TRIP6 - TRIP6 - Wikipedia

TRIP6
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1X61, 2DLO
Идентификаторы
Псевдонимы	TRIP6, OIP-1, OIP1, TRIP-6, TRIP6i2, ZRP-1, рецептор рецептора тироидного гормона 6
Внешние идентификаторы	OMIM: 602933 MGI: 1343458 ГомолоГен: 37757 Генные карты: TRIP6
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7q22.1 Начинать 100,867,387 бп[1] Конец 100,873,454 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание киназы • GO: 0001948 связывание с белками • связывание рецептора интерлейкина-1 • связывание ионов металлов • связывание рецептора тироидного гормона • Связывание РНК Сотовый компонент • соединение клеток • клеточная мембрана • рецепторный комплекс интерлейкина-1 • цитоскелет • ядро клетки • очаговая адгезия • цитоплазма • цитозоль • стрессовое волокно Биологический процесс • узел фокальной адгезии • клеточная адгезия • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • положительное регулирование миграции клеток • положительная регуляция передачи сигналов NIK / NF-kappaB • преобразование сигнала Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	7205	22051
Ансамбль	ENSG00000087077	ENSMUSG00000023348
UniProt	Q15654	Q9Z1Y4
RefSeq (мРНК)	NM_003302	NM_011639
RefSeq (белок)	NP_003293	NP_035769
Расположение (UCSC)	Chr 7: 100,87 - 100,87 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок 6, взаимодействующий с рецепторами щитовидной железы это белок что у людей кодируется TRIP6 ген.^[4][5][6]

Функция

Этот ген является членом семейства зиксинов и кодирует белок с тремя цинк-связывающими доменами LIM. Этот белок локализуется в местах фокальной адгезии и вдоль актиновых стрессовых волокон. Рекрутирование этого белка на плазматическую мембрану происходит зависимым от лизофосфатидной кислоты (LPA) образом и регулирует вызванную LPA миграцию клеток. Описаны альтернативно сплайсированные варианты, которые кодируют разные изоформы белка; однако не все варианты полностью охарактеризованы.^[6]

Взаимодействия

TRIP6 был показан взаимодействовать с LPAR2,^[7] BCAR1^[7][8] и HOXA9.^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000087077 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Йи Дж., Беккерл М.С. (апрель 1998 г.). «Ген TRIP6 человека кодирует белок домена LIM и картируется на хромосоме 7q22, области, связанной с онкогенезом». Геномика. 49 (2): 314–6. Дои:10.1006 / geno.1998.5248. PMID  9598321.
5. Ли Дж. У., Чой Х. С., Гьюрис Дж., Брент Р., Мур Д. Д. (февраль 1995 г.). «Два класса белков, которые зависят от наличия или отсутствия тироидного гормона для взаимодействия с рецептором тироидного гормона». Молекулярная эндокринология. 9 (2): 243–54. Дои:10.1210 / me.9.2.243. PMID  7776974.
6. «Энтрез Ген: рецептор тироидного гормона TRIP6 6».
7. Сюй Дж., Лай Ю.Дж., Линь У.С., Линь FT (март 2004 г.). «TRIP6 усиливает индуцированную лизофосфатидной кислотой миграцию клеток за счет взаимодействия с рецептором лизофосфатидной кислоты 2». Журнал биологической химии. 279 (11): 10459–68. Дои:10.1074 / jbc.M311891200. ЧВК  3904432. PMID  14688263.
8. Йи Дж, Клокер С., Дженсен С.К., Бокхольт С., Хонда Х, Хираи Х, Беккерл М.С. (март 2002 г.). «Члены семейства Zyxin белков LIM взаимодействуют с членами семейства сигнальных преобразователей p130Cas». Журнал биологической химии. 277 (11): 9580–9. Дои:10.1074 / jbc.M106922200. PMID  11782456.
9. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Милштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.

дальнейшее чтение

• Уильямс Дж. М., Чен Г. К., Чжу Л., Rest RF (январь 1998 г.). «Использование дрожжевой двугибридной системы для идентификации белков эпителиальных клеток человека, которые связывают гонококковые белки Opa: внутриклеточные гонококки связывают пируваткиназу через свои белки Opa и требуют пирувата хозяина для роста». Молекулярная микробиология. 27 (1): 171–86. Дои:10.1046 / j.1365-2958.1998.00670.x. PMID  9466265. S2CID  36570024.
• Murthy KK, Clark K, Fortin Y, Shen SH, Banville D (июль 1999 г.). «ZRP-1, белок, связанный с зиксином, взаимодействует со вторым доменом PDZ цитозольного белка тирозинфосфатазы hPTP1E». Журнал биологической химии. 274 (29): 20679–87. Дои:10.1074 / jbc.274.29.20679. PMID  10400701.
• Чжао МК, Ван И, Мерфи К., Йи Дж, Беккерл М.К., Гилмор Т.Д. (2000). «Белок trip6, содержащий домен LIM, может действовать как коактиватор для фактора транскрипции v-Rel». Экспрессия гена. 8 (4): 207–17. ЧВК  6157364. PMID  10794523.
• Куппен Э., ван Хэм М., Вансинк Д.Г., де Леу А., Виринга Б., Хендрикс В. (апрель 2000 г.). «Связанный с зиксином белок TRIP6 взаимодействует с мотивами PDZ в адапторном белке RIL и протеине тирозинфосфатазе PTP-BL». Европейский журнал клеточной биологии. 79 (4): 283–93. Дои:10.1078 / S0171-9335 (04) 70031-X. PMID  10826496.
• Wilson MD, Riemer C, Martindale DW, Schnupf P, Boright AP, Cheung TL, Hardy DM, Schwartz S, Scherer SW, Tsui LC, Miller W., Koop BF (март 2001 г.). «Сравнительный анализ генно-плотной области ACHE / TFR2 на хромосоме 7q22 человека с ортологичной областью на хромосоме 5 мыши». Исследования нуклеиновых кислот. 29 (6): 1352–65. Дои:10.1093 / nar / 29.6.1352. ЧВК  29746. PMID  11239002.
• Ван И, Гилмор Т. Д. (апрель 2001 г.). «Белок LIM домена Trip6 имеет консервативный ядерный экспортный сигнал, ядерные нацеленные последовательности и несколько доменов трансактивации». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Исследование молекулярных клеток. 1538 (2–3): 260–72. Дои:10.1016 / S0167-4889 (01) 00077-5. PMID  11336797.
• Йи Дж, Клокер С., Дженсен С.К., Бокхольт С., Хонда Х, Хираи Х, Беккерл М.С. (март 2002 г.). «Члены семейства Zyxin белков LIM взаимодействуют с членами семейства сигнальных преобразователей p130Cas». Журнал биологической химии. 277 (11): 9580–9. Дои:10.1074 / jbc.M106922200. PMID  11782456.
• Зарский Х.А., Тарнаски Х.А., Ченг М., Ван дер Хорн Ф.А. (февраль 2003 г.). «Новый белок пальца кольца OIP1 связывается с консервативными аминокислотными повторами в белке кончика сперматозоида ODF1». Биология размножения. 68 (2): 543–52. Дои:10.1095 / биолрепрод.102.009076. ЧВК  3158802. PMID  12533418.
• Сюй Дж., Лай Ю.Дж., Линь У.С., Линь FT (март 2004 г.). «TRIP6 усиливает индуцированную лизофосфатидной кислотой миграцию клеток за счет взаимодействия с рецептором лизофосфатидовой кислоты 2». Журнал биологической химии. 279 (11): 10459–68. Дои:10.1074 / jbc.M311891200. ЧВК  3904432. PMID  14688263.
• Санс-Родригес Ф., Герреро-Эстео М., Ботелла Л. М., Банвиль Д., Вари С. П., Бернабеу С. (июль 2004 г.). «Эндоглин регулирует организацию цитоскелета посредством связывания с ZRP-1, членом семейства белков Lim». Журнал биологической химии. 279 (31): 32858–68. Дои:10.1074 / jbc.M400843200. PMID  15148318.
• Kassel O, Schneider S, Heilbock C, Litfin M, Göttlicher M, Herrlich P (октябрь 2004 г.). «Ядерная изоформа белка LIM-домена фокальной адгезии Trip6 интегрирует активирующие и репрессирующие сигналы на промоторах, регулируемых AP-1 и NF-kappaB». Гены и развитие. 18 (20): 2518–28. Дои:10.1101 / gad.322404. ЧВК  529539. PMID  15489293.
• Ли Л., Бинь Л. Х., Ли Ф, Лю И, Чен Д., Чжай З., Шу Х. Б. (февраль 2005 г.). «TRIP6 представляет собой связанный с RIP2 общий сигнальный компонент множественных путей активации NF-kappaB» (PDF). Журнал клеточной науки. 118 (Pt 3): 555–63. Дои:10.1242 / jcs.01641. PMID  15657077. S2CID  21632160.
• Пети М.М., Кромбез К.Р., Вервенн HB, Вейнс Н., Ван де Вен В.Дж. (сентябрь 2005 г.). «Супрессор опухолей Scrib избирательно взаимодействует со специфическими членами семейства белков зиксина». Письма FEBS. 579 (22): 5061–8. Дои:10.1016 / j.febslet.2005.08.012. PMID  16137684. S2CID  43629118.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q15654 (Белок 6, взаимодействующий с рецепторами щитовидной железы) на PDBe-KB.