ТСГ-6 - TSG-6

TNFAIP6
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1O7B, 1O7C, 2ПФ5, 2WNO, 2N40
Идентификаторы
Псевдонимы	TNFAIP6, TSG-6, TSG6, TNF-альфа-индуцированный белок 6
Внешние идентификаторы	OMIM: 600410 MGI: 1195266 ГомолоГен: 5162 Генные карты: TNFAIP6
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q23.3 Начинать 151,357,592 бп[1] Конец 151,380,046 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 C1.1 Начинать 52,038,009 бп[2] Конец 52,056,686 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание гиалуроновой кислоты • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • внеклеточная область • внеклеточный • просвет третичной гранулы • Просвет гранул, богатых фиколином-1 Биологический процесс • передача сигналов от клетки к клетке • клеточная адгезия • воспалительная реакция • отрицательная регуляция воспалительного ответа • преобразование сигнала • положительное регулирование миграции клеток • овуляция • дегрануляция нейтрофилов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	7130	21930
Ансамбль	ENSG00000123610	ENSMUSG00000053475
UniProt	P98066	O08859
RefSeq (мРНК)	NM_007115	NM_009398
RefSeq (белок)	NP_009046	NP_033424
Расположение (UCSC)	Chr 2: 151.36 - 151.38 Мб	Chr 2: 52.04 - 52.06 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок гена 6, индуцируемый фактором некроза опухоли также известен как TNF-стимулированный белок гена 6 или же ТСГ-6 это белок^[5] что у людей кодируется TNFAIP6 (фактор некроза опухоли, альфа-индуцированный белок 6) ген.^[6][7]

Структура и функции

ТСГ-6 - 30 кДа секретируемый белок, содержащий гиалуронан -связывающий домен LINK a и, таким образом, является членом семейства гиалуронансвязывающих белков, также называемых гиладгерины. Гиалуронансвязывающий домен, как известно, участвует в внеклеточный матрикс стабильность и миграция клеток. Было показано, что этот белок образует стабильный, ковалентный комплекс с интер-альфа-ингибитором (IαI ), тем самым увеличивая сериновая протеаза ингибирующая активность IαI, которая важна в протеазной сети, связанной с воспалением. Экспрессия этого гена может быть индуцирована рядом сигнальных молекул, главным образом фактором некроза опухоли α (TNF-α ) и интерлейкин-1 (Ил-1 ). Экспрессия также может быть вызвана механическими стимулами в клетках гладких мышц сосудов и, как было установлено, коррелирует с протеогликан синтез и агрегация.^[7] Было показано, что TSG-6 модулирует пластичность макрофагов и сигнализирует о переходе LPS-обработанных макрофагов от про- к противовоспалительного фенотипа.^[8]

TSG-6 также взаимодействует с рядом молекул, связанных с матрицей, таких как Аггрекан, Versican, тромбоспондин (1&2), пентраксин-3 и фибронектин.

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000123610 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000053475 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ли TH, Вишневски HG, Вилчек Дж. (Январь 1992 г.). «Новый секреторный белок, индуцируемый фактором некроза опухоли (TSG-6), является членом семейства гиалуронатсвязывающих белков, тесно связанных с рецептором адгезии CD44». Журнал клеточной биологии. 116 (2): 545–57. Дои:10.1083 / jcb.116.2.545. ЧВК  2289279. PMID  1730767.
6. Ли TH, Клампфер Л., Показывает ТБ, Вилчек Дж. (Март 1993 г.). «Регуляция транскрипции TSG6, гена первичного ответа, индуцируемого фактором некроза опухоли и интерлейкином-1, кодирующего секретируемый гиалуронансвязывающий белок». Журнал биологической химии. 268 (9): 6154–60. PMID  8454591.
7. «Ген Entrez: фактор некроза опухоли TNFAIP6, альфа-индуцированный белок 6».
8. Mittal M, Tiruppathi C, Nepal S, Zhao YY, Grzych D, Soni D, Prockop DJ, Malik AB (декабрь 2016 г.). «TNFα-стимулированный ген-6 (TSG6) активирует изменение фенотипа макрофагов для предотвращения воспалительного поражения легких». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 113 (50): E8151 – E8158. Дои:10.1073 / pnas.1614935113. ЧВК  5167170. PMID  27911817.

дальнейшее чтение

• Милнер К.М., Дэй А.Дж. (май 2003 г.). «TSG-6: многофункциональный белок, связанный с воспалением». Журнал клеточной науки. 116 (Pt 10): 1863–73. Дои:10.1242 / jcs.00407. PMID  12692188.
• Fries E, Kaczmarczyk A (2004). «Интер-альфа-ингибитор, гиалуронан и воспаление» (PDF). Acta Biochimica Polonica. 50 (3): 735–42. Дои:10.18388 / abp.2003_3664. PMID  14515153.
• Милнер С.М., Хигман В.А., Дэй А.Дж. (июнь 2006 г.). «TSG-6: плюрипотентный медиатор воспаления?». Сделки Биохимического Общества. 34 (Pt 3): 446–50. Дои:10.1042 / BST0340446. PMID  16709183.
• Вишневски Х.Г., Берджесс У.Х., Оппенгейм Д.Д., Вилчек Дж. (Июнь 1994 г.). «TSG-6, гиалуронановый связывающий белок, связанный с артритом, образует стабильный комплекс с интер-альфа-ингибитором сывороточного белка». Биохимия. 33 (23): 7423–9. Дои:10.1021 / bi00189a049. PMID  7516184.
• Клампфер Л., Ли Т.Х., Хсу В., Вилчек Дж., Чен-Кианг С. (октябрь 1994 г.). «NF-IL6 и AP-1 совместно модулируют активацию гена TSG-6 альфа-фактором некроза опухоли и интерлейкином-1». Молекулярная и клеточная биология. 14 (10): 6561–9. Дои:10.1128 / MCB.14.10.6561. ЧВК  359186. PMID  7935377.
• Вишневски Х.Г., Хуа Дж.С., Попперс Д.М., Наиме Д., Вилчек Дж., Кронштейн Б.Н. (февраль 1996 г.). «TNF / IL-1-индуцируемый белок TSG-6 потенцирует ингибирование плазмина интер-альфа-ингибитором и оказывает сильное противовоспалительное действие in vivo». Журнал иммунологии. 156 (4): 1609–15. PMID  8568267.
• Kohda D, Morton CJ, Parkar AA, Hatanaka H, ​​Inagaki FM, Campbell ID, Day AJ (сентябрь 1996 г.). «Структура раствора связующего модуля: гиалуронановый связывающий домен, участвующий в стабильности внеклеточного матрикса и миграции клеток». Клетка. 86 (5): 767–75. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80151-8. PMID  8797823. S2CID  16347386.
• Parkar AA, Kahmann JD, Howat SL, Bayliss MT, Day AJ (май 1998 г.). «TSG-6 взаимодействует с гиалуронаном и аггреканом в зависимости от pH через общий функциональный элемент: влияние на его регуляцию в воспаленном хряще». Письма FEBS. 428 (3): 171–6. Дои:10.1016 / S0014-5793 (98) 00523-7. PMID  9654129. S2CID  30827372.
• Ли Р.Т., Ямамото К., Фен Й, Поттер-Периго С., Бриггс У.Х., Ландшульц К.Т., Тури Т.Г., Томпсон Дж.Ф., Либби П., Уайт Т.Н. (апрель 2001 г.). «Механическое напряжение вызывает специфические изменения в синтезе и организации протеогликанов гладкомышечными клетками сосудов». Журнал биологической химии. 276 (17): 13847–51. Дои:10.1074 / jbc.M010556200. PMID  11278699.
• Nentwich HA, Mustafa Z, Rugg MS, Marsden BD, Cordell MR, Mahoney DJ, Jenkins SC, Dowling B, Fries E, Milner CM, Loughlin J, Day AJ (май 2002 г.). «Новый аллельный вариант гена TSG-6 человека, кодирующий аминокислотное различие в модуле CUB. Хромосомная локализация, частотный анализ, моделирование и экспрессия». Журнал биологической химии. 277 (18): 15354–62. Дои:10.1074 / jbc.M110765200. PMID  11854277.
• Получение SJ, Mahoney DJ, Cao T, Rugg MS, Fries E, Milner CM, Perretti M, Day AJ (декабрь 2002 г.). «Связующий модуль из человеческого TSG-6 ингибирует миграцию нейтрофилов независимым от гиалуронана и интер-альфа-ингибиторов образом». Журнал биологической химии. 277 (52): 51068–76. Дои:10.1074 / jbc.M205121200. PMID  12401803.
• Андерсон Н.Л., Полански М., Пипер Р., Гатлин Т., Тирумалай Р.С., Конрадс Т.П., Винстра Т.Д., Адкинс Дж. Н., Паундс Дж. Г., Фаган Р., Лобли А. (апрель 2004 г.). «Протеом плазмы человека: неизбыточный список, составленный из четырех отдельных источников». Молекулярная и клеточная протеомика. 3 (4): 311–26. Дои:10.1074 / mcp.M300127-MCP200. PMID  14718574.
• Санггаард К.В., Карринг Х., Вальникова З., Тёгерсен И.Б., Энгильд Дж.Дж. (март 2005 г.). «Взаимодействие TSG-6 и I альфа I способствует переэтерификации, расщепляя перекрестную связь белок-гликозаминогликан-белок (PGP)». Журнал биологической химии. 280 (12): 11936–42. Дои:10.1074 / jbc.M409016200. PMID  15653696.
• Blundell CD, Almond A, Mahoney DJ, DeAngelis PL, Campbell ID, Day AJ (май 2005 г.). «На пути к структуре гиалуронанового комплекса TSG-6 с помощью моделирования и ЯМР-спектроскопии: понимание других членов суперсемейства связующих модулей». Журнал биологической химии. 280 (18): 18189–201. Дои:10.1074 / jbc.M414343200. PMID  15718240.
• Миндреску К., Ле Дж., Вишневски Х. Г., Вилчек Дж. (Май 2005 г.). «Повышение экспрессии циклооксигеназы-2 с помощью белка TSG-6 в клеточной линии макрофагов». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 330 (3): 737–45. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.03.040. PMID  15809059.