TSFM - TSFM

TSFM
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2CP9
Идентификаторы
Псевдонимы	TSFM, EFTS, EFTSMT, фактор элонгации трансляции Ts, митохондриальные
Внешние идентификаторы	OMIM: 604723 MGI: 1913649 ГомолоГен: 4184 Генные карты: TSFM
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q14.1 Начинать 57,782,761 бп[1] Конец 57,808,071 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 | 10 D3 Начинать 127,011,572 бп[2] Конец 127,030,840 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность фактора удлинения трансляции • Связывание РНК • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • митохондриальный матрикс • внутриклеточный • митохондрия • ядро клетки Биологический процесс • поступательное удлинение • регуляция ДНК-шаблонной транскрипции, элонгации • биосинтез белка • трансляционное удлинение митохондрий • регуляция митохондриальной трансляции Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10102	66399
Ансамбль	ENSG00000123297	ENSMUSG00000040521
UniProt	P43897	Q9CZR8
RefSeq (мРНК)	NM_005726 NM_001172695 NM_001172696 NM_001172697	NM_025537
RefSeq (белок)	NP_001166166 NP_001166167 NP_001166168 NP_005717	NP_079813
Расположение (UCSC)	Chr 12: 57,78 - 57,81 Мб	Chr 10: 127.01 - 127.03 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор удлинения Ts, митохондриальный это белок что у людей кодируется TSFM ген. Это ЭФ-Ц гомолог.^[5][6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000123297 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040521 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Xin H, Woriax V, Burkhart W, Spremulli LL (август 1995 г.). «Клонирование и экспрессия митохондриального фактора трансляционного удлинения Ts из бычьей и человеческой печени». J Biol Chem. 270 (29): 17243–9. Дои:10.1074 / jbc.270.29.17243. PMID  7615523.
6. «Ген Entrez: фактор удлинения трансляции TSFM Ts, митохондриальный».

дальнейшее чтение

• Смейтинк Я.А., Эльпелег О., Антоницка Х. и др. (2006). «Отчетливые клинические фенотипы, связанные с мутацией фактора элонгации митохондриальной трансляции EFT». Являюсь. J. Hum. Genet. 79 (5): 869–77. Дои:10.1086/508434. ЧВК  1698578. PMID  17033963.
• Антоника Х., Сасарман Ф., Кеннауэй Н.Г., Шубридж Е.А. (2006). «Молекулярная основа тканевой специфичности дефицита окислительного фосфорилирования у пациентов с мутациями в митохондриальном факторе трансляции EFG1». Гм. Мол. Genet. 15 (11): 1835–46. Дои:10,1093 / hmg / ddl106. PMID  16632485.
• Максимов В.В., Арман И.П., Тарантул В.З. (2006). «[Идентификация белков, взаимодействующих с нейропротективным пептидом гуманином в дрожжевой двугибридной системе]». Генетика. 42 (2): 274–7. PMID  16583711.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Вернон Дж. Л., Берр П. К., Вили Дж. Э., Фарвелл Массачусетс (2000). «Отнесение гена фактора элонгации трансляции митохондрий (TSFM) к полосам q13 → q14 хромосомы 12 человека путем гибридизации in situ и с гибридами соматических клеток». Cytogenet. Cell Genet. 89 (3–4): 145–6. Дои:10.1159/000015596. PMID  10965106. S2CID  201991811.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Бенковски Л.А., Такемото С., Отт Г. и др. (1996). «Взаимодействие факторов элонгации митохондрий Tu.Ts с аминоацил-тРНК». Nucleic Acids Symp. Сер. (33): 163–6. PMID  8643359.

внешняя ссылка

• TSFM расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• TSFM детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.