TRMT12 - TRMT12

TRMT12
Идентификаторы
Псевдонимы	TRMT12, TRM12, TYW2, гомолог тРНК метилтрансферазы 12
Внешние идентификаторы	OMIM: 611244 MGI: 1915510 ГомолоГен: 32379 Генные карты: TRMT12
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8q24.13 Начинать 124,450,820 бп[1] Конец 124,462,150 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 | 15 D1 Начинать 58,872,674 бп[2] Конец 58,877,127 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • трансферазная активность • тРНК 4-деметилвиозин альфа-амино-альфа-карбоксипропилтрансферазная активность • активность тРНК метилтрансферазы Сотовый компонент • цитоплазма Биологический процесс • обработка тРНК • метилирование тРНК • биосинтетический процесс вибутозина Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	55039	68260
Ансамбль	ENSG00000183665	ENSMUSG00000037085
UniProt	Q53H54	Q8BG71
RefSeq (мРНК)	NM_017956	NM_026642
RefSeq (белок)	NP_060426	NP_080918
Расположение (UCSC)	Chr 8: 124.45 - 124.46 Мб	Chr 15: 58,87 - 58,88 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

тРНК гомолог белка 2, синтезирующего вибутозин это белок что у людей кодируется TRMT12 ген.^[5][6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000183665 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037085 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Калхор Х.Р., Пенджвини М., Кларк С. (июль 2005 г.). «Новая метилтрансфераза, необходимая для образования гипермодифицированного нуклеозида-вибутозина в эукариотической тРНК». Biochem Biophys Res Commun. 334 (2): 433–40. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.06.111. PMID  16005430.
6. Noma A, Suzuki T (декабрь 2006 г.). «Анализ рибонуклеома выявил гены ферментов, ответственные за синтез вибутозина». Нуклеиновые кислоты Symp Ser (Oxf). 50 (50): 65–6. Дои:10.1093 / nass / nrl032. PMID  17150819.
7. «Ген Entrez: гомолог TRMT12 тРНК метилтрансферазы 12 (S. cerevisiae)».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Сузуки Ю., Ямасита Р., Широта М. и др. (2004). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в промоторных областях». Genome Res. 14 (9): 1711–8. Дои:10.1101 / гр.2435604. ЧВК  515316. PMID  15342556.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Родригес В., Чен И., Элкахлун А. и др. (2007). «Сравнительный анализ геномной гибридизации и экспрессии на матрице ВАС хромосомы 8 позволяет выявить амплификацию и сверхэкспрессию TRMT12 при раке груди». Гены Хромосомы Рак. 46 (7): 694–707. Дои:10.1002 / gcc.20454. PMID  17440925. S2CID  36237771.