TREX2 - TREX2

TREX2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1Y97
Идентификаторы
Псевдонимы	TREX2, три экзонуклеазы первичной репарации 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 300370 MGI: 1346343 ГомолоГен: 8046 Генные карты: TREX2
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xq28 Начните 153,444,720 бп[1] Конец 153,470,587 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X | X A7.3 Начните 73,433,705 бп[2] Конец 73,435,344 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • нуклеазная активность • активность экзодезоксирибонуклеазы III • экзонуклеазная активность • гидролазная активность • активность гомодимеризации белков • связывание ионов магния • 3'-5'-экзодезоксирибонуклеазная активность • связывание ионов металлов • связывание нуклеиновой кислоты • 3'-5 'экзонуклеазная активность Сотовый компонент • ядро клетки Биологический процесс • Ремонт ДНК • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • гидролиз фосфодиэфирной связи нуклеиновой кислоты • Метаболический процесс ДНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	11219	24102
Ансамбль	ENSG00000183479	ENSMUSG00000031372
UniProt	Q9BQ50	Q9R1A9
RefSeq (мРНК)	NM_080701 NM_080699 NM_080700	NM_011907
RefSeq (белок)	NP_542432	NP_036037
Расположение (UCSC)	Chr X: 153,44 - 153,47 Мб	Chr X: 73,43 - 73,44 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Три первичных репарации экзонуклеазы 2 является фермент что у людей кодируется TREX2 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует белок с 3 'экзонуклеаза Мероприятия. Ферменты с этой активностью участвуют в Репликация ДНК, ремонт и рекомбинация. Сходство с Кишечная палочка белок предполагает, что этот фермент может быть субъединицей ДНК-полимераза III, который не обладает собственной экзонуклеазной активностью.^[6]

Мутации в этом гене могут привести к Синдром Айкарди-Гутьереса

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000183479 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031372 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Mazur DJ, Perrino FW (август 1999 г.). «Идентификация и экспрессия последовательностей кДНК TREX1 и TREX2, кодирующих 3 '-> 5' экзонуклеазы млекопитающих». J Biol Chem. 274 (28): 19655–60. Дои:10.1074 / jbc.274.28.19655. PMID  10391904.
6. "Энтрез Ген: TREX2 три экзонуклеазы первичной репарации 2".

дальнейшее чтение

• Шевелев И.В., Hübscher U (2002). «Экзонуклеазы 3 '5'». Nat. Преподобный Мол. Cell Biol. 3 (5): 364–76. Дои:10.1038 / nrm804. PMID  11988770.
• Эспозито Т., Циккодикола А., Флагиелло Л. и др. (1997). «Экспрессированные STS и транскрипция человеческого Xq28». Ген. 187 (2): 185–91. Дои:10.1016 / S0378-1119 (96) 00772-X. PMID  9099879.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Ли Т., Дуан В., Ян Х и др. (2001). «Идентификация двух белков, S14 и UIP1, которые взаимодействуют с UCH37». FEBS Lett. 488 (3): 201–5. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 02436-4. HDL:10536 / DRO / DU: 30009147. PMID  11163772.
• Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Мазур DJ, Перрино FW (2001). «Структура и экспрессия генов 3 '-> 5' экзонуклеаз TREX1 и TREX2». J. Biol. Chem. 276 (18): 14718–27. Дои:10.1074 / jbc.M010051200. PMID  11278605.
• Мазур DJ, Перрино FW (2001). «Иссечение 3 'концов 3' -> 5 'экзонуклеазами Trex1 и TREX2. Характеристика рекомбинантных белков». J. Biol. Chem. 276 (20): 17022–9. Дои:10.1074 / jbc.M100623200. PMID  11279105.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Шевелев И.В., Белякова Н.В., Кравецкая Т.П., Крутяков В.М. (2003). «[Корректирующая роль автономных 3 '-> 5' экзонуклеаз в мультиферментных ДНК-полимеразных комплексах млекопитающих]». Мол. Биол. (Моск.). 36 (6): 1055–61. PMID  12500544.
• Шевелев И.В., Рамадан К., Хюбшер У. (2004). «Экзонуклеаза TREX2 3 '-> 5' физически взаимодействует с дельта ДНК-полимеразой и увеличивает ее точность». ScientificWorldJournal. 2: 275–81. Дои:10.1100 / tsw.2002.99. ЧВК  6009725. PMID  12806015.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Перрино Ф.В., Крол А., Харви С. и др. (2005). «Варианты последовательностей в 3 '-> 5' дезоксирибонуклеазе TREX2: идентификация в генетическом скрининге и влияние на катализ рекомбинантными белками». Adv. Энзим Регул. 44: 37–49. Дои:10.1016 / j.advenzreg.2003.11.010. PMID  15581481.
• Перрино Ф.В., Харви С., МакМиллин С., Холлис Т. (2005). «Структура 3 '-> 5'-экзонуклеазы TREX2 человека предполагает механизм эффективного непроцессивного катализа ДНК». J. Biol. Chem. 280 (15): 15212–8. Дои:10.1074 / jbc.M500108200. PMID  15661738.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Хан Й, Ли Б. (2007). «Человеческие бессмысленные мутации, выявленные сравнением геномных последовательностей». Гм. Genet. 119 (1–2): 169–78. Дои:10.1007 / s00439-005-0125-6. PMID  16395595.
• Чен MJ, Ма С.М., Dumitrache LC, Hasty P (2007). «Биохимические и клеточные характеристики 3 '-> 5' экзонуклеазы TREX2». Нуклеиновые кислоты Res. 35 (8): 2682–94. Дои:10.1093 / нар / гкм151. ЧВК  1885668. PMID  17426129.

внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q9BQ50 (Экзонуклеаза 2 первичной репарации Human Three) на PDBe-KB.
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q9R1A9 (Экзонуклеаза 2 первичной репарации Mouse Three) на PDBe-KB.