TSEN15 - TSEN15

TSEN15
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2GW6
Идентификаторы
Псевдонимы	TSEN15, C1orf19, sen15, субъединица 15 эндонуклеазы сплайсинга тРНК, PCH2F
Внешние идентификаторы	OMIM: 608756 MGI: 1913887 ГомолоГен: 12002 Генные карты: TSEN15
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q25.3 Начинать 184,051,651 бп[1] Конец 184,123,978 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 | 1 G2 Начинать 152,370,735 бп[2] Конец 152,386,688 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • тРНК-интрон эндонуклеазная активность • связывание нуклеиновой кислоты • нуклеазная активность Сотовый компонент • ядрышко • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • обработка мРНК • Гидролиз фосфодиэфирной связи РНК • Гидролиз фосфодиэфирной связи РНК, эндонуклеолитический • обработка тРНК • Сплайсинг тРНК посредством эндонуклеолитического расщепления и лигирования • гидролиз фосфодиэфирной связи нуклеиновой кислоты Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	116461	66637
Ансамбль	ENSG00000198860	ENSMUSG00000014980
UniProt	Q8WW01	Q8R3W5
RefSeq (мРНК)	NM_001127394 NM_001300764 NM_001300766 NM_052965 NM_001363643	NM_025677
RefSeq (белок)	NP_001120866 NP_001287693 NP_001287695 NP_443197 NP_001350572	NP_079953
Расположение (UCSC)	Chr 1: 184.05 - 184.12 Мб	Chr 1: 152.37 - 152.39 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

субъединица эндонуклеазы тРНК Sen15 является фермент что у людей кодируется TSEN15 ген.^[5][6][7]

Сплайсинг тРНК - фундаментальный процесс роста и деления клеток. SEN15 является субъединицей эндонуклеазы сплайсинга тРНК, которая катализирует удаление интроны, первый шаг в сплайсинге тРНК (Паушкин и др., 2004) [предоставлено OMIM]^[7]

Взаимодействия

C1orf19 был показан взаимодействовать с TSEN2.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000198860 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000014980 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Суд Р., Боннер Т.И., Макаловска И., Стефан Д.А., Роббинс К.М., Коннорс Т.Д. и др. (Апрель 2001 г.). «Клонирование и характеристика 13 новых транскриптов и гена RGS8 человека из области 1q25, охватывающей локус наследственного рака простаты (HPC1)». Геномика. 73 (2): 211–22. Дои:10.1006 / geno.2001.6500. PMID  11318611.
6. Песня J, Маркли JL (февраль 2007 г.). «Трехмерная структура, определенная для субъединицы эндонуклеазы сплайсинга тРНК человека (Sen15), обнаруживает новую димерную складку». Журнал молекулярной биологии. 366 (1): 155–64. Дои:10.1016 / j.jmb.2006.11.024. ЧВК  1865571. PMID  17166513.
7. «Ген Энтреса: открытая рамка считывания 19 хромосомы C1orf19 19».
8. Паушкин С.В., Патель М., Фурия Б.С., Пельц С.В., Тротта CR (апрель 2004 г.). «Идентификация комплекса эндонуклеаз человека выявляет связь между сплайсингом тРНК и образованием 3'-конца пре-мРНК». Клетка. 117 (3): 311–21. Дои:10.1016 / S0092-8674 (04) 00342-3. PMID  15109492.

дальнейшее чтение

• Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A и др. (Июль 2004 г.). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Геномные исследования. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК  442148. PMID  15231748.
• Ленер Б., Сандерсон К.М. (июль 2004 г.). «Структура взаимодействия белков для деградации мРНК человека». Геномные исследования. 14 (7): 1315–23. Дои:10.1101 / gr.2122004. ЧВК  442147. PMID  15231747.
• Паушкин С.В., Патель М., Фурия Б.С., Пельц С.В., Тротта CR (апрель 2004 г.). «Идентификация комплекса эндонуклеаз человека выявляет связь между сплайсингом тРНК и образованием 3'-конца пре-мРНК». Клетка. 117 (3): 311–21. Дои:10.1016 / S0092-8674 (04) 00342-3. PMID  15109492.