампликоне 8p11-p12 при раке груди человека». Исследования рака. 66 (24): 11632–43. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-06-2946. PMID  17178857.
• Ян З. К., Моффа А. Б., Хаддад Р., Штрейхер К. Л., Этье С. П. (сентябрь 2007 г.). «Трансформирующие свойства TC-1 при раке груди человека: взаимодействие с сигнальными путями FGFR2 и бета-катенина». Международный журнал рака. 121 (6): 1265–73. Дои:10.1002 / ijc.22831. PMID  17520678. S2CID  25292320.
• Пак Дж., Чжон И, Ким Дж., Ким КИ, Ан С.Г., Сон К, Ли И. (август 2007 г.). «TC1 (C8orf4) активируется клеточным стрессом и опосредует реакцию теплового шока». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 360 (2): 447–52. Дои:10.1016 / j.bbrc.2007.06.077. PMID  17603013.

внешняя ссылка

• Человек C8orf4 расположение генома и C8orf4 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.