Белковый домен TCP - TCP protein domain

TCP
Идентификаторы
СимволTCP
PfamPF03634
ИнтерПроIPR005333
PROSITEPDOC00610
SCOP21грл / Объем / СУПФАМ

В молекулярной биологии белковый домен TCP на самом деле семья факторы транскрипции названный в честь: тэозинте разветвленный 1 (tb1, Zea Mays (Кукуруза )),[1] cycloidea (cyc) (Antirrhinum majus ) (Садовый львиный зев)[2] и пCF в рис (Oryza sativa ).[3]

Функция

Представляется, что члены семейства доменов TCP-белков участвуют в распространение клеток. Он также может играть роль в сигнальные пути так как у него три фосфорилирование места. Домен TCP необходим для специфического связывания с промоторными элементами Ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA) ген, а также в Связывание ДНК.[2]

Эволюция

Эта семья факторы транскрипции являются эксклюзивными для сосудистые растения. Их можно разделить на две группы, TCP-C и TCP-P, которые, по-видимому, разделились после раннего дупликация гена мероприятие.[4] Этот дублирование событие могло привести к функциональному расхождению, и было предложено, что подсемейство TCP-P транскрипционные репрессоры, а подсемейство TPC-C - активаторы транскрипции.[5]

Структура

ПТС белки код за структурно связанные с белки причастен к эволюция ключевых морфологических признаков.[2] Тем не менее биохимический функция CYC и TB1 белки еще предстоит продемонстрировать. Один из консервированные регионы предсказывается, что это неканонический основная-спираль-петля-спираль (bHLH) структура. Этот домен также содержится в двух ДНК-связывающих белках риса, PCF1 и PCF2, где, как было показано, он участвует в связывании ДНК и димеризация.

Рекомендации

  1. ^ Finlayson SA (май 2007 г.). «Arabidopsis Teosinte Branched1-like 1 регулирует отрастание пазушных почек и гомологичен однодольному Teosinte Branched1». Физиология растительной клетки. 48 (5): 667–77. Дои:10,1093 / pcp / pcm044. PMID  17452340.
  2. ^ а б c Кубас П., Лаутер Н., Добли Дж., Коэн Э. (апрель 1999 г.). «Домен TCP: мотив, обнаруженный в белках, регулирующих рост и развитие растений». Завод J. 18 (2): 215–22. Дои:10.1046 / j.1365-313x.1999.00444.x. PMID  10363373.
  3. ^ Косуги С., Охаши Ю. (май 2002 г.). «Связывание ДНК и специфичность димеризации и потенциальные мишени для семейства белков TCP». Завод J. 30 (3): 337–48. Дои:10.1046 / j.1365-313x.2002.01294.x. PMID  12000681.
  4. ^ Navaud O, Dabos P, Carnus E, Tremousaygue D, Hervé C (июль 2007 г.). «Факторы транскрипции TCP предшествуют появлению наземных растений». J. Mol. Evol. 65 (1): 23–33. Bibcode:2007JMolE..65 ... 23N. Дои:10.1007 / s00239-006-0174-z. PMID  17568984. S2CID  2961858.
  5. ^ Ли К., Потущак Т., Колон-Кармона А., Гутьеррес Р.А., Дёрнер П. (сентябрь 2005 г.). «Arabidopsis TCP20 связывает регуляцию роста и пути контроля клеточного деления». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 102 (36): 12978–83. Bibcode:2005ПНАС..10212978Л. Дои:10.1073 / pnas.0504039102. ЧВК  1200278. PMID  16123132.
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR005333

внешняя ссылка