TRAK2 - TRAK2

TRAK2
Идентификаторы
Псевдонимы	TRAK2, ALS2CR3, CALS-C, GRIF-1, GRIF1, MILT2, OIP98, перенос белка кинезина 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 607334 MGI: 1918077 ГомолоГен: 22861 Генные карты: TRAK2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q33.1 Начинать 201,377,207 бп[1] Конец 201,451,500 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 | 1 C1.3 Начинать 58,900,449 бп[2] Конец 58,973,430 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • рецепторное связывание • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание рецептора ГАМК • связывание кинезина • Привязка домена TPR • связывание ферментов • связывание миозина Сотовый компонент • цитоплазма • эндосома • клеточная мембрана • ранняя эндосома • митохондрия • ядро клетки • дендритная цитоплазма • дендрит • проекция нейрона • тело нейрональной клетки • конус роста аксонов • цитоплазматический пузырек • цитоплазма аксона Биологический процесс • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • нацеливание на белок • О-связанное гликозилирование белков • антероградный дендритный транспорт митохондрий • транспорт от эндосомы к лизосомам • морфогенез дендритов • отрицательная регуляция аксоногенеза • дендритный транспорт митохондрии • антероградный аксональный транспорт • локализация белка • нейрогенез • транспорт везикул по микротрубочкам • распределение митохондрий • антероградный аксональный транспорт митохондрии Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	66008	70827
Ансамбль	ENSG00000115993	ENSMUSG00000026028
UniProt	O60296	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_015049	NM_172406
RefSeq (белок)	NP_055864	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 2: 201.38 - 201.45 Мб	Chr 1: 58.9 - 58.97 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Перенос кинезин-связывающего белка 2 это белок что у людей кодируется TRAK2 ген.^[5][6][7]

Взаимодействия

TRAK2 был показан взаимодействовать с Kir2.1^[8] и GABRB2.^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000115993 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026028 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Хадано С., Янагисава И., Скауг Дж., Фихтер К., Насир Дж., Мартиндейл Д., Куп Б.Ф., Шерер С.В., Николсон Д.В., Руло Г.А., Икеда Дж., Хайден М.Р. (январь 2001 г.). «Клонирование и характеристика трех новых генов, ALS2CR1, ALS2CR2 и ALS2CR3, в критической области ювенильного бокового амиотрофического склероза (ALS2) на хромосоме 2q33-q34: гены-кандидаты для ALS2». Геномика. 71 (2): 200–13. Дои:10.1006 / geno.2000.6392. PMID  11161814.
6. Gilbert SL, Zhang L, Forster ML, Anderson JR, Iwase T, Soliven B, Donahue LR, Sweet HO, Bronson RT, Davisson MT, Wollmann RL, Lahn BT (февраль 2006 г.). «Мутация Trak1 нарушает гомеостаз рецептора ГАМК (A) у мышей с гипертонией». Природа Генетика. 38 (2): 245–50. Дои:10,1038 / ng1715. PMID  16380713. S2CID  20231963.
7. «Ген Entrez: транспортный белок TRAK2, связывание кинезина 2».
8. Гришин А., Ли Х., Левитан Е.С., Закс-Махина Э. (октябрь 2006 г.). «Идентификация фактора 1, взаимодействующего с рецептором гамма-аминомасляной кислоты (TRAK2), как фактора трафика для K + канала Kir2.1». Журнал биологической химии. 281 (40): 30104–11. Дои:10.1074 / jbc.M602439200. PMID  16895905.
9. Бек М., Брикли К., Уилкинсон Х. Л., Шарма С., Смит М., Чазот П. Л., Поллард С., Стивенсон Ф. А. (август 2002 г.). «Идентификация, молекулярное клонирование и характеристика нового белка, ассоциированного с рецептором GABAA, GRIF-1». Журнал биологической химии. 277 (33): 30079–90. Дои:10.1074 / jbc.M200438200. PMID  12034717.

дальнейшее чтение

• Нагасе Т., Исикава К., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О. (февраль 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. IX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК исследования. 5 (1): 31–9. Дои:10.1093 / днарес / 5.1.31. PMID  9628581.
• Мачадо Р.Д., Паучуло М.В., Фретвелл Н., Телятина С., Томсон Дж. Р., Вилариньо Гуэль С., Олдред М., Браннон, Калифорния, Трембат Р. К., Николс В. К. (сентябрь 2000 г.). «Физическая карта и карта транскриптов, основанная на уточнении критического интервала для PPH1, гена семейной первичной легочной гипертензии. Международный консорциум PPH». Геномика. 68 (2): 220–8. Дои:10.1006 / geno.2000.6291. PMID  10964520.
• Бек М., Брикли К., Уилкинсон Х.Л., Шарма С., Смит М., Чазот П.Л., Поллард С., Стивенсон Ф.А. (август 2002 г.). «Идентификация, молекулярное клонирование и характеристика нового белка, ассоциированного с рецептором GABAA, GRIF-1». Журнал биологической химии. 277 (33): 30079–90. Дои:10.1074 / jbc.M200438200. PMID  12034717.
• Айер С.П., Акимото Ю., Харт Г.В. (февраль 2003 г.). «Идентификация и клонирование нового семейства белков домена спиральной спирали, которые взаимодействуют с трансферазой O-GlcNAc». Журнал биологической химии. 278 (7): 5399–409. Дои:10.1074 / jbc.M209384200. PMID  12435728.
• Брикли К., Смит М.Дж., Бек М., Стивенсон Ф.А. (апрель 2005 г.). «GRIF-1 и OIP106, члены нового семейства генов белков со спиральной спиралью: ассоциация in vivo и in vitro с кинезином». Журнал биологической химии. 280 (15): 14723–32. Дои:10.1074 / jbc.M409095200. PMID  15644324.
• Франссон С., Руусала А., Аспенстрём П. (июнь 2006 г.). «Атипичные Rho GTPases Miro-1 и Miro-2 играют важную роль в митохондриальном движении». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 344 (2): 500–10. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.03.163. PMID  16630562.
• Смит MJ, Pozo K, Brickley K, Stephenson FA (сентябрь 2006 г.). «Картирование GRIF-1 связывающего домена кинезина, KIF5C, подтверждает роль GRIF-1 как адапторного белка в антероградной транспортировке грузов». Журнал биологической химии. 281 (37): 27216–28. Дои:10.1074 / jbc.M600522200. PMID  16835241.
• Гришин А., Ли Х., Левитан Е.С., Закс-Махина Е. (октябрь 2006 г.). «Идентификация фактора 1, взаимодействующего с рецептором гамма-аминомасляной кислоты (TRAK2), как фактора трафика для K + канала Kir2.1». Журнал биологической химии. 281 (40): 30104–11. Дои:10.1074 / jbc.M602439200. PMID  16895905.