TSC22D3 - TSC22D3

TSC22D3
Идентификаторы
Псевдонимы	TSC22D3, DIP, DSIPI, GILZ, TSC-22R, hDIP, член семейства доменов TSC22 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 300506 MGI: 1196284 ГомолоГен: 104035 Генные карты: TSC22D3
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xq22.3 Начните 107,713,221 бп[1] Конец 107,777,342 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа Х | Х F1 Начните 140,539,528 бп[2] Конец 140,600,659 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Привязка MRF • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • цитозоль • цитоплазма • ядро клетки Биологический процесс • реакция на осмотический стресс • трансмембранный перенос ионов • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • отрицательная регуляция развития ткани скелетных мышц • отрицательная регуляция индуцированной активацией гибели Т-клеток • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	1831	14605
Ансамбль	ENSG00000157514	ENSMUSG00000031431
UniProt	Q99576	Q9Z2S7
RefSeq (мРНК)	NM_001015881 NM_004089 NM_198057 NM_001318468 NM_001318470	NM_001077364 NM_010286
RefSeq (белок)	NP_001015881 NP_001305397 NP_001305399 NP_004080 NP_932174	NP_001070832 NP_034416
Расположение (UCSC)	Chr X: 107.71 - 107.78 Мб	Chr X: 140,54 - 140,6 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок 3 семейства доменов TSC22 это белок что у людей кодируется TSC22D3 ген.^[5][6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, имеет значительную идентичность последовательности с мышиным TSC-22 и shs Drosophila, оба из которых являются белками лейциновой молнии, которые функционируют как регуляторы транскрипции. GILZ демонстрирует повсеместную экспрессию в тканях, включая тимус, селезенку, легкие, жир, печень, почки, сердце и скелетные мышцы.^[7][8] Экспрессия этого гена стимулируется глюкокортикоидами и интерлейкином 10, и, по-видимому, он играет ключевую роль в противовоспалительном и иммунодепрессивном эффектах этого стероида и хемокина. Для этого гена были идентифицированы варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы.^[6]

Взаимодействия

TSC22D3 показал взаимодействовать с участием C-Raf,^[9] NFKB2^[10] и NFKB1.^[10]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000157514 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031431 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Фогель П., Мэгерт Х. Дж., Чеслак А., Адерманн К., Forssmann WG (декабрь 1996 г.). «hDIP - потенциальный регулятор транскрипции, связанный с мышиным TSC-22 и близорукой дрозофилой (shs) - экспрессируется в большом количестве тканей человека». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1309 (3): 200–4. Дои:10.1016 / s0167-4781 (96) 00177-7. PMID  8982256.
6. "Ген Entrez: TSC22D3 Доменное семейство TSC22, член 3".
7. Ayyar, Vivaswath S .; Алмон, Ричард Р .; Юско, Уильям Дж .; Дюбуа, Дебра К. (01.06.2015). «Количественная тканеспецифическая динамика экспрессии мРНК GILZ in vivo и регуляции эндогенными и экзогенными глюкокортикоидами». Физиологические отчеты. 3 (6): e12382. Дои:10.14814 / phy2.12382. ЧВК  4510616. PMID  26056061.
8. Cannarile, L .; Золло, О .; D'Adamio, F .; Ayroldi, E .; Marchetti, C .; Табилио, А .; Bruscoli, S .; Риккарди, К. (01.02.2001). «Клонирование, хромосомное распределение и тканевое распределение человеческого GILZ, гена, индуцированного глюкокортикоидным гормоном». Гибель клеток и дифференциация. 8 (2): 201–203. Дои:10.1038 / sj.cdd.4400798. ISSN  1350-9047. PMID  11313722.
9. Ayroldi E, Zollo O, Macchiarulo A, Di Marco B, Marchetti C, Riccardi C (ноябрь 2002 г.). «Индуцированная глюкокортикоидами лейциновая молния ингибирует путь киназы, регулируемый внеклеточными сигналами Raf, путем связывания с Raf-1». Молекулярная и клеточная биология. 22 (22): 7929–41. Дои:10.1128 / MCB.22.22.7929-7941.2002. ЧВК  134721. PMID  12391160.
10. Ayroldi E, Migliorati G, Bruscoli S, Marchetti C, Zollo O, Cannarile L, D'Adamio F, Riccardi C (август 2001 г.). «Модуляция активации Т-клеток с помощью глюкокортикоид-индуцированного фактора лейциновой молнии посредством ингибирования ядерного фактора каппаВ». Кровь. 98 (3): 743–53. Дои:10.1182 / кровь.V98.3.743. PMID  11468175.

дальнейшее чтение

• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Ю.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (апрель 1996 г.). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Аналитическая биохимия. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С., Музни Д. М., Дин Й., Лю В., Рикафренте Д. Ю., Вентланд М. А., Леннон Г., Гиббс Р. А. (апрель 1997 г.). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Геномные исследования. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (март 2001 г.). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геномные исследования. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Каннариль Л., Золло О, Д'Адамио Ф., Эрольди Э., Маркетти С., Табилио А., Брусколи С., Риккарди С. (февраль 2001 г.). «Клонирование, хромосомное распределение и тканевое распределение человеческого GILZ, гена, индуцированного глюкокортикоидным гормоном». Гибель клеток и дифференциация. 8 (2): 201–3. Дои:10.1038 / sj.cdd.4400798. PMID  11313722.
• Mittelstadt PR, Ashwell JD (август 2001 г.). «Ингибирование AP-1 глюкокортикоид-индуцибельным белком GILZ». Журнал биологической химии. 276 (31): 29603–10. Дои:10.1074 / jbc.M101522200. PMID  11397794.
• Ayroldi E, Migliorati G, Bruscoli S, Marchetti C, Zollo O, Cannarile L, D'Adamio F, Riccardi C (август 2001 г.). «Модуляция активации Т-клеток с помощью глюкокортикоид-индуцированного фактора лейциновой молнии посредством ингибирования ядерного фактора каппаВ». Кровь. 98 (3): 743–53. Дои:10.1182 / кровь.V98.3.743. PMID  11468175.
• Ayroldi E, Zollo O, Macchiarulo A, Di Marco B, Marchetti C, Riccardi C (ноябрь 2002 г.). «Индуцированная глюкокортикоидами лейциновая молния ингибирует путь киназы, регулируемый внеклеточными сигналами Raf, путем связывания с Raf-1». Молекулярная и клеточная биология. 22 (22): 7929–41. Дои:10.1128 / MCB.22.22.7929-7941.2002. ЧВК  134721. PMID  12391160.
• Берреби Д., Брусколи С., Коэн Н., Фусса А., Миглиорати Дж., Буше-Дельбос Л., Майо М.К., Портье А., Кудерк Дж., Галано П., Пушмор М., Риккарди С., Эмили Д. (январь 2003 г.). «Синтез индуцированной глюкокортикоидами лейциновой молнии (GILZ) макрофагами: противовоспалительный и иммунодепрессивный механизм, общий для глюкокортикоидов и IL-10». Кровь. 101 (2): 729–38. Дои:10.1182 / кровь-2002-02-0538. PMID  12393603.
• Ши X, Ши В., Ли Кью, Сон Би, Ван М., Бай С., Цао Икс (апрель 2003 г.). «Вызванный глюкокортикоидами белок лейциновой молнии, GILZ, ингибирует адипогенез мезенхимальных клеток». EMBO отчеты. 4 (4): 374–80. Дои:10.1038 / sj.embor.embor805. ЧВК  1319161. PMID  12671681.
• Asselin-Labat ML, David M, Biola-Vidamment A, Lecoeuche D, Zennaro MC, Bertoglio J, Pallardy M (июль 2004 г.). «GILZ, новая мишень для фактора транскрипции FoxO3, защищает Т-лимфоциты от апоптоза, вызванного отменой интерлейкина-2». Кровь. 104 (1): 215–23. Дои:10.1182 / кровь-2003-12-4295. PMID  15031210.
• Asselin-Labat ML, Biola-Vidamment A, Kerbrat S, Lombès M, Bertoglio J, Pallardy M (июль 2005 г.). «FoxO3 опосредует антагонистические эффекты глюкокортикоидов и интерлейкина-2 на индуцированную глюкокортикоидами экспрессию лейциновой молнии». Молекулярная эндокринология. 19 (7): 1752–64. Дои:10.1210 / me.2004-0206. PMID  15705665.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
• Саундарараджан Р., Чжан Т.Т., Ван Дж., Вандевалле А., Пирс Д. (декабрь 2005 г.). «Новая роль белка лейциновой молнии, индуцированного глюкокортикоидами, в транспорте натрия, опосредованном эпителиальными натриевыми каналами». Журнал биологической химии. 280 (48): 39970–81. Дои:10.1074 / jbc.M508658200. PMID  16216878.
• Hamdi H, Godot V, Maillot MC, Prejean MV, Cohen N, Krzysiek R, Lemoine FM, Zou W, Emilie D (июль 2007 г.). «Индукция антиген-специфических регуляторных Т-лимфоцитов дендритными клетками человека, экспрессирующими индуцированную глюкокортикоидами лейциновую молнию». Кровь. 110 (1): 211–9. Дои:10.1182 / кровь-2006-10-052506. ЧВК  2077304. PMID  17356131.