TFDP2 - TFDP2

TFDP2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1CF7
Идентификаторы
Псевдонимы	TFDP2, DP2, фактор транскрипции Dp-2
Внешние идентификаторы	OMIM: 602160 MGI: 107167 ГомолоГен: 4578 Генные карты: TFDP2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3q23 Начните 141,944,428 бп[1] Конец 142,149,544 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 E3.3 Начните 96,196,275 бп[2] Конец 96,323,646 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Связывание ДНК • связывание фактора транскрипции • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0001104 активность корегулятора транскрипции • специфическое связывание белкового домена • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • ядро клетки • комплекс регуляторов транскрипции • нуклеоплазма • митохондрия • Комплекс факторов транскрипции РНК-полимеразы II Биологический процесс • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • клеточный цикл • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • GO: 0007067 митотический клеточный цикл • Ответ на повреждение ДНК, передача сигнала медиатором класса p53, приводящая к остановке клеточного цикла • развитие сердца • транскрипция, ДНК-шаблон • положительная регуляция вставки белка в митохондриальную мембрану, участвующую в сигнальном пути апоптоза • регуляция транскрипции, вовлеченная в G1 / S переход митотического клеточного цикла • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • отрицательное регулирование перехода G0 на G1 • регуляция клеточного цикла Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	7029	211586
Ансамбль	ENSG00000114126	ENSMUSG00000032411
UniProt	Q14188	Q64163
RefSeq (мРНК)	NM_001178138 NM_001178139 NM_001178140 NM_001178141 NM_001178142 NM_006286 NM_001375756 NM_001375773 NM_001375774 NM_001375775 NM_001375776 NM_001375778 NM_001375779 NM_001375780	NM_001184706 NM_001184708 NM_001184709 NM_001184710 NM_001184711 NM_178667
RefSeq (белок)	NP_001171609 NP_001171610 NP_001171611 NP_001171612 NP_001171613 NP_006277 NP_001362685 NP_001362702 NP_001362703 NP_001362704 NP_001362705 NP_001362707 NP_001362708 NP_001362709	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 3: 141.94 - 142.15 Мб	Chr 9: 96,2 - 96,32 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции Dp-2 это белок что у людей кодируется TFDP2 ген.^[5][6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000114126 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032411 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Чжан И, Chellappan SP (июль 1995 г.). «Клонирование и характеристика человеческого DP2, нового партнера димеризации E2F». Онкоген. 10 (11): 2085–93. PMID  7784053.
6. Чжан Ю., Венкатрадж В.С., Фишер С.Г., Уорбертон Д., Челлаппан С.П. (март 1997 г.). «Геномное клонирование и хромосомное присвоение семейства генов TFDP партнера по димеризации E2F». Геномика. 39 (1): 95–8. Дои:10.1006 / geno.1996.4473. PMID  9027491.
7. «Ген Entrez: фактор транскрипции TFDP2 Dp-2 (партнер по димеризации E2F 2)».

дальнейшее чтение

• Ву К.Л., Цукерберг Л.Р., Нгву С. и др. (1995). «Связь in vivo белков семейства E2F и DP». Мол. Клетка. Биол. 15 (5): 2536–46. Дои:10.1128 / mcb.15.5.2536. ЧВК  230484. PMID  7739537.
• Роджерс К.Т., Хиггинс П.Д., Милла М.М. и др. (1996). «DP-2, гетеродимерный партнер E2F: идентификация и характеристика белков DP-2, экспрессируемых in vivo». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (15): 7594–9. Дои:10.1073 / пнас.93.15.7594. ЧВК  38791. PMID  8755520.
• Луазо Л., Пасто С., Брун Г. (1998). «Молекулярное клонирование и паттерн экспрессии членов DP фактора транскрипции E2F курицы». Джин Экспр. 6 (5): 259–73. ЧВК  6148286. PMID  9368098.
• Тримарчи Дж. М., Фэйрчайлд Б., Верона Р. и др. (1998). «E2F-6, член семейства E2F, который может вести себя как репрессор транскрипции». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (6): 2850–5. Дои:10.1073 / пнас.95.6.2850. ЧВК  19658. PMID  9501179.
• Гаубац С., Вуд Дж. Г., Ливингстон Д. М. (1998). «Необычные свойства остановки пролиферации и контроля транскрипции недавно открытого члена семейства E2F, E2F-6». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (16): 9190–5. Дои:10.1073 / пнас.95.16.9190. ЧВК  21314. PMID  9689056.
• Чжэн Н., Френкель Э, Пабо КО, Павлетич Н.П. (1999). «Структурные основы распознавания ДНК гетеродимерным фактором транскрипции клеточного цикла E2F – DP». Genes Dev. 13 (6): 666–74. Дои:10.1101 / gad.13.6.666. ЧВК  316551. PMID  10090723.
• Korz C, Pscherer A, Benner A и др. (2002). «Доказательства различных патомеханизмов В-клеточного хронического лимфоцитарного лейкоза и мантийно-клеточной лимфомы путем количественного анализа экспрессии клеточного цикла и генов, связанных с апоптозом». Кровь. 99 (12): 4554–61. Дои:10.1182 / кровь.V99.12.4554. PMID  12036888.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Пак К.К., Деок Ан Дж., Ли И.К. и др. (2003). «Ингибирующие эффекты новых олигодезоксинуклеотидов-ловушек E2F на пролиферацию мезангиальных клеток путем совместной экспрессии E2F / DP». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 308 (4): 689–97. Дои:10.1016 / S0006-291X (03) 01455-4. PMID  12927774.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q14188 (Фактор транскрипции Dp-2) на PDBe-KB.