TUB (ген) - TUB (gene)

ВАННА
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1С31
Идентификаторы
Псевдонимы	ВАННА, rd5, RDOB, двудольный фактор транскрипции, фактор двудольной транскрипции TUB
Внешние идентификаторы	OMIM: 601197 MGI: 2651573 ГомолоГен: 31147 Генные карты: ВАННА
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11п15.4 Начинать 8,019,244 бп[1] Конец 8,106,112 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 E3 | 7 57,21 см Начинать 108,950,338 бп[2] Конец 109,034,460 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание фосфатидилинозита • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса • Связывание с рецептором, сопряженным с G-белком • внутрицилиндровый транспортная частица A связывание Сотовый компонент • цитоплазма • внеклеточная область • цитозоль • клеточная мембрана • ресничка • мембрана • ядро клетки Биологический процесс • фагоцитоз, распознавание • локализация рецептора в неподвижной ресничке • ответ на гормон • положительная регуляция фагоцитоза • поддержание фоторецепторных клеток • чувственное восприятие звука • развитие сетчатки глаза камерного типа • локализация белка во внешнем сегменте фоторецептора • ответ на стимул • фагоцитоз • локализация белка в ресничке • регуляция сигнального пути белка рецептора, связанного с G-белком • внутрибровный транспорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	7275	22141
Ансамбль	ENSG00000166402	ENSMUSG00000031028
UniProt	P50607	P50586
RefSeq (мРНК)	NM_003320 NM_177972	NM_021885
RefSeq (белок)	NP_003311 NP_813977	NP_068685
Расположение (UCSC)	Chr 11: 8.02 - 8.11 Мб	Chr 7: 108.95 - 109.03 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Табби-гомолог белка это белок что у людей кодируется ВАННА ген.^[5][6]

Этот ген кодирует члена семейства двудольных транскрипционных факторов Табби. Кодируемый белок может играть роль в ожирении и нейросенсорной деградации. Кристаллическая структура подобного белка была определена у мышей, и он функционирует как мембраносвязанный регулятор транскрипции, который перемещается в ядро ​​в ответ на гидролиз фосфоинозитидов. Для этого гена были идентифицированы два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.^[6]

Взаимодействия

TUB (ген) показал взаимодействовать с PLCG1.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000166402 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031028 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Kleyn PW, Fan W, Kovats SG, Lee JJ, Pulido JC, Wu Y, Berkemeier LR, Misumi DJ, Holmgren L, Charlat O, Woolf EA, Tayber O, Brody T., Shu P, Hawkins F, Kennedy B, Baldini L , Эбелинг К., Альперин Г.Д., Дидс Дж., Лейки Н.Д., Калпеппер Дж., Чен Х., Глюксманн-Куис М.А., Карлсон Г.А., Дуйк Г.М., Мур К.Дж. (июнь 1996 г.). «Идентификация и характеристика тубби гена ожирения мыши: член нового семейства генов». Клетка. 85 (2): 281–90. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81104-6. PMID  8612280. S2CID  15670925.
6. "Entrez Gene: TUB tubby гомолог (мышь)".
7. Капеллер, Р; Мориарти А; Штраус А; Stubdal H; Theriault K; Зиберт Э; Чикеринг Т; Моргенштерн Дж. П.; Tartaglia L A; Лилли Дж (август 1999 г.). «Фосфорилирование тирозина в tub и его ассоциация с белками, содержащими домен Src гомологии 2, вовлекают tub во внутриклеточную передачу сигналов инсулином». J. Biol. Chem. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 274 (35): 24980–6. Дои:10.1074 / jbc.274.35.24980. ISSN  0021-9258. PMID  10455176.

дальнейшее чтение

• Икеда А., Нишина П.М., Наггерт Дж. К. (2002). «Трубчатые белки, семейство, играющее роль в развитии и функционировании нейронов». J. Cell Sci. 115 (Pt 1): 9–14. PMID  11801719.
• Джонс Дж. М., Мейслер М. Х., Селдин М. Ф. и др. (1992). «Локализация инсулина-2 (Ins-2) и мутанта по ожирению tubby (tub) в различных областях хромосомы 7 мыши». Геномика. 14 (1): 197–9. Дои:10.1016 / S0888-7543 (05) 80308-8. HDL:2027.42/29864. PMID  1358794.
• North MA, Naggert JK, Yan Y, et al. (1997). «Молекулярная характеристика TUB, TULP1 и TULP2, членов нового семейства генов tubby и их возможное отношение к глазным заболеваниям». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (7): 3128–33. Bibcode:1997ПНАС ... 94.3128Н. Дои:10.1073 / пнас.94.7.3128. ЧВК  20333. PMID  9096357.
• Капеллер Р., Мориарти А., Штраус А. и др. (1999). «Фосфорилирование тирозина в tub и его ассоциация с белками, содержащими домен Src гомологии 2, вовлекают tub во внутриклеточную передачу сигналов инсулином». J. Biol. Chem. 274 (35): 24980–6. Дои:10.1074 / jbc.274.35.24980. PMID  10455176.
• Боггон Т.Дж., Шан В.С., Сантагата С. и др. (1999). «Влияние белков табби как факторов транскрипции с помощью функционального анализа на основе структуры». Наука. 286 (5447): 2119–25. Дои:10.1126 / science.286.5447.2119. PMID  10591637. S2CID  33506220.
• He W., Ikeda S, Bronson RT и др. (2001). «Экспрессия с GFP-меткой и иммуногистохимические исследования для определения субклеточной локализации членов семейства генов tubby». Brain Res. Мол. Brain Res. 81 (1–2): 109–17. Дои:10.1016 / S0169-328X (00) 00164-9. PMID  11000483.
• Сантагата С., Боггон Т.Дж., Бэрд С.Л. и др. (2001). «Передача сигналов G-белка через белки трубочки». Наука. 292 (5524): 2041–50. Дои:10.1126 / science.1061233. PMID  11375483. S2CID  29856557.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Шири-Свердлов Р., Кастерс А., ван Влит-Остапчук СП и др. (2006). «Идентификация TUB как нового гена-кандидата, влияющего на массу тела человека». Сахарный диабет. 55 (2): 385–9. Дои:10.2337 / диабет.55.02.06.db05-0997. PMID  16443771.
• Джанначчини Г., Джусти Л., Сантини Ф. и др. (2007). «Толстый белок в лимфоцитах человека от людей с нормальным весом и ожирения». Clin. Биохим. 40 (11): 806–9. Дои:10.1016 / j.clinbiochem.2007.03.020. PMID  17498679.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P50607 (Гомолог белка Табби человека) на PDBe-KB.
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P50586 (Белок Mouse Tubby) на PDBe-KB.