THOP1 - THOP1

THOP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1С4Б, 2O36
Идентификаторы
Псевдонимы	THOP1, EP24.15, MEPD_HUMAN, MP78, TOP, тиметолигопептидаза 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 601117 MGI: 1354165 ГомолоГен: 55726 Генные карты: THOP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19p13.3 Начните 2,785,503 бп[1] Конец 2,815,807 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 C1 | 10 39,72 см Начните 81,070,035 бп[2] Конец 81,082,559 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание пептида • пептидазная активность • гидролазная активность • металлопептидазная активность • связывание ионов металлов • металлоэндопептидазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • митохондриальное межмембранное пространство • цитозоль Биологический процесс • протеолиз • пептидный метаболический процесс • полиубиквитинирование белков Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	7064	50492
Ансамбль	ENSG00000172009	ENSMUSG00000004929
UniProt	P52888	Q8C1A5
RefSeq (мРНК)	NM_003249	NM_022653
RefSeq (белок)	NP_003240	NP_073144
Расположение (UCSC)	Chr 19: 2,79 - 2,82 Мб	Chr 10: 81.07 - 81.08 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Тимет олигопептидаза является фермент что у людей кодируется THOP1 ген.^[5][6]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000172009 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000004929 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Торрес М.П., ​​Прейндж С., Леннон Г. (декабрь 1998 г.). «Человеческая эндопептидаза 24.15 (THOP1) локализована на хромосоме 19p13.3 и исключена из области сцепления при болезни Альцгеймера с поздним началом». Геномика. 53 (2): 239–40. Дои:10.1006 / geno.1998.5487. PMID  9790774.
6. «Ген Entrez: тиметолигопептидаза 1 THOP1».

дальнейшее чтение

• Томпсон А., Хубер Г., Мальерб П. (1995). «Клонирование и функциональная экспрессия металлоэндопептидазы из головного мозга человека со способностью расщеплять пептид субстрата бета-APP». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 213 (1): 66–73. Дои:10.1006 / bbrc.1995.2099. PMID  7639763.
• Папастойсис Г., Симан Р., Скотт Р., Абрахам С. Р. (1994). «Идентификация металлопротеиназы из головного мозга болезни Альцгеймера, способной разрушать белок-предшественник бета-амилоида и генерировать амилоидогенные фрагменты». Биохимия. 33 (1): 192–9. Дои:10.1021 / bi00167a025. PMID  8286339.
• Дандо П.М., Браун М.А., Барретт А.Дж. (1993). «Тиметолигопептидаза человека». Biochem. J. 294 (Pt 2): 451–7. Дои:10.1042 / bj2940451. ЧВК  1134475. PMID  8373360.
• Meckelein B, de Silva HA, Roses AD и др. (1997). «Человеческая эндопептидаза (THOP1) локализована на хромосоме 19 в области сцепления локуса AD2 с поздним началом болезни Альцгеймера». Геномика. 31 (2): 246–9. Дои:10.1006 / geno.1996.0041. PMID  8824811.
• Crack PJ, Wu TJ, Cummins PM и др. (1999). «Ассоциация металлоэндопептидазы EC 3.4.24.15 на внеклеточной поверхности плазматической мембраны клетки AtT-20». Мозг Res. 835 (2): 113–24. Дои:10.1016 / S0006-8993 (99) 01494-8. PMID  10415366. S2CID  23769423.
• Пино С., МакКул С., Глюксман М.Дж. и др. (2000). «Распределение тиметолигопептидазы (E.C. 3.4.24.15) в семенниках человека и крысы». J. Cell Sci. 112 (20): 3455–62. PMID  10504294.
• Ферро Е.С., Туллай Дж. В., Глюксман М. Дж., Робертс Дж. Л. (1999). «Секреция металлоэндопептидазы 24.15 (EC 3.4.24.15)». ДНК клетки биол. 18 (10): 781–9. Дои:10.1089/104454999314926. HDL:11449/37910. PMID  10541437.
• Туллай Дж. У., Камминз П. М., Пабон А. и др. (2001). «Фермент процессинга нейропептида EC 3.4.24.15 модулируется фосфорилированием протеинкиназы А». J. Biol. Chem. 275 (47): 36514–22. Дои:10.1074 / jbc.M001843200. PMID  10969067.
• Молина Х.М., Кармона А.К., Куюмджян М., Борхес Д.Р. (2000). «Тиметолигопептидаза EC 3.4.24.15 является основной кининазой печени». Life Sci. 67 (5): 509–20. Дои:10.1016 / S0024-3205 (00) 00650-0. PMID  10993116.
• Сарик Т., Бенинга Дж., Грэф К.И. и др. (2001). «Антигенные пептиды, представленные основным комплексом гистосовместимости класса I, разлагаются в цитозольных экстрактах главным образом под действием тиметолигопептидазы». J. Biol. Chem. 276 (39): 36474–81. Дои:10.1074 / jbc.M105517200. PMID  11479311.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Джоли-Перейра Л., Фонтенеле-Нето Д. Д., Борхес Д. Р., Куюмджян М. (2003). «Локализация EP24.15, основной кининазы печени». J. Histochem. Cytochem. 51 (1): 125–7. Дои:10.1177/002215540305100115. PMID  12502762.
• York IA, Mo AX, Lemerise K, et al. (2003). «Цитозольная эндопептидаза, тиметолигопептидаза, разрушает антигенные пептиды и ограничивает степень презентации антигена MHC класса I». Иммунитет. 18 (3): 429–40. Дои:10.1016 / S1074-7613 (03) 00058-X. PMID  12648459.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Рэй К., Хайнс С.С., Колл-Родригес Дж., Роджерс Д.В. (2004). «Кристаллическая структура тиметолигопептидазы человека дает представление о распознавании, регуляции и локализации субстрата». J. Biol. Chem. 279 (19): 20480–9. Дои:10.1074 / jbc.M400795200. PMID  14998993.
• Гримвуд Дж., Гордон Л.А., Олсен А. и др. (2004). «Последовательность ДНК и биология хромосомы 19 человека». Природа. 428 (6982): 529–35. Дои:10.1038 / природа02399. PMID  15057824.
• Ленер Б, Сандерсон CM (2004). «Структура взаимодействия белков для деградации мРНК человека». Genome Res. 14 (7): 1315–23. Дои:10.1101 / gr.2122004. ЧВК  442147. PMID  15231747.
• Сарич Т., Грэф К.И., Голдберг А.Л. (2004). «Путь деградации пептидов, генерируемых протеасомами: ключевая роль тиметолигопептидазы и других металлопептидаз». J. Biol. Chem. 279 (45): 46723–32. Дои:10.1074 / jbc.M406537200. PMID  15328361.
• Shivakumar BR, Wang Z, Hammond TG, Harris RC (2005). «EP24.15 взаимодействует с рецептором ангиотензина II типа I и рецептором брадикинина B2». Cell Biochem. Funct. 23 (3): 195–204. Дои:10.1002 / cbf.1176. PMID  15376229. S2CID  5695331.