TNRC6A - TNRC6A

TNRC6A
Идентификаторы
Псевдонимы	TNRC6A, CAGH26, GW1, GW182, TNRC6, тринуклеотидный повтор, содержащий 6A, FAME6, тринуклеотидный повтор, содержащий адаптер 6A
Внешние идентификаторы	OMIM: 610739 MGI: 2385292 ГомолоГен: 41399 Генные карты: TNRC6A
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 16 (человек)[1] Группа 16п12.1 Начните 24,610,209 бп[1] Конец 24,827,632 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 F2-F3 Начните 123,123,885 бп[2] Конец 123,195,296 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание нуклеиновой кислоты • Связывание РНК Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • аппарат Гольджи • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • П-боди • нуклеоплазма Биологический процесс • посттранскрипционное молчание генов с помощью РНК • подавление гена с помощью miRNA • регулирование перевода • miRNA-опосредованное ингибирование трансляции • Сигнальный путь Wnt, путь модуляции кальция • подавление гена с помощью РНК • регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA • регуляция дифференцировки мегакариоцитов • клеточный ответ на голодание • положительная регуляция экспрессии генов • отрицательная регуляция экспрессии генов • положительная регуляция укорочения поли (A) хвоста мРНК, транскрибируемой ядром Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	27327	233833
Ансамбль	ENSG00000090905 ENSG00000288130	ENSMUSG00000052707
UniProt	Q8NDV7	Q3UHK8
RefSeq (мРНК)	NM_014494 NM_001330520 NM_001351850	NM_144925
RefSeq (белок)	NP_001317449 NP_055309 NP_001338779	NP_659174
Расположение (UCSC)	Chr 16: 24,61 - 24,83 Мб	Chr 7: 123.12 - 123,2 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Ген 6А, содержащий тринуклеотидный повтор, белок это белок что у людей кодируется TNRC6A ген.^[5][6]

Этот ген кодирует член тринуклеотидного повтора, содержащий 6 белков семейства. Белок участвует в посттранскрипционном замалчивании генов через РНК-интерференция (РНКи) и микроРНК пути. Белок связывается с матричными РНК и Аргонавт белки в цитоплазматических тельцах, известные как GW-тельца или P-тельца. Ингибирование экспрессии этого гена делокализует другие белки тела GW и нарушает индуцированное РНКи и микроРНК молчание генов.^[6]

использованная литература

1. ENSG00000288130 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000090905, ENSG00000288130 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000052707 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Марголис Р.Л., Абрахам М.Р., Гатчелл С.Б., Ли С.Х., Кидвай А.С., Брешель Т.С., Стайн О.К., Каллахан К., Макиннис М.Г., Росс Калифорния (июль 1997 г.). «кДНК с длинными тринуклеотидными повторами CAG из человеческого мозга». Hum Genet. 100 (1): 114–22. Дои:10.1007 / s004390050476. PMID  9225980. S2CID  25999127.
6. «Ген Entrez: тринуклеотидный повтор TNRC6A, содержащий 6A».

дальнейшее чтение

• Ямагата К., Такеда Дж., Мензель С. и др. (1996). «Поиск генов восприимчивости к NIDDM: исследования генов с триплетными повторами, экспрессируемыми в скелетных мышцах». Диабетология. 39 (6): 725–730. Дои:10.1007 / BF00418545. PMID  8781769. S2CID  41411039.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Диас Нето Э., Корреа Р.Г., Верджовски-Алмейда С. и др. (2000). «Секвенирование человеческого транскриптома с использованием тегов последовательности, экспрессируемой ORF». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (7): 3491–3496. Дои:10.1073 / pnas.97.7.3491. ЧВК  16267. PMID  10737800.
• Нагасе Т., Кикуно Р., Исикава К. и др. (2000). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XVII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 7 (2): 143–150. Дои:10.1093 / dnares / 7.2.143. PMID  10819331.
• Eystathioy T, Chan EK, Tenenbaum SA и др. (2002). «Фосфорилированный цитоплазматический аутоантиген, GW182, ассоциируется с уникальной популяцией мРНК человека в новых цитоплазматических пятнах». Мол. Биол. Ячейка. 13 (4): 1338–1351. Дои:10.1091 / mbc.01-11-0544. ЧВК  102273. PMID  11950943.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–16903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Eystathioy T, Chan EK, Mahler M и др. (2004). «Панель моноклональных антител к цитоплазматическим тельцам GW и мРНК-связывающему белку GW182». Гибридный. Гибридомика. 22 (2): 79–86. Дои:10.1089/153685903321947996. PMID  12831532.
• Eystathioy T, Jakymiw A, Chan EK и др. (2003). «Белок GW182 колокализуется с белками, ассоциированными с деградацией мРНК hDcp1 и hLSm4 в цитоплазматических тельцах GW». РНК. 9 (10): 1171–1173. Дои:10.1261 / rna.5810203. ЧВК  1370480. PMID  13130130.
• Eystathioy T, Chan EK, Takeuchi K, et al. (2004). «Клинические и серологические ассоциации аутоантител к тельцам GW и новый цитоплазматический аутоантиген GW182». J. Mol. Med. 81 (12): 811–818. Дои:10.1007 / s00109-003-0495-у. PMID  14598044. S2CID  31604559.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–45. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–2127. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ян З., Жакиму А., Вуд М. Р. и др. (2005). «GW182 имеет решающее значение для стабильности тел GW, экспрессируемых во время клеточного цикла и пролиферации». J. Cell Sci. 117 (Pt 23): 5567–5578. Дои:10.1242 / jcs.01477. PMID  15494374.
• Сен Г.Л., Блау Х.М. (2005). «Argonaute 2 / RISC находится в сайтах распада мРНК млекопитающих, известных как цитоплазматические тельца». Nat. Cell Biol. 7 (6): 633–636. Дои:10.1038 / ncb1265. PMID  15908945. S2CID  6085169.
• Rehwinkel J, Behm-Ansmant I, Gatfield D, Izaurralde E (2005). «Решающая роль GW182 и комплекса декапирования DCP1: DCP2 в опосредованном miRNA сайленсинге генов». РНК. 11 (11): 1640–1647. Дои:10.1261 / rna.2191905. ЧВК  1370850. PMID  16177138.
• Jakymiw A, Lian S, Eystathioy T и др. (2006). «Разрушение тел GW нарушает интерференцию РНК млекопитающих». Nat. Cell Biol. 7 (12): 1167–1174. Дои:10.1038 / ncb1334. PMID  16284622. S2CID  36630239.
• Лю Дж., Ривас Ф.В., Вольшлегель Дж. И др. (2006). «Роль компонента P-тела GW182 в функции микроРНК». Nat. Cell Biol. 7 (12): 1161–1166. Дои:10.1038 / ncb1333. ЧВК  1804202. PMID  16284623.
• Lian S, Jakymiw A, Eystathioy T и др. (2007). «Тельца GW, микроРНК и клеточный цикл». Клеточный цикл. 5 (3): 242–245. Дои:10.4161 / cc.5.3.2410. PMID  16418578.
• Бем-Ансмант И., Ревинкель Дж., Доеркс Т. и др. (2006). «Для деградации мРНК с помощью miRNA и GW182 требуются как CCR4: НЕ деаденилаза, так и комплексы декапирования DCP1: DCP2». Genes Dev. 20 (14): 1885–1898. Дои:10.1101 / gad.1424106. ЧВК  1522082. PMID  16815998.
• Schneider MD, Najand N, Chaker S и др. (2006). «Гавки - это компонент тел, обрабатывающих цитоплазматическую мРНК, необходимый для раннего развития дрозофилы». J. Cell Biol. 174 (3): 349–358. Дои:10.1083 / jcb.200512103. ЧВК  2064231. PMID  16880270.