Фактор трилистника 1 - Trefoil factor 1

TFF1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1HI7, 1PS2
Идентификаторы
Псевдонимы	TFF1, BCEI, D21S21, HP1.A, HPS2, pNR-2, pS2, фактор трилистника 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 113710 MGI: 88135 ГомолоГен: 2426 Генные карты: TFF1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 21 (человека)[1] Группа 21q22.3 Начните 42,362,282 бп[1] Конец 42,366,535 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 A3.3 | 17 15,8 см Начните 31,161,395 бп[2] Конец 31,165,277 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность фактора роста • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • внеклеточный • внеклеточная область Биологический процесс • реакция на иммобилизационный стресс • дифференциация клеток • ответ на пептидный гормон • поддержание желудочно-кишечного эпителия • отрицательное регулирование пролиферации клеток • ответ на ион железа • лечение раны • углеводный обмен • регуляция рецепторной активности • пищеварение • преобразование сигнала Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	7031	21784
Ансамбль	ENSG00000160182	ENSMUSG00000024032
UniProt	P04155	Q08423
RefSeq (мРНК)	NM_003225	NM_009362
RefSeq (белок)	NP_003216	NP_033388
Расположение (UCSC)	Chr 21: 42.36 - 42.37 Мб	Chr 17: 31.16 - 31.17 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор трилистника 1 это белок что у людей кодируется TFF1 ген^[5][6] (также называется pS2 ген^[7]).

Функция

Члены семейства трилистников характеризуются наличием по крайней мере одной копии мотив трилистника, 40-аминокислотный домен, содержащий три консервативных дисульфиды. Это стабильные секреторные белки, экспрессируемые в желудочно-кишечный слизистая оболочка. Их функции не определены, но они могут защищать слизистую оболочку от повреждений, стабилизировать слой слизи и влиять на заживление эпителия. Этот ген, который экспрессируется в слизистой оболочке желудка, также изучался из-за его экспрессии в опухолях человека. Этот ген и два других родственных гена члена семейства трилистников обнаружены в кластере на хромосоме 21.^[6]

Связывание гликанов

Все три фактора трилистника человека лектины которые специфически взаимодействуют с дисахаридом GlcNAc-α-1,4-Gal.^[8] Этот дисахарид представляет собой необычный гликотоп, который, как известно, существует только на больших, сильно гликозилированных, муцины в слизистой оболочке. Путем сшивки муцины за счет двухвалентного связывания этого гликотопа факторы трилистника затем могут обратимо изменять толщину и вязкость слизи.^[8]

При раке желудка

Выражение TFF1 часто теряется в рак желудка, вероятно, за счет механизма метилирования ДНК, и поэтому он считается геном-супрессором опухоли.^[9]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000160182 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024032 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Gött P, Beck S, Machado JC, Carneiro F, Schmitt H, Blin N (май 1997 г.). «Пептиды трилистника человека: геномная структура в 21q22.3 и скоординированная экспрессия». Eur J Hum Genet. 4 (6): 308–15. Дои:10.1159/000472224. PMID  9043862. S2CID  25235589.
6. "Entrez Gene: TFF1 фактор трилистника 1".
7. Chatagnon A, Ballestar E, Esteller M, Dante R (2010). «Роль белка 2 связывания метил-CpG в модуляции эстрогенового ответа гена pS2 / TFF1». PLOS ONE. 5 (3): e9665. Bibcode:2010PLoSO ... 5.9665C. Дои:10.1371 / journal.pone.0009665. ЧВК  2837351. PMID  20300195.
8. Ярва М.А., Лингфорд Дж. П., Джон А., Солер Н. М., Скотт Н. Э., Годдард-Боргер ED (май 2020 г.). «Факторы трилистника разделяют лектиновую активность, которая определяет их роль в слизи». Nature Communications. 11 (1): 2265. Bibcode:2020NatCo..11.2265J. Дои:10.1038 / s41467-020-16223-7. ЧВК  7221086. PMID  32404934.
9. Фэн Г, Чжан И, Юань Х, Бай Р, Чжэн Дж, Чжан Дж, Сун М. (январь 2014 г.). «Метилирование ДНК фактора трилистника 1 (TFF1) связано с онкогенезом карциномы желудка». Мол Мед Реп. 9 (1): 109–117. Дои:10.3892 / ммр.2013.1772. PMID  24190027.

дальнейшее чтение

• Лангер G, Ягла В., Беренс-Бауманн В., Вальтер С., Хоффманн В. (2003). «Глазные TFF-пептиды: новые ассоциированные со слизью секреторные продукты бокаловидных клеток конъюнктивы». Adv. Exp. Med. Биол. Успехи экспериментальной медицины и биологии. 506 (Pt A): 313–6. Дои:10.1007/978-1-4615-0717-8_44. ISBN  978-1-4613-5208-2. PMID  12613926.
• Пигготт Н.Х., Генри Дж. А., May FE, Westley BR (1991). «Антипептидные антитела против регулируемого эстрогеном белка pNR-2 клеток рака груди человека и определение экспрессии pNR-2 в нормальных тканях с помощью иммуногистохимии». Дж. Патол. 163 (2): 95–104. Дои:10.1002 / path.1711630204. PMID  1707960. S2CID  2120939.
• Мори К., Фуджи Р., Кида Н., Такахаши Х., Окубо С., Фуджино М., Охта М., Хаяши К. (1990). «Полная первичная структура продукта человеческого эстроген-чувствительного гена (pS2)». J. Biochem. 107 (1): 73–6. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a123014. PMID  2185238.
• Tomasetto C, Rio MC, Gautier C, Wolf C, Hareuveni M, Chambon P, Lathe R (1990). «hSP, доменный гомолог белка pS2, коэкспрессируется с pS2 в желудке, но не в карциноме груди». EMBO J. 9 (2): 407–14. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1990.tb08125.x. ЧВК  551681. PMID  2303034.
• Такахаши Х., Кида Н., Фуджи Р., Танака К., Охта М., Мори К., Хаяши К. (1990). «Экспрессия гена pS2 в клетках рака желудка человека, происходящих из низкодифференцированной аденокарциномы». FEBS Lett. 261 (2): 283–6. Дои:10.1016 / 0014-5793 (90) 80572-Z. PMID  2311759. S2CID  37115994.
• Rio MC, Bellocq JP, Daniel JY, Tomasetto C, Lathe R, Chenard MP, Batzenschlager A, Chambon P (1988). «Белок pS2, связанный с раком груди: синтез и секреция нормальной слизистой оболочкой желудка». Наука. 241 (4866): 705–8. Bibcode:1988Научный ... 241..705R. Дои:10.1126 / science.3041593. PMID  3041593.
• Рио MC, Лепаж П., Димунш П., Ройч С., Шамбон П. (1989). «[Первичная структура человеческого белка pS2]». Comptes Rendus de l'Académie des Sciences, Série III. 307 (19): 825–31. PMID  3146413.
• Мори К., Фуджи Р., Кида Н., Охта М., Хаяши К. (1988). «Идентификация полипептида, секретируемого клетками рака груди человека (MCF-7), в качестве продукта гена, чувствительного к эстрогену человека (pS2)». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 155 (1): 366–72. Дои:10.1016 / S0006-291X (88) 81094-5. PMID  3261981.
• Jeltsch JM, Roberts M, Schatz C, Garnier JM, Brown AM, Chambon P (1987). "Структура человеческого эстроген-чувствительного гена pS2". Нуклеиновые кислоты Res. 15 (4): 1401–14. Дои:10.1093 / nar / 15.4.1401. ЧВК  340557. PMID  3822834.
• Прюдом Дж. Ф., Фридлански Ф., Ле Канфф М., Атжер М., Мерсье-Бодар С., Пишон М. Ф., Милгром Э. (1985). «Клонирование гена, экспрессируемого при раке груди человека и регулируемого эстрогеном в клетках MCF-7». ДНК. 4 (1): 11–21. Дои:10.1089 / dna.1985.4.11. PMID  3838275.
• Jakowlew SB, Breathnach R, Jeltsch JM, Masiakowski P, Chambon P (1984). «Последовательность мРНК pS2, индуцированная эстрогеном в клеточной линии рака молочной железы человека MCF-7». Нуклеиновые кислоты Res. 12 (6): 2861–78. Дои:10.1093 / nar / 12.6.2861. ЧВК  318711. PMID  6324130.
• Ханби А.М., Поулсом Р., Сингх С., Элиа Дж., Джеффри Р. Э., Райт Н. А. (1993). «Спазмолитический полипептид представляет собой главный антральный пептид: распределение трилистниковых пептидов человеческого спазмолитического полипептида и pS2 в желудке». Гастроэнтерология. 105 (4): 1110–6. Дои:10.1016 / 0016-5085 (93) 90956-д. PMID  8405856.
• Польшаков В.И., Френкиль Т.А., Уэстли Б., Чедвик М., Мэй Ф., Карр М.Д., Фини Дж. (1996). «Структурные исследования однодоменного трехлистного пептида pNR-2 / pS2 на основе ЯМР. Сходство со спазмолитическим пептидом свиньи и доказательства мономерной структуры». Евро. J. Biochem. 233 (3): 847–55. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1995.847_3.x. PMID  8521850.
• Сейб Т., Блин Н., Хильгерт К., Зайферт М., Тайзингер Б., Энгель М., Дули С., Занг К.Д., Велтер С. (1997). «Три гена трилистника человека TFF1, TFF2 и TFF3 расположены в области 55 т.п.н. на хромосоме 21q22.3». Геномика. 40 (1): 200–2. Дои:10.1006 / geno.1996.4511. PMID  9070946.
• Польшаков В.И., Уильямс М.А., Гаргаро А.Р., Френкил Т.А., Уэстли Б.Р., Чедвик М.П., ​​Мэй Ф.Э., Фини Дж. (1997). «Структура раствора высокого разрешения pNR-2 / pS2 человека: белок с одним мотивом трилистника». J. Mol. Биол. 267 (2): 418–32. Дои:10.1006 / jmbi.1997.0896. PMID  9096235.
• Член парламента Чедвика, Westley BR, May FE (1997). «Гомодимеризация и гетеро-олигомеризация однодоменного белка-трилистника pNR-2 / pS2 через цистеин 58». Biochem. J. 327 (1): 117–23. Дои:10.1042 / bj3270117. ЧВК  1218770. PMID  9355742.
• Чен Х, Линь Р.Дж., Се В., Вильпиц Д., Эванс Р.М. (1999). «Регулирование гормон-индуцированного гиперацетилирования гистонов и активации генов посредством ацетилирования ацетилазы». Ячейка. 98 (5): 675–86. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80054-9. PMID  10490106. S2CID  14697597.
• Ньютон Дж. Л., Аллен А., Уэстли Б. Р., Мэй FE (2000). «Пептид трилистника человека, TFF1, присутствует в различных молекулярных формах, которые тесно связаны со слизью в нормальном желудке». Кишечник. 46 (3): 312–20. Дои:10.1136 / гут.46.3.312. ЧВК  1727855. PMID  10673290.