TRIM16 - TRIM16

TRIM16
Идентификаторы
Псевдонимы	TRIM16, EBBP, трехчастный мотив, содержащий 16
Внешние идентификаторы	OMIM: 609505 MGI: 2137356 ГомолоГен: 4726 Генные карты: TRIM16
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[1] Группа 11 | 11 B2 Начинать 62,820,231 бп[1] Конец 62,850,808 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание ионов цинка • связывание интерлейкина-1 • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • Привязка домена NACHT • трансферазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • Тело PML • внутриклеточный • цитозоль • клеточная мембрана Биологический процесс • ацетилирование гистона H4 • положительная регуляция дифференцировки кератиноцитов • положительная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • реакция на фосфорорганические соединения • положительная регуляция сигнального пути рецептора ретиноевой кислоты • ответ на ретиноевую кислоту • ацетилирование гистона H3 • ответ на гормон роста Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10626	94092
Ансамбль	ENSG00000221926	ENSMUSG00000047821
UniProt	O95361	Q99PP9
RefSeq (мРНК)	NM_006470	NM_053169
RefSeq (белок)	NP_006461 NP_001335049 NP_001335050 NP_001335051 NP_001335053 NP_001335054 NP_001335055 NP_001335048	NP_444399
Расположение (UCSC)	н / д	Chr 11: 62,82 - 62,85 Мб
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок, содержащий трехчастный мотив 16 это белок что у людей кодируется TRIM16 ген.^[4][5]

Этот ген был идентифицирован как эстроген и антиэстроген регулируемый ген в эпителиальные клетки стабильно экспрессирующий рецептор эстрогена. Белок, кодируемый этим геном, содержит два B-боксовых домена и спирально-спиральную область, которые характерны для Цинковый палец коробки B семейство белков.

Сообщалось, что белки этого семейства участвуют во множестве биологических процессов, включая рост клеток, дифференциация и патогенез. Экспрессия этого гена была обнаружена в большинстве тканей. Однако его функция еще не определена.^[5]

Рекомендации

1. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000047821 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Реймонд А., Мерони Дж., Фантоцци А., Мерла Дж., Каир С., Лузи Л., Риганелли Д., Занария Е., Мессали С., Кайнарка С., Гуффанти А., Минуччи С., Пеликчи П. Г., Баллабио А. (май 2001 г.). «Семейство трехчастных мотивов идентифицирует клеточные компартменты». EMBO J. 20 (9): 2140–51. Дои:10.1093 / emboj / 20.9.2140. ЧВК  125245. PMID  11331580.
5. "Entrez Gene: TRIM16, содержащий трехкомпонентный мотив 16".

дальнейшее чтение

• Лю Х.Л., Голдер-Новосельский Э., Сето М.Х. и др. (1999). «Новый ген эстроген-чувствительного B-бокса (EBBP) регулируется тамоксифеном в клетках, экспрессирующих мутантный ДНК-связывающий домен рецептора эстрогена». Мол. Эндокринол. 12 (11): 1733–48. Дои:10.1210 / me.12.11.1733. PMID  9817599.
• Beer HD, Munding C, Dubois N, et al. (2002). «Эстроген-чувствительный белок B-бокса: новый регулятор дифференцировки кератиноцитов». J. Biol. Chem. 277 (23): 20740–9. Дои:10.1074 / jbc.M111233200. PMID  11919186.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004ПНАС..10112130Б. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Munding C, Keller M, Niklaus G и др. (2006). «Эстроген-чувствительный белок B-бокса: новый усилитель секреции интерлейкина-1бета». Разница в гибели клеток. 13 (11): 1938–49. Дои:10.1038 / sj.cdd.4401896. PMID  16575408. S2CID  8953820.
• Cheung BB, Bell J, Raif A и др. (2006). «Чувствительный к эстрогену белок B-бокса - новый регулятор ретиноидного сигнала». J. Biol. Chem. 281 (26): 18246–56. Дои:10.1074 / jbc.M600879200. PMID  16636064.